iTOL 插件合集（共 5 个）

【iTOL官方示例注释数据集（example_data）安装教程】—— iTOL

■ 前置条件
   · 本目录是 iTOL（交互式进化树在线展示工具）官方提供的**辅助资源**：批量上传/下载脚本、示例注释数据集、R 辅助工具包等。
   · 网页版 iTOL 本身无需安装，浏览器打开 itol.embl.de 即可用。

■ 本资源是什么
   iTOL 官方随帮助文档提供的示例注释数据集，覆盖颜色条、热图、饼图、条形图、文字标签、连接线等各类注释模板文件，可用于学习与直接改写注释格式。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 为官方脚本/示例数据集；.whl 为 Python 包；.tar.gz 为 R 包。

■ 使用步骤
   1. 官方批量脚本：解压后在 Perl 环境里运行（Windows 可用 Strawberry Perl），按脚本内的说明填账号/文件名，即可批量上传或下载数据集。
   2. 示例数据集：解压后得到官方注释模板（txt/csv），照着格式改自己的数据，再在 iTOL 网页里拖拽上传。
   3. Python 包（itolapi）：pip install 本目录的 .whl 文件，然后用 Python 脚本调用 API 批量上传/导出。
   4. R 包（itol.toolkit）：R 里 install.packages("本包文件名.tar.gz", repos = NULL, type = "source") 安装后调用。

■ 注意事项
   · iTOL 是在线服务，树文件与注释数据都在网页端处理；本目录资源用于批量提交与自动化。
   · 上传公开树以外要注意数据隐私，涉及未发表数据的建议用私有树链接。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「iTOL官方示例注释数据集」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://itol.embl.de/
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【iTOL的R辅助工具包（itol.toolkit）安装教程】—— iTOL

■ 前置条件
   · 本目录是 iTOL（交互式进化树在线展示工具）官方提供的**辅助资源**：批量上传/下载脚本、示例注释数据集、R 辅助工具包等。
   · 网页版 iTOL 本身无需安装，浏览器打开 itol.embl.de 即可用。

■ 本资源是什么
   面向 iTOL 的 R 辅助工具包，帮助从表格批量生成各类 iTOL 注释文件（颜色条、热图、点图、条形图等），并可直接调用 iTOL API 提交任务。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：源码压缩包（.tar.gz）。
   · .zip 为官方脚本/示例数据集；.whl 为 Python 包；.tar.gz 为 R 包。

■ 使用步骤
   1. 官方批量脚本：解压后在 Perl 环境里运行（Windows 可用 Strawberry Perl），按脚本内的说明填账号/文件名，即可批量上传或下载数据集。
   2. 示例数据集：解压后得到官方注释模板（txt/csv），照着格式改自己的数据，再在 iTOL 网页里拖拽上传。
   3. Python 包（itolapi）：pip install 本目录的 .whl 文件，然后用 Python 脚本调用 API 批量上传/导出。
   4. R 包（itol.toolkit）：R 里 install.packages("本包文件名.tar.gz", repos = NULL, type = "source") 安装后调用。

■ 注意事项
   · iTOL 是在线服务，树文件与注释数据都在网页端处理；本目录资源用于批量提交与自动化。
   · 上传公开树以外要注意数据隐私，涉及未发表数据的建议用私有树链接。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「iTOL的R辅助工具包」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/TongZhou2017/itol.toolkit
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【iTOL官方批量上传下载脚本（iTOL_batch_scripts）安装教程】—— iTOL

■ 前置条件
   · 本目录是 iTOL（交互式进化树在线展示工具）官方提供的**辅助资源**：批量上传/下载脚本、示例注释数据集、R 辅助工具包等。
   · 网页版 iTOL 本身无需安装，浏览器打开 itol.embl.de 即可用。

■ 本资源是什么
   iTOL 官方提供的批量上传/下载脚本（Perl 编写），可在命令行一次性批量向 iTOL 提交树文件并下载导出图片，适合处理大量进化树。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 为官方脚本/示例数据集；.whl 为 Python 包；.tar.gz 为 R 包。

■ 使用步骤
   1. 官方批量脚本：解压后在 Perl 环境里运行（Windows 可用 Strawberry Perl），按脚本内的说明填账号/文件名，即可批量上传或下载数据集。
   2. 示例数据集：解压后得到官方注释模板（txt/csv），照着格式改自己的数据，再在 iTOL 网页里拖拽上传。
   3. Python 包（itolapi）：pip install 本目录的 .whl 文件，然后用 Python 脚本调用 API 批量上传/导出。
   4. R 包（itol.toolkit）：R 里 install.packages("本包文件名.tar.gz", repos = NULL, type = "source") 安装后调用。

■ 注意事项
   · iTOL 是在线服务，树文件与注释数据都在网页端处理；本目录资源用于批量提交与自动化。
   · 上传公开树以外要注意数据隐私，涉及未发表数据的建议用私有树链接。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「iTOL官方批量上传下载脚本」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://itol.embl.de/
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【iTOL的Python接口客户端（itolapi）安装教程】—— iTOL

■ 前置条件
   · 本目录是 iTOL（交互式进化树在线展示工具）官方提供的**辅助资源**：批量上传/下载脚本、示例注释数据集、R 辅助工具包等。
   · 网页版 iTOL 本身无需安装，浏览器打开 itol.embl.de 即可用。

■ 本资源是什么
   用于与 itol.embl.de 交互的 Python API 客户端，可脚本化上传树文件、导出指定格式图片、管理数据集，便于把 iTOL 集成进自动化分析流程。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Python 包（.whl）。
   · .zip 为官方脚本/示例数据集；.whl 为 Python 包；.tar.gz 为 R 包。

■ 使用步骤
   1. 官方批量脚本：解压后在 Perl 环境里运行（Windows 可用 Strawberry Perl），按脚本内的说明填账号/文件名，即可批量上传或下载数据集。
   2. 示例数据集：解压后得到官方注释模板（txt/csv），照着格式改自己的数据，再在 iTOL 网页里拖拽上传。
   3. Python 包（itolapi）：pip install 本目录的 .whl 文件，然后用 Python 脚本调用 API 批量上传/导出。
   4. R 包（itol.toolkit）：R 里 install.packages("本包文件名.tar.gz", repos = NULL, type = "source") 安装后调用。

■ 注意事项
   · iTOL 是在线服务，树文件与注释数据都在网页端处理；本目录资源用于批量提交与自动化。
   · 上传公开树以外要注意数据隐私，涉及未发表数据的建议用私有树链接。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「iTOL的Python接口客户端」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/albertyw/itolapi
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【iTOL注释文件生成工具（table2itol）安装教程】—— iTOL

■ 前置条件
   · 本目录是 iTOL（交互式进化树在线展示工具）官方提供的**辅助资源**：批量上传/下载脚本、示例注释数据集、R 辅助工具包等。
   · 网页版 iTOL 本身无需安装，浏览器打开 itol.embl.de 即可用。

■ 本资源是什么
   从电子表格或 CSV 表格自动生成 iTOL 注释文件的脚本工具，支持颜色条、热图、条带等多种注释类型，免去手工编写注释文件。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 为官方脚本/示例数据集；.whl 为 Python 包；.tar.gz 为 R 包。

■ 使用步骤
   1. 官方批量脚本：解压后在 Perl 环境里运行（Windows 可用 Strawberry Perl），按脚本内的说明填账号/文件名，即可批量上传或下载数据集。
   2. 示例数据集：解压后得到官方注释模板（txt/csv），照着格式改自己的数据，再在 iTOL 网页里拖拽上传。
   3. Python 包（itolapi）：pip install 本目录的 .whl 文件，然后用 Python 脚本调用 API 批量上传/导出。
   4. R 包（itol.toolkit）：R 里 install.packages("本包文件名.tar.gz", repos = NULL, type = "source") 安装后调用。

■ 注意事项
   · iTOL 是在线服务，树文件与注释数据都在网页端处理；本目录资源用于批量提交与自动化。
   · 上传公开树以外要注意数据隐私，涉及未发表数据的建议用私有树链接。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「iTOL注释文件生成工具」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/mgoeker/table2itol
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。