IGV 插件合集(共 36 个)
基因组浏览器(官方第三方扩展) | 分类:基因测序与单细胞 | 每个插件都附中文说明与安装教程,下载走百度网盘 / 夸克网盘。
插件清单
bgzip · BGZF 压缩工具
util | 0.06 MB | 1 个文件
IGV 团队提供的命令行压缩工具,把普通文件按块压制成 BGZF 格式并生成索引,使基因组数据可被随机定位高效读取。
包含文件:bgzip-master.zip
安装教程(点击展开)
【BGZF 压缩工具(bgzip)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
详见插件官方说明。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/bgzip
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「BGZF 压缩工具」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/bgzip
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。circular-view · 环形基因组视图
util | 0.04 MB | 1 个文件
基于 JBrowse 环形视图组件封装的类,可在环形坐标系中展示全基因组范围的变异与注释,方便纵览整体分布。
包含文件:circular-view-main.zip
安装教程(点击展开)
【环形基因组视图(circular-view)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
基于 JBrowse 环形视图组件封装的类,可在环形坐标系中展示全基因组范围的变异与注释,方便纵览整体分布。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/circular-view
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「环形基因组视图」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/circular-view
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。circular-view-app · 环形视图演示应用
util | 1.2 MB | 1 个文件
环形基因组视图的演示应用,启动后可载入示例数据,在环形布局中浏览染色体层面的结构变异与注释信息。
包含文件:circular-view-app-master.zip
安装教程(点击展开)
【环形视图演示应用(circular-view-app)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
环形基因组视图的演示应用,启动后可载入示例数据,在环形布局中浏览染色体层面的结构变异与注释信息。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/circular-view-app
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「环形视图演示应用」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/circular-view-app
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。cursor · 光标指示组件
util | 0.58 MB | 1 个文件
IGV 界面中的光标与位置指示组件,用于在基因组轨迹上标记当前位点,并联动显示对应的坐标与数值。
包含文件:cursor-Cursor.zip
安装教程(点击展开)
【光标指示组件(cursor)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
IGV 界面中的光标与位置指示组件,用于在基因组轨迹上标记当前位点,并联动显示对应的坐标与数值。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/cursor
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「光标指示组件」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/cursor
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。d4server · D4 数据服务原型
util | 0.01 MB | 1 个文件
用于基因组数据分发的 D4 服务端原型,探索按片段请求和高效传输远程测序数据的方式,减少整体下载。
包含文件:d4server-main.zip
安装教程(点击展开)
【D4 数据服务原型(d4server)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
用于基因组数据分发的 D4 服务端原型,探索按片段请求和高效传输远程测序数据的方式,减少整体下载。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/d4server
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「D4 数据服务原型」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/d4server
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。data-modal · 数据资源选择器
util | 0.02 MB | 1 个文件
基于 DataTables 的数据资源浏览器与选择器,供 IGV 应用从 ENCODE 等公共数据源检索并挑选需加载的文件。
包含文件:data-modal-master.zip
安装教程(点击展开)
【数据资源选择器(data-modal)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
基于 DataTables 的数据资源浏览器与选择器,供 IGV 应用从 ENCODE 等公共数据源检索并挑选需加载的文件。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/data-modal
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「数据资源选择器」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/data-modal
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。google-utils · Google 服务工具集
util | 0.01 MB | 1 个文件
访问 Google 云端服务的辅助工具集,为 IGV 相关项目封装登录鉴权、云存储读写与数据获取等常用操作。
包含文件:google-utils-main.zip
安装教程(点击展开)
【Google 服务工具集(google-utils)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
访问 Google 云端服务的辅助工具集,为 IGV 相关项目封装登录鉴权、云存储读写与数据获取等常用操作。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/google-utils
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Google 服务工具集」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/google-utils
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。igv · 整合基因组浏览器
util | 69.27 MB | 1 个文件
整合基因组浏览器桌面版,是项目的核心应用,可快速、高效、可扩展地可视化测序数据、比对结果与功能注释。
包含文件:igv-main.zip
安装教程(点击展开)
【整合基因组浏览器(igv)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
整合基因组浏览器桌面版,是项目的核心应用,可快速、高效、可扩展地可视化测序数据、比对结果与功能注释。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「整合基因组浏览器」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。igv-data · 基因组配置文件集
util | 636.21 MB | 1 个文件
IGV 使用的基因组配置文件与配套元数据,定义各物种参考基因组的序列文件、注释来源与索引地址等信息。
包含文件:igv-data-main.zip
安装教程(点击展开)
【基因组配置文件集(igv-data)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
IGV 使用的基因组配置文件与配套元数据,定义各物种参考基因组的序列文件、注释来源与索引地址等信息。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-data
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「基因组配置文件集」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-data
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。igv-docs · IGV 文档站点
util | 19.65 MB | 1 个文件
基于 Markdown 构建的文档网站,介绍 IGV 桌面应用的下载安装、界面操作与各种数据格式的加载方法。
包含文件:igv-docs-main.zip
安装教程(点击展开)
【IGV 文档站点(igv-docs)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
基于 Markdown 构建的文档网站,介绍 IGV 桌面应用的下载安装、界面操作与各种数据格式的加载方法。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-docs
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「IGV 文档站点」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-docs
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。igv-electron · Electron 桌面壳
util | 0.42 MB | 1 个文件
用 Electron 将 igv.js 封装为跨平台桌面程序的壳工程,让网页版可视化具备访问本地文件与系统菜单的能力。
包含文件:igv-electron-main.zip
安装教程(点击展开)
【Electron 桌面壳(igv-electron)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
用 Electron 将 igv.js 封装为跨平台桌面程序的壳工程,让网页版可视化具备访问本地文件与系统菜单的能力。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-electron
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Electron 桌面壳」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-electron
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。igv-ipad · iPad 版 IGV
util | 3.7 MB | 1 个文件
面向 iPad 的 IGV 应用,支持手指缩放与滑动浏览,在平板上查看基因组数据、比对结果和注释轨迹。
包含文件:igv-ipad-master.zip
安装教程(点击展开)
【iPad 版 IGV(igv-ipad)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
面向 iPad 的 IGV 应用,支持手指缩放与滑动浏览,在平板上查看基因组数据、比对结果和注释轨迹。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-ipad
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「iPad 版 IGV」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-ipad
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。igv-juicebox · Juicebox 联动原型
util | 0.02 MB | 1 个文件
探索 igv.js 与 juicebox.js 相互调用的原型,试验基因组线性视图与 Hi-C 接触矩阵之间的联动浏览。
包含文件:igv-juicebox-main.zip
安装教程(点击展开)
【Juicebox 联动原型(igv-juicebox)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
探索 igv.js 与 juicebox.js 相互调用的原型,试验基因组线性视图与 Hi-C 接触矩阵之间的联动浏览。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-juicebox
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Juicebox 联动原型」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-juicebox
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。igv-mcp · IGV 智能体控制服务
util | 0.29 MB | 1 个文件
遵循模型上下文协议(MCP)的服务端,让 AI 助手可用标准接口控制 IGV 完成数据加载、区域跳转与截图等操作。
包含文件:igv-mcp-main.zip
安装教程(点击展开)
【IGV 智能体控制服务(igv-mcp)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
遵循模型上下文协议(MCP)的服务端,让 AI 助手可用标准接口控制 IGV 完成数据加载、区域跳转与截图等操作。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-mcp
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「IGV 智能体控制服务」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-mcp
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。igv-notebook · Notebook 嵌入模块
util | 0.49 MB | 1 个文件
用于在 IPython / Jupyter 笔记本中嵌入 igv.js 的模块,可在单元格内直接渲染可交互的基因组视图。
包含文件:igv-notebook-main.zip
安装教程(点击展开)
【Notebook 嵌入模块(igv-notebook)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
用于在 IPython / Jupyter 笔记本中嵌入 igv.js 的模块,可在单元格内直接渲染可交互的基因组视图。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-notebook
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Notebook 嵌入模块」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-notebook
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。igv-reports · IGV 报告生成
util | 24.06 MB | 1 个文件
生成自包含网页的可视化报告工具,把变异与读段数据嵌入单个 HTML 页面便于分享。
包含文件:igv-reports-master.zip
安装教程(点击展开)
【IGV 报告生成(igv-reports)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
生成自包含网页的可视化报告工具,把变异与读段数据嵌入单个 HTML 页面便于分享。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-reports
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「IGV 报告生成」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-reports
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。igv-ui · igv.js 界面组件
util | 0.08 MB | 1 个文件
为 igv.js 及其相关项目提供通用界面组件,统一按钮、菜单、弹窗等交互元素的外观与行为,便于复用到不同项目。
包含文件:igv-ui-master.zip
安装教程(点击展开)
【igv.js 界面组件(igv-ui)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
为 igv.js 及其相关项目提供通用界面组件,统一按钮、菜单、弹窗等交互元素的外观与行为,便于复用到不同项目。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-ui
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「igv.js 界面组件」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-ui
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。igv-utils · 通用工具函数库
util | 0.29 MB | 1 个文件
IGV 各项目共用的工具函数集合,封装字符串处理、颜色换算、几何计算等常用逻辑,减少各仓库重复实现。
包含文件:igv-utils-master.zip
安装教程(点击展开)
【通用工具函数库(igv-utils)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
IGV 各项目共用的工具函数集合,封装字符串处理、颜色换算、几何计算等常用逻辑,减少各仓库重复实现。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-utils
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「通用工具函数库」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-utils
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。igv-webapp · IGV 网页应用
util | 4.68 MB | 1 个文件
IGV 的网页版应用,在浏览器中加载本地或远程的基因组数据,无需安装客户端即可完成交互式可视化浏览。
包含文件:igv-webapp-master.zip
安装教程(点击展开)
【IGV 网页应用(igv-webapp)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
IGV 的网页版应用,在浏览器中加载本地或远程的基因组数据,无需安装客户端即可完成交互式可视化浏览。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-webapp
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「IGV 网页应用」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-webapp
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。igv-webapp-docs · 网页版文档
util | 0.96 MB | 1 个文件
IGV 网页应用的文档站点,说明数据加载方式、配置参数含义以及部署网页版浏览器的具体步骤。
包含文件:igv-webapp-docs-main.zip
安装教程(点击展开)
【网页版文档(igv-webapp-docs)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
IGV 网页应用的文档站点,说明数据加载方式、配置参数含义以及部署网页版浏览器的具体步骤。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-webapp-docs
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「网页版文档」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-webapp-docs
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。igv-widgets · 界面小部件库
util | 0.15 MB | 1 个文件
供 igvteam 各应用复用的界面小部件集合,提供滑块、弹窗、色板等可组合的交互控件,统一视觉风格。
包含文件:igv-widgets-master.zip
安装教程(点击展开)
【界面小部件库(igv-widgets)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
供 igvteam 各应用复用的界面小部件集合,提供滑块、弹窗、色板等可组合的交互控件,统一视觉风格。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-widgets
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「界面小部件库」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv-widgets
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。igv.js · 网页基因组视图库
util | 7.02 MB | 1 个文件
基于整合基因组浏览器开发的嵌入式基因组可视化组件,引入一段脚本即可在网页中展示测序数据与注释轨迹。
包含文件:igv.js-master.zip
安装教程(点击展开)
【网页基因组视图库(igv.js)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
基于整合基因组浏览器开发的嵌入式基因组可视化组件,引入一段脚本即可在网页中展示测序数据与注释轨迹。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv.js
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「网页基因组视图库」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv.js
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。igv.js-docs · igv.js 文档
util | 0.8 MB | 1 个文件
igv.js 的官方文档,介绍其 API 接口、配置项、支持的数据格式以及在前端项目中的集成与自定义方式。
包含文件:igv.js-docs-main.zip
安装教程(点击展开)
【igv.js 文档(igv.js-docs)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
igv.js 的官方文档,介绍其 API 接口、配置项、支持的数据格式以及在前端项目中的集成与自定义方式。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv.js-docs
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「igv.js 文档」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv.js-docs
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。igv.js-flask · Flask 集成示例
util | 0.1 MB | 1 个文件
演示如何在 Flask 项目中集成 igv.js 的示例工程,包含服务端路由、静态资源托管与前端视图的配合。
包含文件:igv.js-flask-master.zip
安装教程(点击展开)
【Flask 集成示例(igv.js-flask)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
演示如何在 Flask 项目中集成 igv.js 的示例工程,包含服务端路由、静态资源托管与前端视图的配合。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv.js-flask
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Flask 集成示例」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv.js-flask
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。igv.js-react · React 集成示例
util | 0.15 MB | 1 个文件
演示在 React 应用中使用 igv.js 的示例工程,展示组件挂载与卸载时的初始化、更新和资源销毁处理。
包含文件:igv.js-react-main.zip
安装教程(点击展开)
【React 集成示例(igv.js-react)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
演示在 React 应用中使用 igv.js 的示例工程,展示组件挂载与卸载时的初始化、更新和资源销毁处理。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv.js-react
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「React 集成示例」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igv.js-react
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。igvweb-mcp · 网页版 IGV 控制服务
util | 0.19 MB | 1 个文件
面向 IGV 网页版的 MCP 服务端,使 AI 助手可通过标准协议远程控制浏览器中的基因组视图并读取当前状态。
包含文件:igvweb-mcp-main.zip
安装教程(点击展开)
【网页版 IGV 控制服务(igvweb-mcp)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
面向 IGV 网页版的 MCP 服务端,使 AI 助手可通过标准协议远程控制浏览器中的基因组视图并读取当前状态。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igvweb-mcp
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「网页版 IGV 控制服务」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/igvweb-mcp
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。infinite-table · 无限滚动表格
util | 0.06 MB | 1 个文件
支持海量数据行的虚拟滚动表格组件,只渲染可见区域以保持流畅,用于浏览大型变异或注释结果列表。
包含文件:infinite-table-main.zip
安装教程(点击展开)
【无限滚动表格(infinite-table)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
支持海量数据行的虚拟滚动表格组件,只渲染可见区域以保持流畅,用于浏览大型变异或注释结果列表。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/infinite-table
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「无限滚动表格」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/infinite-table
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。juicebox-notebook · Juicebox 笔记本模块
util | 0.17 MB | 1 个文件
在 Jupyter 笔记本中嵌入 juicebox.js 的模块,便于交互查看 Hi-C 接触矩阵与三维基因组结构数据。
包含文件:juicebox-notebook-main.zip
安装教程(点击展开)
【Juicebox 笔记本模块(juicebox-notebook)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
在 Jupyter 笔记本中嵌入 juicebox.js 的模块,便于交互查看 Hi-C 接触矩阵与三维基因组结构数据。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/juicebox-notebook
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Juicebox 笔记本模块」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/juicebox-notebook
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。pyTwobit · TwoBit 序列读取库
util | 0.01 MB | 1 个文件
快速读取本地与远程 2bit 参考序列的 Python 库,可随机访问指定区段的碱基,无需把整条序列载入内存。
包含文件:pyTwobit-main.zip
安装教程(点击展开)
【TwoBit 序列读取库(pyTwobit)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
快速读取本地与远程 2bit 参考序列的 Python 库,可随机访问指定区段的碱基,无需把整条序列载入内存。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/pyTwobit
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「TwoBit 序列读取库」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/pyTwobit
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。sandbox · 沙箱实验模块
util | 0 MB | 1 个文件
试验沙盒模块,提供独立的接口试验环境,便于测试自定义轨道与渲染效果。
包含文件:sandbox-master.zip
安装教程(点击展开)
【沙箱实验模块(sandbox)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
试验沙盒模块,提供独立的接口试验环境,便于测试自定义轨道与渲染效果。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/sandbox
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「沙箱实验模块」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/sandbox
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。shoebox · 数据整理工具
util | 0.25 MB | 1 个文件
用于整理与存放基因组相关数据集和文件的工具项目,方便在 IGV 各组件之间取用共享的资源与示例数据。
包含文件:shoebox-main.zip
安装教程(点击展开)
【数据整理工具(shoebox)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
用于整理与存放基因组相关数据集和文件的工具项目,方便在 IGV 各组件之间取用共享的资源与示例数据。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/shoebox
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「数据整理工具」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/shoebox
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。spacewalk · 三维染色质追踪视图
util | 90.38 MB | 1 个文件
以三维方式显示并交互浏览超分辨染色质追踪数据的应用,内置 igv.js 与 juicebox.js 便于直观对照观察结构。
包含文件:spacewalk-master.zip
安装教程(点击展开)
【三维染色质追踪视图(spacewalk)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
以三维方式显示并交互浏览超分辨染色质追踪数据的应用,内置 igv.js 与 juicebox.js 便于直观对照观察结构。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/spacewalk
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「三维染色质追踪视图」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/spacewalk
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。swcproject · SpaceWalk 数据转换工具
util | 5.07 MB | 1 个文件
SpaceWalk 的命令行工具,把旧版点云与集合格式文件转换为 .sw 格式,供三维染色质视图直接加载使用。
包含文件:swcproject-master.zip
安装教程(点击展开)
【SpaceWalk 数据转换工具(swcproject)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
SpaceWalk 的命令行工具,把旧版点云与集合格式文件转换为 .sw 格式,供三维染色质视图直接加载使用。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/swcproject
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「SpaceWalk 数据转换工具」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/swcproject
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。test-utils · 测试工具集
util | 0.01 MB | 1 个文件
IGV 各项目共用的测试辅助工具,提供模拟浏览器环境、示例数据和常用断言,简化单元测试与集成测试编写。
包含文件:test-utils-master.zip
安装教程(点击展开)
【测试工具集(test-utils)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
IGV 各项目共用的测试辅助工具,提供模拟浏览器环境、示例数据和常用断言,简化单元测试与集成测试编写。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/test-utils
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「测试工具集」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/test-utils
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。ucsc_dev · UCSC 对接实验
util | 0.5 MB | 1 个文件
探索与 UCSC 基因组浏览器数据格式和接口对接的实验性项目,用于比较两边资源并复用其参考基因组数据。
包含文件:ucsc_dev-main.zip
安装教程(点击展开)
【UCSC 对接实验(ucsc_dev)安装教程】—— IGV
■ 前置条件
· 已安装 IGV 桌面版(官方下载:https://igv.org/doc/desktop/,需要 Java 11 及以上)。
■ 本扩展是什么
探索与 UCSC 基因组浏览器数据格式和接口对接的实验性项目,用于比较两边资源并复用其参考基因组数据。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .jar 是 IGV 扩展包;.zip 是配套源码或数据。
■ 安装步骤
1. 解压本目录的 .zip(若有)。
2. 把 .jar 文件复制到 IGV 安装目录下的 ext 文件夹;
也可以在 IGV 里用菜单 File → 运行插件/加载扩展 直接指定该 jar。
3. 重启 IGV。
4. 该扩展引入的菜单项或轨道类型会出现在界面上。
■ 验证是否装好
· IGV 启动后菜单里能看到该扩展提供的功能。
■ 常见问题
· 启动不报错但功能没出现:确认 jar 放进了 ext 目录并且 IGV 是完整重启(不是关闭窗口)。
· 提示 Java 版本不匹配:把 IGV 升级到最新版。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/ucsc_dev
官方开源发布,遵循其开源许可,仅作学习研究用途。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「UCSC 对接实验」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/igvteam/ucsc_dev
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。同分类的其他软件