WSInfer 插件合集(共 3 个)
全片图像快速推理流水线(官方模型与 QuPath 扩展) | 分类:病理图片处理 | 每个插件都附中文说明与安装教程,下载走百度网盘 / 夸克网盘。
插件清单
qupath-extension-wsinfer · WSInfer 全片AI推理
ai | 0.1 MB | 1 个文件
WSInfer 全片 AI 推理对接,可批量运行全切片模型
包含文件:qupath-extension-wsinfer-main.zip
安装教程(点击展开)
【病理切片深度学习推理扩展(qupath-extension-wsinfer)安装教程】—— WSInfer
■ 前置条件
· Python 3.9 及以上;用 QuPath 扩展需要 QuPath 0.4 及以上。
■ 本扩展是什么
QuPath 的扩展插件,调用 WSInfer 模型对全片病理图像进行斑块分类推理,可在软件界面内直接完成深度学习分析。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方仓库源码包;QuPath 扩展为放入 extensions 目录即可用的包。
■ 安装步骤
1. Python:pip install wsinfer
2. 下模型:wsinfer download 模型名(可用 wsinfer-zoo 查看可用模型注册表)。
3. 跑推理:wsinfer run --model 模型名 --wsi 切片.svs --outdir 输出目录
4. QuPath 扩展:把 qupath-extension-wsinfer 的 .jar 复制到
C:/Users/你的用户名/AppData/Roaming/QuPath/extensions/
重启 QuPath,Extensions 菜单里出现 WSInfer。
■ 验证是否装好
· 命令行 wsinfer --help 有输出;QuPath 扩展列表里能看到 WSInfer。
■ 常见问题
· 模型下载失败:国内网络可用本目录的模型包手动放到 wsinfer 的模型缓存目录。
· 显存不足:把 --batch-size 调小或走 CPU 模式。
■ 来源与版权
https://github.com/qupath/qupath-extension-wsinfer
开源/免费发布(Apache-2.0),仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「病理切片深度学习推理扩展」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/qupath/qupath-extension-wsinfer
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。wsinfer · 病理全片斑块分类流水线
ai | 1.84 MB | 1 个文件
基于斑块的全片病理图像分类推理流水线,运行速度快,可批量处理数字病理切片并输出分类结果。
包含文件:wsinfer-main.zip
安装教程(点击展开)
【病理全片斑块分类流水线(wsinfer)安装教程】—— WSInfer
■ 前置条件
· Python 3.9 及以上;用 QuPath 扩展需要 QuPath 0.4 及以上。
■ 本扩展是什么
基于斑块的全片病理图像分类推理流水线,运行速度快,可批量处理数字病理切片并输出分类结果。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方仓库源码包;QuPath 扩展为放入 extensions 目录即可用的包。
■ 安装步骤
1. Python:pip install wsinfer
2. 下模型:wsinfer download 模型名(可用 wsinfer-zoo 查看可用模型注册表)。
3. 跑推理:wsinfer run --model 模型名 --wsi 切片.svs --outdir 输出目录
4. QuPath 扩展:把 qupath-extension-wsinfer 的 .jar 复制到
C:/Users/你的用户名/AppData/Roaming/QuPath/extensions/
重启 QuPath,Extensions 菜单里出现 WSInfer。
■ 验证是否装好
· 命令行 wsinfer --help 有输出;QuPath 扩展列表里能看到 WSInfer。
■ 常见问题
· 模型下载失败:国内网络可用本目录的模型包手动放到 wsinfer 的模型缓存目录。
· 显存不足:把 --batch-size 调小或走 CPU 模式。
■ 来源与版权
https://github.com/SBU-BMI/wsinfer
开源/免费发布(Apache-2.0),仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「病理全片斑块分类流水线」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/SBU-BMI/wsinfer
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。wsinfer-zoo · 病理推理模型库
ai | 0.05 MB | 1 个文件
WSInfer 的模型仓库,汇集多种预训练病理图像分类模型,方便用户下载、管理并直接用于全片推理。
包含文件:wsinfer-zoo-main.zip
安装教程(点击展开)
【病理推理模型库(wsinfer-zoo)安装教程】—— WSInfer
■ 前置条件
· Python 3.9 及以上;用 QuPath 扩展需要 QuPath 0.4 及以上。
■ 本扩展是什么
WSInfer 的模型仓库,汇集多种预训练病理图像分类模型,方便用户下载、管理并直接用于全片推理。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方仓库源码包;QuPath 扩展为放入 extensions 目录即可用的包。
■ 安装步骤
1. Python:pip install wsinfer
2. 下模型:wsinfer download 模型名(可用 wsinfer-zoo 查看可用模型注册表)。
3. 跑推理:wsinfer run --model 模型名 --wsi 切片.svs --outdir 输出目录
4. QuPath 扩展:把 qupath-extension-wsinfer 的 .jar 复制到
C:/Users/你的用户名/AppData/Roaming/QuPath/extensions/
重启 QuPath,Extensions 菜单里出现 WSInfer。
■ 验证是否装好
· 命令行 wsinfer --help 有输出;QuPath 扩展列表里能看到 WSInfer。
■ 常见问题
· 模型下载失败:国内网络可用本目录的模型包手动放到 wsinfer 的模型缓存目录。
· 显存不足:把 --batch-size 调小或走 CPU 模式。
■ 来源与版权
https://github.com/SBU-BMI/wsinfer-zoo
开源/免费发布(Apache-2.0),仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「病理推理模型库」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/SBU-BMI/wsinfer-zoo
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。同分类的其他软件