OMERO 插件合集（16 个）· 安装教程与网盘下载

显微影像管理平台的官方脚本插件｜分类：病理图片处理｜每个插件都附中文说明与安装教程，下载走百度网盘 / 夸克网盘。

插件清单

Movie_Figure · 影片图版

annot ｜ 0.03 MB ｜ 1 个文件

把多张时间序列图像排版成带时间标注的图版，并导出为影片或分帧图片，适合在论文插图中展示动态过程的若干代表性时刻。

包含文件：Movie_Figure.py

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1-3R71HuXai79HCE__bYoyg?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/10aa08e911f9

安装教程（点击展开）

【影片图版（Movie_Figure）安装教程】—— OMERO

■ 前置条件
   · 有 OMERO.server 或 OMERO.web / OMERO.insight 的部署环境。

■ 本插件是什么
   把多张时间序列图像排版成带时间标注的图版，并导出为影片或分帧图片，适合在论文插图中展示动态过程的若干代表性时刻。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Python 脚本（.py）。
   · .jar/.py 为服务端插件或客户端脚本。

■ 安装步骤
   1. 服务端插件：把 .jar 放到 OMERO.server 的 lib/ 目录下的 plugins 路径，重启服务：
      omero admin restart
   2. 客户端脚本：放到 OMERO.insight 的 scripts 目录，重启客户端。
   3. OMERO.web 插件：按插件说明在 omero web 的配置里启用并重启 web。
   4. 重启后在对应菜单里即可看到该功能。

■ 常见问题
   · 重启后功能没出现：看 OMERO 的 logs/Blitz-0.log 有没有该插件的加载报错。
   · 权限不足：有的插件要求管理员账号才能启用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「影片图版」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/ome/omero-scripts/blob/master/omero/figure_scripts/Movie_Figure.py
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Populate_ROI · 批量生成 ROI

annot ｜ 0 MB ｜ 1 个文件

按 CSV 或文本文件中的坐标与形状批量创建 ROI 并挂到对应图像上，省去手工逐个勾画，适合大批量标注结果导入。

包含文件：Populate_ROI.py

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1696OiU9iXFgfSbicj1yp4Q?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/e7f49437f853

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【批量生成 ROI（Populate_ROI）安装教程】—— OMERO

■ 前置条件
   · 有 OMERO.server 或 OMERO.web / OMERO.insight 的部署环境。

■ 本插件是什么
   按 CSV 或文本文件中的坐标与形状批量创建 ROI 并挂到对应图像上，省去手工逐个勾画，适合大批量标注结果导入。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Python 脚本（.py）。
   · .jar/.py 为服务端插件或客户端脚本。

■ 安装步骤
   1. 服务端插件：把 .jar 放到 OMERO.server 的 lib/ 目录下的 plugins 路径，重启服务：
      omero admin restart
   2. 客户端脚本：放到 OMERO.insight 的 scripts 目录，重启客户端。
   3. OMERO.web 插件：按插件说明在 omero web 的配置里启用并重启 web。
   4. 重启后在对应菜单里即可看到该功能。

■ 常见问题
   · 重启后功能没出现：看 OMERO 的 logs/Blitz-0.log 有没有该插件的加载报错。
   · 权限不足：有的插件要求管理员账号才能启用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「批量生成 ROI」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/ome/omero-scripts/blob/master/omero/import_scripts/Populate_ROI.py
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Thumbnail_Figure · 缩略图图版

annot ｜ 0.02 MB ｜ 1 个文件

把多个图像或数据集以缩略图网格形式排版导出，带名称标注，适合快速浏览大批量切片概览，或制作目录式插图。

包含文件：Thumbnail_Figure.py

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1UtOM6M7KYtqQXE94W_UYaw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/487be2618482

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【缩略图图版（Thumbnail_Figure）安装教程】—— OMERO

■ 前置条件
   · 有 OMERO.server 或 OMERO.web / OMERO.insight 的部署环境。

■ 本插件是什么
   把多个图像或数据集以缩略图网格形式排版导出，带名称标注，适合快速浏览大批量切片概览，或制作目录式插图。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Python 脚本（.py）。
   · .jar/.py 为服务端插件或客户端脚本。

■ 安装步骤
   1. 服务端插件：把 .jar 放到 OMERO.server 的 lib/ 目录下的 plugins 路径，重启服务：
      omero admin restart
   2. 客户端脚本：放到 OMERO.insight 的 scripts 目录，重启客户端。
   3. OMERO.web 插件：按插件说明在 omero web 的配置里启用并重启 web。
   4. 重启后在对应菜单里即可看到该功能。

■ 常见问题
   · 重启后功能没出现：看 OMERO 的 logs/Blitz-0.log 有没有该插件的加载报错。
   · 权限不足：有的插件要求管理员账号才能启用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「缩略图图版」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/ome/omero-scripts/blob/master/omero/figure_scripts/Thumbnail_Figure.py
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Dataset_To_Plate · 数据集转板格式

io ｜ 0.01 MB ｜ 1 个文件

将普通数据集中的图像按行列顺序整理为 HCS 高内涵筛选板格式，使平铺拍摄的孔板图像具备孔位坐标，便于按板视图浏览和分析。

包含文件：Dataset_To_Plate.py

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1ubUEqoVABG1aYJrRcDJGOg?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/a6648fee5ad3

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【数据集转板格式（Dataset_To_Plate）安装教程】—— OMERO

■ 前置条件
   · 有 OMERO.server 或 OMERO.web / OMERO.insight 的部署环境。

■ 本插件是什么
   将普通数据集中的图像按行列顺序整理为 HCS 高内涵筛选板格式，使平铺拍摄的孔板图像具备孔位坐标，便于按板视图浏览和分析。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Python 脚本（.py）。
   · .jar/.py 为服务端插件或客户端脚本。

■ 安装步骤
   1. 服务端插件：把 .jar 放到 OMERO.server 的 lib/ 目录下的 plugins 路径，重启服务：
      omero admin restart
   2. 客户端脚本：放到 OMERO.insight 的 scripts 目录，重启客户端。
   3. OMERO.web 插件：按插件说明在 omero web 的配置里启用并重启 web。
   4. 重启后在对应菜单里即可看到该功能。

■ 常见问题
   · 重启后功能没出现：看 OMERO 的 logs/Blitz-0.log 有没有该插件的加载报错。
   · 权限不足：有的插件要求管理员账号才能启用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「数据集转板格式」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/ome/omero-scripts/blob/master/omero/util_scripts/Dataset_To_Plate.py
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Make_Movie · 制作影片

io ｜ 0.03 MB ｜ 1 个文件

将时间序列或 Z 轴序列图像按设定帧率与缩放比例渲染成视频文件，可叠加通道颜色和标记，便于汇报与教学演示动态过程。

包含文件：Make_Movie.py

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/17bMHbuJZc2vTL0K8TFIvWA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/eeae57e31d90

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【制作影片（Make_Movie）安装教程】—— OMERO

■ 前置条件
   · 有 OMERO.server 或 OMERO.web / OMERO.insight 的部署环境。

■ 本插件是什么
   将时间序列或 Z 轴序列图像按设定帧率与缩放比例渲染成视频文件，可叠加通道颜色和标记，便于汇报与教学演示动态过程。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Python 脚本（.py）。
   · .jar/.py 为服务端插件或客户端脚本。

■ 安装步骤
   1. 服务端插件：把 .jar 放到 OMERO.server 的 lib/ 目录下的 plugins 路径，重启服务：
      omero admin restart
   2. 客户端脚本：放到 OMERO.insight 的 scripts 目录，重启客户端。
   3. OMERO.web 插件：按插件说明在 omero web 的配置里启用并重启 web。
   4. 重启后在对应菜单里即可看到该功能。

■ 常见问题
   · 重启后功能没出现：看 OMERO 的 logs/Blitz-0.log 有没有该插件的加载报错。
   · 权限不足：有的插件要求管理员账号才能启用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「制作影片」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/ome/omero-scripts/blob/master/omero/export_scripts/Make_Movie.py
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Batch_Image_Export · 批量图像导出

measure ｜ 0.02 MB ｜ 1 个文件

按数据集、图像或标签批量导出原始像素数据、OME-TIFF 或指定格式文件，便于本地做后续定量分析或归档备份。

包含文件：Batch_Image_Export.py

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1LTQSQZpQ0zMX5vQM_EArWQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/483ad6b76109

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【批量图像导出（Batch_Image_Export）安装教程】—— OMERO

■ 前置条件
   · 有 OMERO.server 或 OMERO.web / OMERO.insight 的部署环境。

■ 本插件是什么
   按数据集、图像或标签批量导出原始像素数据、OME-TIFF 或指定格式文件，便于本地做后续定量分析或归档备份。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Python 脚本（.py）。
   · .jar/.py 为服务端插件或客户端脚本。

■ 安装步骤
   1. 服务端插件：把 .jar 放到 OMERO.server 的 lib/ 目录下的 plugins 路径，重启服务：
      omero admin restart
   2. 客户端脚本：放到 OMERO.insight 的 scripts 目录，重启客户端。
   3. OMERO.web 插件：按插件说明在 omero web 的配置里启用并重启 web。
   4. 重启后在对应菜单里即可看到该功能。

■ 常见问题
   · 重启后功能没出现：看 OMERO 的 logs/Blitz-0.log 有没有该插件的加载报错。
   · 权限不足：有的插件要求管理员账号才能启用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「批量图像导出」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/ome/omero-scripts/blob/master/omero/export_scripts/Batch_Image_Export.py
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Images_From_ROIs · ROI 裁剪成图

measure ｜ 0.02 MB ｜ 1 个文件

根据已有 ROI 的形状与坐标，从原始图像中批量裁剪出子图像并保存为新图像，常用于把标注区域单独取出做形态测量或存档。

包含文件：Images_From_ROIs.py

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1qN3i4ctLQHb0MPRiWxgJsA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/263913014a6b

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【ROI 裁剪成图（Images_From_ROIs）安装教程】—— OMERO

■ 前置条件
   · 有 OMERO.server 或 OMERO.web / OMERO.insight 的部署环境。

■ 本插件是什么
   根据已有 ROI 的形状与坐标，从原始图像中批量裁剪出子图像并保存为新图像，常用于把标注区域单独取出做形态测量或存档。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Python 脚本（.py）。
   · .jar/.py 为服务端插件或客户端脚本。

■ 安装步骤
   1. 服务端插件：把 .jar 放到 OMERO.server 的 lib/ 目录下的 plugins 路径，重启服务：
      omero admin restart
   2. 客户端脚本：放到 OMERO.insight 的 scripts 目录，重启客户端。
   3. OMERO.web 插件：按插件说明在 omero web 的配置里启用并重启 web。
   4. 重启后在对应菜单里即可看到该功能。

■ 常见问题
   · 重启后功能没出现：看 OMERO 的 logs/Blitz-0.log 有没有该插件的加载报错。
   · 权限不足：有的插件要求管理员账号才能启用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「ROI 裁剪成图」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/ome/omero-scripts/blob/master/omero/util_scripts/Images_From_ROIs.py
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Plot_Profile · 强度曲线

measure ｜ 0.02 MB ｜ 1 个文件

沿绘制的线条 ROI 逐点读取像素强度，输出强度随位置变化的曲线与数据表，常用于评估染色均匀性、边缘锐度和定位分布。

包含文件：Plot_Profile.py

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1r9rirCvHcd-3BXEqS6xGmg?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/946097080a4c

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【强度曲线（Plot_Profile）安装教程】—— OMERO

■ 前置条件
   · 有 OMERO.server 或 OMERO.web / OMERO.insight 的部署环境。

■ 本插件是什么
   沿绘制的线条 ROI 逐点读取像素强度，输出强度随位置变化的曲线与数据表，常用于评估染色均匀性、边缘锐度和定位分布。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Python 脚本（.py）。
   · .jar/.py 为服务端插件或客户端脚本。

■ 安装步骤
   1. 服务端插件：把 .jar 放到 OMERO.server 的 lib/ 目录下的 plugins 路径，重启服务：
      omero admin restart
   2. 客户端脚本：放到 OMERO.insight 的 scripts 目录，重启客户端。
   3. OMERO.web 插件：按插件说明在 omero web 的配置里启用并重启 web。
   4. 重启后在对应菜单里即可看到该功能。

■ 常见问题
   · 重启后功能没出现：看 OMERO 的 logs/Blitz-0.log 有没有该插件的加载报错。
   · 权限不足：有的插件要求管理员账号才能启用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「强度曲线」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/ome/omero-scripts/blob/master/omero/analysis_scripts/Plot_Profile.py
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Split_View_Figure · 通道分视图版

measure ｜ 0.03 MB ｜ 1 个文件

把多通道图像按通道拆分成独立面板并排成图版，可叠加合并视图，便于在同一张插图中同时比较各通道的分布与共定位情况。

包含文件：Split_View_Figure.py

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1wXQvJ2Pf_zQ2XWq9pF0yBg?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/4ed9adc23104

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【通道分视图版（Split_View_Figure）安装教程】—— OMERO

■ 前置条件
   · 有 OMERO.server 或 OMERO.web / OMERO.insight 的部署环境。

■ 本插件是什么
   把多通道图像按通道拆分成独立面板并排成图版，可叠加合并视图，便于在同一张插图中同时比较各通道的分布与共定位情况。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Python 脚本（.py）。
   · .jar/.py 为服务端插件或客户端脚本。

■ 安装步骤
   1. 服务端插件：把 .jar 放到 OMERO.server 的 lib/ 目录下的 plugins 路径，重启服务：
      omero admin restart
   2. 客户端脚本：放到 OMERO.insight 的 scripts 目录，重启客户端。
   3. OMERO.web 插件：按插件说明在 omero web 的配置里启用并重启 web。
   4. 重启后在对应菜单里即可看到该功能。

■ 常见问题
   · 重启后功能没出现：看 OMERO 的 logs/Blitz-0.log 有没有该插件的加载报错。
   · 权限不足：有的插件要求管理员账号才能启用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「通道分视图版」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/ome/omero-scripts/blob/master/omero/figure_scripts/Split_View_Figure.py
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

FLIM_initialise · FLIM 数据初始化

oio ｜ 0.01 MB ｜ 1 个文件

为荧光寿命成像（FLIM）数据建立所需的元数据和文件结构，把原始寿命信息导入平台，便于后续拟合与分析。

包含文件：FLIM_initialise.py

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/18Jp5cG66gJ6gvn2fB9k97w?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/5d70447053af

安装教程（点击展开）

【FLIM 数据初始化（FLIM_initialise）安装教程】—— OMERO

■ 前置条件
   · 有 OMERO.server 或 OMERO.web / OMERO.insight 的部署环境。

■ 本插件是什么
   为荧光寿命成像（FLIM）数据建立所需的元数据和文件结构，把原始寿命信息导入平台，便于后续拟合与分析。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Python 脚本（.py）。
   · .jar/.py 为服务端插件或客户端脚本。

■ 安装步骤
   1. 服务端插件：把 .jar 放到 OMERO.server 的 lib/ 目录下的 plugins 路径，重启服务：
      omero admin restart
   2. 客户端脚本：放到 OMERO.insight 的 scripts 目录，重启客户端。
   3. OMERO.web 插件：按插件说明在 omero web 的配置里启用并重启 web。
   4. 重启后在对应菜单里即可看到该功能。

■ 常见问题
   · 重启后功能没出现：看 OMERO 的 logs/Blitz-0.log 有没有该插件的加载报错。
   · 权限不足：有的插件要求管理员账号才能启用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「FLIM 数据初始化」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/ome/omero-scripts/blob/master/omero/setup_scripts/FLIM_initialise.py
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Channel_Offsets · 通道偏移校正

reg ｜ 0.02 MB ｜ 1 个文件

为多通道图像的每个通道设置像素级 XY 偏移量，校正不同滤光片或相机之间的通道错位，使各通道精确套合并便于共定位分析。

包含文件：Channel_Offsets.py

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1LE4EdOelxrnlUSfS3Ttw8w?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/d1f36a110cc8

安装教程（点击展开）

【通道偏移校正（Channel_Offsets）安装教程】—— OMERO

■ 前置条件
   · 有 OMERO.server 或 OMERO.web / OMERO.insight 的部署环境。

■ 本插件是什么
   为多通道图像的每个通道设置像素级 XY 偏移量，校正不同滤光片或相机之间的通道错位，使各通道精确套合并便于共定位分析。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Python 脚本（.py）。
   · .jar/.py 为服务端插件或客户端脚本。

■ 安装步骤
   1. 服务端插件：把 .jar 放到 OMERO.server 的 lib/ 目录下的 plugins 路径，重启服务：
      omero admin restart
   2. 客户端脚本：放到 OMERO.insight 的 scripts 目录，重启客户端。
   3. OMERO.web 插件：按插件说明在 omero web 的配置里启用并重启 web。
   4. 重启后在对应菜单里即可看到该功能。

■ 常见问题
   · 重启后功能没出现：看 OMERO 的 logs/Blitz-0.log 有没有该插件的加载报错。
   · 权限不足：有的插件要求管理员账号才能启用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「通道偏移校正」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/ome/omero-scripts/blob/master/omero/util_scripts/Channel_Offsets.py
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

ROI_Split_Figure · ROI 分割图版

seg ｜ 0.04 MB ｜ 1 个文件

以 ROI 为边界把图像裁切并排成网格图版，每个小图对应一个标注区域，便于集中比较不同区域或不同样本的形态差异。

包含文件：ROI_Split_Figure.py

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1o0bgRBFrw6VRJmGYF61NkA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/bceddd7f576d

安装教程（点击展开）

【ROI 分割图版（ROI_Split_Figure）安装教程】—— OMERO

■ 前置条件
   · 有 OMERO.server 或 OMERO.web / OMERO.insight 的部署环境。

■ 本插件是什么
   以 ROI 为边界把图像裁切并排成网格图版，每个小图对应一个标注区域，便于集中比较不同区域或不同样本的形态差异。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Python 脚本（.py）。
   · .jar/.py 为服务端插件或客户端脚本。

■ 安装步骤
   1. 服务端插件：把 .jar 放到 OMERO.server 的 lib/ 目录下的 plugins 路径，重启服务：
      omero admin restart
   2. 客户端脚本：放到 OMERO.insight 的 scripts 目录，重启客户端。
   3. OMERO.web 插件：按插件说明在 omero web 的配置里启用并重启 web。
   4. 重启后在对应菜单里即可看到该功能。

■ 常见问题
   · 重启后功能没出现：看 OMERO 的 logs/Blitz-0.log 有没有该插件的加载报错。
   · 权限不足：有的插件要求管理员账号才能启用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「ROI 分割图版」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/ome/omero-scripts/blob/master/omero/figure_scripts/ROI_Split_Figure.py
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Combine_Images · 图像合并

three ｜ 0.02 MB ｜ 1 个文件

把同一视野下不同通道的灰度图像按指定颜色合并为 RGB 彩色图像，方便在病理与荧光影像中直观查看多标记叠加效果。

包含文件：Combine_Images.py

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1FA5d9_g_EgoTKRgcFiI5vQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/ce63e382ac12

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【图像合并（Combine_Images）安装教程】—— OMERO

■ 前置条件
   · 有 OMERO.server 或 OMERO.web / OMERO.insight 的部署环境。

■ 本插件是什么
   把同一视野下不同通道的灰度图像按指定颜色合并为 RGB 彩色图像，方便在病理与荧光影像中直观查看多标记叠加效果。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Python 脚本（.py）。
   · .jar/.py 为服务端插件或客户端脚本。

■ 安装步骤
   1. 服务端插件：把 .jar 放到 OMERO.server 的 lib/ 目录下的 plugins 路径，重启服务：
      omero admin restart
   2. 客户端脚本：放到 OMERO.insight 的 scripts 目录，重启客户端。
   3. OMERO.web 插件：按插件说明在 omero web 的配置里启用并重启 web。
   4. 重启后在对应菜单里即可看到该功能。

■ 常见问题
   · 重启后功能没出现：看 OMERO 的 logs/Blitz-0.log 有没有该插件的加载报错。
   · 权限不足：有的插件要求管理员账号才能启用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「图像合并」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/ome/omero-scripts/blob/master/omero/util_scripts/Combine_Images.py
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Kymograph · 运动轨迹图

track ｜ 0.02 MB ｜ 1 个文件

沿绘制的线条 ROI 按时间逐帧采样像素强度，生成横轴为位置、纵轴为时间的时空图，用于观察囊泡运输、血流等运动过程。

包含文件：Kymograph.py

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1o-tRHQV5LFdJLQEMDwMddw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/dff62feadb5c

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【运动轨迹图（Kymograph）安装教程】—— OMERO

■ 前置条件
   · 有 OMERO.server 或 OMERO.web / OMERO.insight 的部署环境。

■ 本插件是什么
   沿绘制的线条 ROI 按时间逐帧采样像素强度，生成横轴为位置、纵轴为时间的时空图，用于观察囊泡运输、血流等运动过程。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Python 脚本（.py）。
   · .jar/.py 为服务端插件或客户端脚本。

■ 安装步骤
   1. 服务端插件：把 .jar 放到 OMERO.server 的 lib/ 目录下的 plugins 路径，重启服务：
      omero admin restart
   2. 客户端脚本：放到 OMERO.insight 的 scripts 目录，重启客户端。
   3. OMERO.web 插件：按插件说明在 omero web 的配置里启用并重启 web。
   4. 重启后在对应菜单里即可看到该功能。

■ 常见问题
   · 重启后功能没出现：看 OMERO 的 logs/Blitz-0.log 有没有该插件的加载报错。
   · 权限不足：有的插件要求管理员账号才能启用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「运动轨迹图」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/ome/omero-scripts/blob/master/omero/analysis_scripts/Kymograph.py
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Kymograph_Analysis · 运动轨迹图分析

track ｜ 0.01 MB ｜ 1 个文件

对已生成的运动轨迹图做进一步定量分析，提取运动方向、速度与停顿等参数，把时空图中的轨迹转换为可统计的运动数据。

包含文件：Kymograph_Analysis.py

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1WrjlNkzlJUVOSJv9A_mqeQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/373db2145d3a

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【运动轨迹图分析（Kymograph_Analysis）安装教程】—— OMERO

■ 前置条件
   · 有 OMERO.server 或 OMERO.web / OMERO.insight 的部署环境。

■ 本插件是什么
   对已生成的运动轨迹图做进一步定量分析，提取运动方向、速度与停顿等参数，把时空图中的轨迹转换为可统计的运动数据。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Python 脚本（.py）。
   · .jar/.py 为服务端插件或客户端脚本。

■ 安装步骤
   1. 服务端插件：把 .jar 放到 OMERO.server 的 lib/ 目录下的 plugins 路径，重启服务：
      omero admin restart
   2. 客户端脚本：放到 OMERO.insight 的 scripts 目录，重启客户端。
   3. OMERO.web 插件：按插件说明在 omero web 的配置里启用并重启 web。
   4. 重启后在对应菜单里即可看到该功能。

■ 常见问题
   · 重启后功能没出现：看 OMERO 的 logs/Blitz-0.log 有没有该插件的加载报错。
   · 权限不足：有的插件要求管理员账号才能启用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「运动轨迹图分析」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/ome/omero-scripts/blob/master/omero/analysis_scripts/Kymograph_Analysis.py
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Movie_ROI_Figure · ROI 影片图版

track ｜ 0.03 MB ｜ 1 个文件

在时间序列图像上叠加 ROI 轮廓与编号，按时间顺序排版成图版或影片，用于展示各区域的追踪、测量和动态变化结果。

包含文件：Movie_ROI_Figure.py

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/19EGZAkaQEd1Cf-iDVTphNw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/32d5d1bf4d9b

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【ROI 影片图版（Movie_ROI_Figure）安装教程】—— OMERO

■ 前置条件
   · 有 OMERO.server 或 OMERO.web / OMERO.insight 的部署环境。

■ 本插件是什么
   在时间序列图像上叠加 ROI 轮廓与编号，按时间顺序排版成图版或影片，用于展示各区域的追踪、测量和动态变化结果。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Python 脚本（.py）。
   · .jar/.py 为服务端插件或客户端脚本。

■ 安装步骤
   1. 服务端插件：把 .jar 放到 OMERO.server 的 lib/ 目录下的 plugins 路径，重启服务：
      omero admin restart
   2. 客户端脚本：放到 OMERO.insight 的 scripts 目录，重启客户端。
   3. OMERO.web 插件：按插件说明在 omero web 的配置里启用并重启 web。
   4. 重启后在对应菜单里即可看到该功能。

■ 常见问题
   · 重启后功能没出现：看 OMERO 的 logs/Blitz-0.log 有没有该插件的加载报错。
   · 权限不足：有的插件要求管理员账号才能启用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「ROI 影片图版」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/ome/omero-scripts/blob/master/omero/figure_scripts/Movie_ROI_Figure.py
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

OMERO 插件合集（共 16 个）

插件清单

Movie_Figure · 影片图版

Populate_ROI · 批量生成 ROI

Thumbnail_Figure · 缩略图图版

Dataset_To_Plate · 数据集转板格式

Make_Movie · 制作影片

Batch_Image_Export · 批量图像导出

Images_From_ROIs · ROI 裁剪成图

Plot_Profile · 强度曲线

Split_View_Figure · 通道分视图版

FLIM_initialise · FLIM 数据初始化

Channel_Offsets · 通道偏移校正

ROI_Split_Figure · ROI 分割图版

Combine_Images · 图像合并

Kymograph · 运动轨迹图

Kymograph_Analysis · 运动轨迹图分析

Movie_ROI_Figure · ROI 影片图版

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