Fiji / ImageJ 插件合集（126 个）· 安装教程与网盘下载

生信与图像分析最常用的一套｜分类：病理图片处理｜每个插件都附中文说明与安装教程，下载走百度网盘 / 夸克网盘。

插件清单

PointPicker_ · 点选器

annot ｜ 0.03 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.0

在图像上精确点选并记录坐标点

包含文件：PointPicker_-2.0.0.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1EgRcQxQlBsGJfKo6KmYIgQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/34520b25edc7

安装教程（点击展开）

【点选器（PointPicker_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「点选器」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「点选器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/PointPicker_/2.0.0/PointPicker_-2.0.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Script_Editor · 脚本编辑器

annot ｜ 0.21 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.0

Fiji 内置脚本编辑器，支持多种语言的编辑与运行

包含文件：Script_Editor-2.0.0-SNAPSHOT.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1MEhFMDFYrHLI7PRREe2PnA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/fc252ff42c8a

安装教程（点击展开）

【脚本编辑器（Script_Editor）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「脚本编辑器」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「脚本编辑器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://sites.imagej.net/Fiji/plugins/Script_Editor-2.0.0-SNAPSHOT.jar-20131127102347
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

CLI_ · 命令行接口

batch ｜ 0.04 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.0

命令行接口，支持用命令批量调用 Fiji 功能（内置组件）

包含文件：CLI_-2.0.0-SNAPSHOT.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1n1mRsD1ZwnY6j9C7nT68hQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/4d962daea711

安装教程（点击展开）

【命令行接口（CLI_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「命令行接口」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「命令行接口」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://sites.imagej.net/Fiji/plugins/CLI_-2.0.0-SNAPSHOT.jar-20130709103338
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Javascript_ · JavaScript 脚本解释器

batch ｜ 0.01 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.0

JavaScript 脚本解释器（Fiji 内置）

包含文件：Javascript_-2.0.0-SNAPSHOT.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1qBjhTsBZ7t0Md9n8wtxXcQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/2a13330ab1c3

安装教程（点击展开）

【JavaScript 脚本解释器（Javascript_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「JavaScript 脚本解释器」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「JavaScript 脚本解释器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://sites.imagej.net/Fiji/plugins/Javascript_-2.0.0-SNAPSHOT.jar-20130618171344
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Jython_Interpreter · Jython(Python) 脚本解释器

batch ｜ 0.01 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.0

Jython（Python 2）脚本解释器（Fiji 内置）

包含文件：Jython_Interpreter-2.0.0-SNAPSHOT.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1jXoSdNN9Lf-etIBxTUPnJw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/d3a3022b5baa

安装教程（点击展开）

【Jython(Python) 脚本解释器（Jython_Interpreter）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「Jython(Python) 脚本解释器」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Jython(Python) 脚本解释器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://sites.imagej.net/Fiji/plugins/Jython_Interpreter-2.0.0-SNAPSHOT.jar-20130904135521
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Statistical_Region_Merging · 统计区域合并分割

data ｜ 1.79 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.1

统计区域合并分割算法

包含文件：Statistical_Region_Merging-2.0.1.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1-cg7X6Np-F3ywSXCsNAN2w?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/021d262966bd

安装教程（点击展开）

【统计区域合并分割（Statistical_Region_Merging）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「统计区域合并分割」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「统计区域合并分割」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Statistical_Region_Merging/2.0.1/Statistical_Region_Merging-2.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Archipelago_Plugins · Archipelago 集群插件

dev ｜ 2.47 MB ｜ 1 个文件｜版本 0.5.4

Archipelago 集群计算框架的插件集

包含文件：Archipelago_Plugins-0.5.4.jar、依赖库/Fiji_Archipelago.jar、依赖库/Trainable_Segmentation.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1WQPchlzzXYYOkB0K-PZIzw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/ebd5c53bc31d

安装教程（点击展开）

【Archipelago 集群插件（Archipelago_Plugins）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   ImageJ 的集群计算插件，把批处理任务分配到多台计算机上并行执行，加快大批量图像处理。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「Archipelago 集群插件」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Archipelago 集群插件」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Archipelago_Plugins/0.5.4/Archipelago_Plugins-0.5.4.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Bug_Submitter · 问题反馈工具

dev ｜ 2.05 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.1.1

一键提交错误报告与运行日志给开发者

包含文件：Bug_Submitter-2.1.1.jar、依赖库/ij.jar、依赖库/imagej-updater.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1z-7f2PfhmXrqXqrUHl74VQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/6f97f5a079ea

安装教程（点击展开）

【问题反馈工具（Bug_Submitter）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「问题反馈工具」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「问题反馈工具」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Bug_Submitter/2.1.1/Bug_Submitter-2.1.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

CPU_Meter · CPU 占用监控

dev ｜ 1.79 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.2

显示 CPU 占用率，监控运行负载

包含文件：CPU_Meter-2.0.2.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1nBQlUQuuDBNqW7cX_PL7TQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/e88be346819a

安装教程（点击展开）

【CPU 占用监控（CPU_Meter）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   在 ImageJ 状态栏实时显示当前进程的 CPU 占用率，便于观察图像处理时的资源消耗情况。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「CPU 占用监控」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「CPU 占用监控」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/CPU_Meter/2.0.2/CPU_Meter-2.0.2.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Fiji_Developer · Fiji 开发工具

dev ｜ 3.71 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.8

开发辅助工具：编译、调试与源码导航

包含文件：Fiji_Developer-2.0.8.jar、依赖库/3D_Viewer.jar、依赖库/Fiji_Plugins.jar、依赖库/VIB_.jar、依赖库/ij.jar、依赖库/imagej-ui-swing.jar、依赖库/scijava-common.jar、依赖库/script-editor.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1MtW4bofVi0wQzUeTMA1k2g?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/f169972a0c0d

安装教程（点击展开）

【Fiji 开发工具（Fiji_Developer）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   面向插件开发者的辅助工具集，提供脚本编辑、调试与源码构建等功能，方便扩展 Fiji。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「Fiji 开发工具」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Fiji 开发工具」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Fiji_Developer/2.0.8/Fiji_Developer-2.0.8.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Fiji_Package_Maker · Fiji 打包工具

dev ｜ 2.14 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.1.1

把插件打包成可分发的更新包

包含文件：Fiji_Package_Maker-2.1.1.jar、依赖库/fiji-lib.jar、依赖库/ij.jar、依赖库/imagej-updater.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1EI1pnaXr-gGph5HShtE8Tg?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/80b21f409f65

安装教程（点击展开）

【Fiji 打包工具（Fiji_Package_Maker）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   把 Fiji 及其插件和更新打包成可分发文件，便于离线安装或部署到无网络的计算机。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「Fiji 打包工具」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Fiji 打包工具」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Fiji_Package_Maker/2.1.1/Fiji_Package_Maker-2.1.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Fiji_Plugins · Fiji 插件集

dev ｜ 2.21 MB ｜ 1 个文件｜版本 3.2.0

官方插件集合，随 Fiji 一起维护更新

包含文件：Fiji_Plugins-3.2.0.jar、依赖库/fiji-lib.jar、依赖库/ij.jar、依赖库/scijava-common.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1XeprLgivSiMkNzLzUpHpAw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/c9f88c9a5985

安装教程（点击展开）

【Fiji 插件集（Fiji_Plugins）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   Fiji 发行版自带的核心插件集合，提供常用图像处理、分析与批处理命令的统一入口。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「Fiji 插件集」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Fiji 插件集」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Fiji_Plugins/3.2.0/Fiji_Plugins-3.2.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Fiji_Updater · Fiji 更新器

dev ｜ 0.02 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.0

检查并更新本体与已安装插件

包含文件：Fiji_Updater-2.0.0.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1yj3ItAEYSRJyCwLKb2oPIg?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/60d253afe700

安装教程（点击展开）

【Fiji 更新器（Fiji_Updater）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   检查并安装 Fiji 本体与已装插件的在线更新，使软件和依赖库保持最新版本。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「Fiji 更新器」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Fiji 更新器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Fiji_Updater/2.0.0/Fiji_Updater-2.0.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

IJ_Robot · ImageJ 自动化脚本

dev ｜ 1.79 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.1

自动化脚本工具，用于自动测试与批处理

包含文件：IJ_Robot-2.0.1.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/14uYHrDT2F--JR_IK_E2IvQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/d769abe4c423

安装教程（点击展开）

【ImageJ 自动化脚本（IJ_Robot）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   用脚本控制 ImageJ 的界面与操作，实现点击菜单、输入参数等流程的自动化录制与回放。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「ImageJ 自动化脚本」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「ImageJ 自动化脚本」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/IJ_Robot/2.0.1/IJ_Robot-2.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

CorrectBleach_ · 荧光漂白校正

filter ｜ 1.8 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.1.0

荧光漂白校正，恢复衰减的荧光强度

包含文件：CorrectBleach_-2.1.0.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1FLE_NXnd09nSh3MrNz8OUA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/758c30f0223b

安装教程（点击展开）

【荧光漂白校正（CorrectBleach_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「荧光漂白校正」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「荧光漂白校正」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/CorrectBleach_/2.1.0/CorrectBleach_-2.1.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Daltonize_ · 色觉校正

filter ｜ 0.02 MB ｜ 1 个文件

把图像转换成红绿色盲友好配色，方便色觉障碍用户判读

包含文件：Daltonize_.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1TNL6Y1yfRjFIuMxUJLcpoA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/276e12857adc

安装教程（点击展开）

【色觉校正（Daltonize_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「色觉校正」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「色觉校正」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://sites.imagej.net/Fiji/plugins/Daltonize_.jar-20090429190858
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Gray_Morphology · 灰度形态学

filter ｜ 1.82 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.3.5

灰度形态学运算：腐蚀、膨胀、开运算、闭运算

包含文件：Gray_Morphology-2.3.5.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1_C9BWsiHWfH8W2oMwQt-oQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/2f1075fcca2a

安装教程（点击展开）

【灰度形态学（Gray_Morphology）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「灰度形态学」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「灰度形态学」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Gray_Morphology/2.3.5/Gray_Morphology-2.3.5.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Kuwahara_Filter · Kuwahara 滤波

filter ｜ 1.79 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.1

Kuwahara 滤波：保边平滑，适合去除噪声

包含文件：Kuwahara_Filter-2.0.1.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1HIV-0LIRTNqTrVS2ouBT-w?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/799076c06a2d

安装教程（点击展开）

【Kuwahara 滤波（Kuwahara_Filter）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   实现 Kuwahara 边缘保持平滑滤波，在降低噪声的同时保留图像中的边界与结构。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「Kuwahara 滤波」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Kuwahara 滤波」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Kuwahara_Filter/2.0.1/Kuwahara_Filter-2.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Analyze_Reader_Writer · Analyze 格式读写

io ｜ 0.01 MB ｜ 1 个文件｜版本 3.0.0

读取与保存 Analyze 7.5（.hdr/.img）格式

包含文件：Analyze_Reader_Writer-3.0.0.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1bkecX3H2yRtyQUHiFLLxbA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/4310a7f510d2

安装教程（点击展开）

【Analyze 格式读写器（Analyze_Reader_Writer）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   为 ImageJ/Fiji 提供 Analyze 7.5 医学影像格式的读取与写入支持，方便导入导出该类图像数据。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「Analyze 格式读写器」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Analyze 格式读写器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Analyze_Reader_Writer/3.0.0/Analyze_Reader_Writer-3.0.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

bio-formats_plugins · Bio-Formats 格式支持

io ｜ 41.38 MB ｜ 1 个文件

读取上百种显微图像格式，含导出与批量转换

包含文件：bioformats_package.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1d464ddFKSvKRybUrMm1HSg?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/ebd27d3d20be

安装教程（点击展开）

【Bio-Formats 格式支持（bio-formats_plugins）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   集成 Bio-Formats 库，使 ImageJ 能够读取数百种显微镜与医学图像的专有格式，方便统一打开与分析。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「Bio-Formats 格式支持」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Bio-Formats 格式支持」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   Open Microscopy 官方 6.14.0
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

H5J_Loader_Plugin · H5J 图像加载器

io ｜ 0.04 MB ｜ 1 个文件｜版本 1.1.5

读取 Allen 脑图谱 H5J 格式图像的加载器

包含文件：H5J_Loader_Plugin-1.1.5.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1FdHUbkezKp_08vCw3on6XQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/973399103fd3

安装教程（点击展开）

【H5J 图像加载器（H5J_Loader_Plugin）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「H5J 图像加载器」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「H5J 图像加载器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://sites.imagej.net/Fiji/plugins/H5J_Loader_Plugin-1.1.5.jar-20230710192336
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

HDF5_Vibez · HDF5 读写

io ｜ 1.83 MB ｜ 1 个文件｜版本 1.1.1

读写 HDF5 格式的大数据图像

包含文件：HDF5_Vibez-1.1.1.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/13c7WM94xidjiN2O9ZZ-N9A?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/b463dd1828c0

安装教程（点击展开）

【HDF5 读写（HDF5_Vibez）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   为 ImageJ 提供 HDF5 格式数据的读取与写入支持，便于处理大规模多维图像数据集。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「HDF5 读写」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「HDF5 读写」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/HDF5_Vibez/1.1.1/HDF5_Vibez-1.1.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

ij-ImageIO_ · 图像读写扩展 (ImageIO)

io ｜ 0.07 MB ｜ 1 个文件｜版本 .2.3.0

扩展的图像读写支持，含更多格式与元数据

包含文件：ijp_imageio-2.3.0.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1EgriJFcQ61hRy-aYbDxOiQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/381e0e59f8b0

安装教程（点击展开）

【图像读写扩展 (ImageIO)（ij-ImageIO_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「图像读写扩展 (ImageIO)」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「图像读写扩展 (ImageIO)」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   GitHub ij-plugins/ijp-imageio
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

IO_ · 输入输出工具集

io ｜ 2.87 MB ｜ 1 个文件｜版本 4.3.0

通用输入输出工具集

包含文件：IO_-4.3.0.jar、依赖库/ij.jar、依赖库/scifio.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1_u2ZNgzETy1eo6fhgCKBBA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/26ad17a3d733

安装教程（点击展开）

【输入输出工具集（IO_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「输入输出工具集」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「输入输出工具集」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/IO_/4.3.0/IO_-4.3.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

loci_plugins · LOCI 插件集

io ｜ 0.22 MB ｜ 1 个文件｜版本 4.4.10

LOCI 官方插件集（含 Bio-Formats 相关组件）

包含文件：loci_plugins-4.4.10.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1En-bEYVI02Vg3Hli5-FaEQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/c71b9808dc2a

安装教程（点击展开）

【LOCI 插件集（loci_plugins）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「LOCI 插件集」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「LOCI 插件集」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://sites.imagej.net/Fiji/plugins/loci_plugins-4.4.10.jar-20140116121202
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

LSM_Reader · LSM 格式读取

io ｜ 1.8 MB ｜ 1 个文件｜版本 4.1.2

读取蔡司 LSM 共聚焦图像格式

包含文件：LSM_Reader-4.1.2.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1MOyS6tMQBBnnT1TdSqTC5Q?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/c1f91dc8ff3d

安装教程（点击展开）

【LSM 格式读取（LSM_Reader）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   读取蔡司激光扫描显微镜（LSM）生成的图像文件，保留多通道与相关元数据信息。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「LSM 格式读取」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「LSM 格式读取」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/LSM_Reader/4.1.2/LSM_Reader-4.1.2.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Multi_Kymograph · 多点 Kymograph 分析

io ｜ 1.8 MB ｜ 1 个文件｜版本 3.0.1

多点 kymograph 分析，测量运动结构的速度

包含文件：Multi_Kymograph-3.0.1.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1VEgftCKV57HT5KLlrfds0A?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/8231faeded77

安装教程（点击展开）

【多点 Kymograph 分析（Multi_Kymograph）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「多点 Kymograph 分析」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「多点 Kymograph 分析」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Multi_Kymograph/3.0.1/Multi_Kymograph-3.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

SplineDeformationGenerator_ · 样条形变生成器

io ｜ 1.83 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.2

生成样条形变场，用于合成变形图像

包含文件：SplineDeformationGenerator_-2.0.2.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1vvj9syHlDl2T-yyyuXRwWQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/a8716b184781

安装教程（点击展开）

【样条形变生成器（SplineDeformationGenerator_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「样条形变生成器」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「样条形变生成器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/SplineDeformationGenerator_/2.0.2/SplineDeformationGenerator_-2.0.2.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Color_Histogram · 彩色直方图

measure ｜ 1.8 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.7

彩色图像的 RGB 直方图统计

包含文件：Color_Histogram-2.0.7.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/16yITfC-MtmR24atS9nQ9bw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/13caf6503132

安装教程（点击展开）

【彩色直方图（Color_Histogram）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「彩色直方图」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「彩色直方图」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Color_Histogram/2.0.7/Color_Histogram-2.0.7.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Colour_Deconvolution · 色彩反卷积

measure ｜ 1.8 MB ｜ 1 个文件｜版本 3.0.3

色彩反卷积：分离多重染色（如 H&E、免疫组化）

包含文件：Colour_Deconvolution-3.0.3.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/14H15t64oBplA0CF-ZYKstA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/953cbed3aac2

安装教程（点击展开）

【色彩反卷积（Colour_Deconvolution）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「色彩反卷积」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「色彩反卷积」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Colour_Deconvolution/3.0.3/Colour_Deconvolution-3.0.3.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Differentials_ · 微分算子

measure ｜ 0.01 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.0

图像微分算子：梯度、拉普拉斯等边缘增强

包含文件：Differentials_-2.0.0.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1KDJ6ANNJuNO-0wqcxceadA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/85e28e11867c

安装教程（点击展开）

【微分算子（Differentials_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「微分算子」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「微分算子」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Differentials_/2.0.0/Differentials_-2.0.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

FlowJ_ · 流式细胞分析 (FlowJ)

measure ｜ 2.14 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.1

流式细胞术数据分析（Flow Cytometry）

包含文件：FlowJ_-2.0.1.jar、依赖库/bij.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1_duT4a53o3hAGLySscJ7Nw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/a9cb8a8971ef

安装教程（点击展开）

【流式细胞分析 (FlowJ)（FlowJ_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「流式细胞分析 (FlowJ)」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「流式细胞分析 (FlowJ)」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/FlowJ_/2.0.1/FlowJ_-2.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Helmholtz_Analysis · 亥姆霍兹分析

measure ｜ 1.79 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.2

亥姆霍兹方程分析，用于磁场与流场类数据

包含文件：Helmholtz_Analysis-2.0.2.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1R2NS1LrS0xPEOuKUdc2M4Q?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/354934a49aca

安装教程（点击展开）

【亥姆霍兹分析（Helmholtz_Analysis）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「亥姆霍兹分析」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「亥姆霍兹分析」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Helmholtz_Analysis/2.0.2/Helmholtz_Analysis-2.0.2.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

KymographBuilder · Kymograph 生成器

measure ｜ 0.02 MB ｜ 1 个文件｜版本 3.0.2

由时间序列图像生成 kymograph 运动轨迹图

包含文件：KymographBuilder-3.0.2.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/15Qk971VfUvLKbPSY3jcMuw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/cfd1c36a345b

安装教程（点击展开）

【Kymograph 生成器（KymographBuilder）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   从时间序列图像中沿指定路径提取并生成时空图（kymograph），用于分析运动与流速。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「Kymograph 生成器」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Kymograph 生成器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/KymographBuilder/3.0.2/KymographBuilder-3.0.2.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

PIV_analyser · 粒子图像测速 (PIV)

measure ｜ 1.81 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.0

粒子图像测速（PIV）：分析流体与粒子位移场

包含文件：PIV_analyser-2.0.0.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/11RrZeUX8p5W5penEMbTMjw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/f949a9a5f232

安装教程（点击展开）

【粒子图像测速 (PIV)（PIV_analyser）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「粒子图像测速 (PIV)」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「粒子图像测速 (PIV)」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/PIV_analyser/2.0.0/PIV_analyser-2.0.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

TransformJ_ · 图像变换工具集 (TransformJ)

rdc ｜ 0.05 MB ｜ 1 个文件｜版本 4.0.0

图像几何变换工具集：旋转、缩放、仿射

包含文件：TransformJ_-4.0.0.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1VUzzOLBoLOUheryUdZ2EtA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/3451665c0f14

安装教程（点击展开）

【图像变换工具集 (TransformJ)（TransformJ_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「图像变换工具集 (TransformJ)」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「图像变换工具集 (TransformJ)」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/TransformJ_/4.0.0/TransformJ_-4.0.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

bigwarp_fiji · BigWarp 手动形变配准

reg ｜ 4.24 MB ｜ 1 个文件｜版本 9.4.0

手动点对点形变配准，适合形变较大的图像

包含文件：bigwarp_fiji-9.4.0.jar、依赖库/bigdataviewer-core.jar、依赖库/bigdataviewer_fiji.jar、依赖库/fiji-lib.jar、依赖库/ij.jar、依赖库/imagej-common.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1RO-8Rx4T1oOqou-KL2FyCg?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/04d1e79a533c

安装教程（点击展开）

【BigWarp 手动形变配准（bigwarp_fiji）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   在图像上手动放置地标点，交互式地对两幅大体积图像进行非刚性形变配准。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「BigWarp 手动形变配准」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「BigWarp 手动形变配准」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/bigwarp_fiji/9.4.0/bigwarp_fiji-9.4.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

blockmatching_ · 块匹配拼接

reg ｜ 4.06 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.1.4

基于块匹配的序列图像拼接

包含文件：blockmatching_-2.1.4.jar、依赖库/TrakEM2_.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1b7Z6V1CoKpr2Ur9Mg5q4fw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/6a7fa8856aa0

安装教程（点击展开）

【块匹配拼接（blockmatching_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「块匹配拼接」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「块匹配拼接」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/blockmatching_/2.1.4/blockmatching_-2.1.4.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Correct_3D_Drift · 三维漂移校正

reg ｜ 0.02 MB ｜ 1 个文件｜版本 1.0.7

校正三维与四维时间序列中的漂移

包含文件：Correct_3D_Drift-1.0.7.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1lx4vawVQzClIkGlH7hb_ZQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/75cc387b049d

安装教程（点击展开）

【三维漂移校正（Correct_3D_Drift）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「三维漂移校正」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「三维漂移校正」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Correct_3D_Drift/1.0.7/Correct_3D_Drift-1.0.7.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

FS_Align_TrakEM2 · TrakEM2 序列对齐

reg ｜ 4.06 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.4

TrakEM2 中基于特征点的序列图像对齐

包含文件：FS_Align_TrakEM2-2.0.4.jar、依赖库/TrakEM2_.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1wv9JvrgoDGS88Mb7UXKYiA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/95de41fe10be

安装教程（点击展开）

【TrakEM2 序列对齐（FS_Align_TrakEM2）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   为 TrakEM2 提供基于特征匹配的切片序列对齐功能，用于电镜连续切片图像的拼接与配准。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「TrakEM2 序列对齐」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「TrakEM2 序列对齐」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/FS_Align_TrakEM2/2.0.4/FS_Align_TrakEM2-2.0.4.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

mpicbg_ · mpicbg 配准库

reg ｜ 0.34 MB ｜ 1 个文件｜版本 1.6.6

mpicbg 配准算法库，拼接与配准的底层组件

包含文件：mpicbg-1.6.6.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1KQQXnBv_Adiu_brYSwNwMg?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/ef8382434b48

安装教程（点击展开）

【mpicbg 配准库（mpicbg_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   提供图像配准与拼接的核心算法库，为 TrakEM2、BigWarp 等插件提供底层支持。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「mpicbg 配准库」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「mpicbg 配准库」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   Maven mpicbg:mpicbg
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

panorama_ · 全景拼接

reg ｜ 1.81 MB ｜ 1 个文件｜版本 3.0.2

全景拼接：把多张图拼成大幅面图像

包含文件：panorama_-3.0.2.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1JgnXhtELvI-moVXm91armQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/904e0289eaf5

安装教程（点击展开）

【全景拼接（panorama_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「全景拼接」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「全景拼接」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/panorama_/3.0.2/panorama_-3.0.2.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

registration_3d · 三维配准

reg ｜ 1.81 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.1

三维图像刚性配准与仿射配准

包含文件：registration_3d-2.0.1.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1KJgiP8dTwe3a4GzdBEM75Q?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/f9a6f24d0b1c

安装教程（点击展开）

【三维配准（registration_3d）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「三维配准」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「三维配准」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/registration_3d/2.0.1/registration_3d-2.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

SPIM_Registration · 光片显微配准

reg ｜ 5.07 MB ｜ 1 个文件｜版本 5.0.26

光片显微多视角数据的配准与重建

包含文件：SPIM_Registration-5.0.26.jar、依赖库/VIB-lib.jar、依赖库/bigdataviewer-core.jar、依赖库/fiji-lib.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1e1HWttO29pHrcJmMy73Pcw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/944d893ee040

安装教程（点击展开）

【光片显微配准（SPIM_Registration）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「光片显微配准」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「光片显微配准」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/SPIM_Registration/5.0.26/SPIM_Registration-5.0.26.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

TurboReg_ · 快速配准

reg ｜ 0.09 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.0

快速刚性配准与仿射配准，速度快精度高

包含文件：TurboReg_-2.0.0.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/14HXpX5t-VcvMYmBT6FGYaw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/6cde031cd06a

安装教程（点击展开）

【快速配准（TurboReg_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「快速配准」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「快速配准」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/TurboReg_/2.0.0/TurboReg_-2.0.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

3D_Blob_Segmentation · 三维团块分割

seg ｜ 2.42 MB ｜ 1 个文件｜版本 4.0.0

三维图像中自动检测并分割球状团块结构

包含文件：3D_Blob_Segmentation-4.0.0.jar、依赖库/3D_Viewer.jar、依赖库/ij.jar、依赖库/level_sets.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1X6S1ECd-ZmnmZdPD04r6Cg?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/3dc0f5352458

安装教程（点击展开）

【三维团块分割（3D_Blob_Segmentation）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「三维团块分割」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「三维团块分割」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/3D_Blob_Segmentation/4.0.0/3D_Blob_Segmentation-4.0.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Auto_Local_Threshold · 自动局部阈值

seg ｜ 1.79 MB ｜ 1 个文件｜版本 1.11.0

多种局部自动阈值分割方法（Bernsen、Niblack 等）

包含文件：Auto_Local_Threshold-1.11.0.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1Ft1kWhlHdmxFz9ogvZhgEw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/adaba4622120

安装教程（点击展开）

【自动局部阈值（Auto_Local_Threshold）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「自动局部阈值」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「自动局部阈值」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Auto_Local_Threshold/1.11.0/Auto_Local_Threshold-1.11.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Auto_Threshold · 自动阈值

seg ｜ 1.8 MB ｜ 1 个文件｜版本 1.18.0

内置 16 种全局自动阈值算法，可一键对比选择

包含文件：Auto_Threshold-1.18.0.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1cXZnTXTimcJI5BtGstP5Ag?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/ab682d6d6efc

安装教程（点击展开）

【自动阈值（Auto_Threshold）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「自动阈值」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「自动阈值」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Auto_Threshold/1.18.0/Auto_Threshold-1.18.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

ij_ridge_detect · 脊线检测

seg ｜ 0.13 MB ｜ 1 个文件｜版本 1.4.0

检测图像中的脊线与线条结构

包含文件：ij_ridge_detect-1.4.0.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1hIE8zGGwRpveKrL-Evi0QQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/4f4dadc3d8d9

安装教程（点击展开）

【脊线检测（ij_ridge_detect）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「脊线检测」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「脊线检测」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   GitHub thorstenwagner/ij-ridgedetection
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

IsoData_Classifier · IsoData 分类器

seg ｜ 1.79 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.1

IsoData 无监督分类器，用于分割与分类

包含文件：IsoData_Classifier-2.0.1.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1Cs4rapGbKcqWR6tafz8WuQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/b3f64f589f68

安装教程（点击展开）

【IsoData 分类器（IsoData_Classifier）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   基于 IsoData 迭代阈值方法的像素分类插件，可将灰度图像自动分割为多个类别。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「IsoData 分类器」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「IsoData 分类器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/IsoData_Classifier/2.0.1/IsoData_Classifier-2.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

level_sets · 水平集分割

seg ｜ 1.86 MB ｜ 1 个文件｜版本 1.0.2

水平集分割：追踪轮廓演化的主动轮廓法

包含文件：level_sets-1.0.2.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1sqqhizpmMvoNIq-Od-KYTA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/a6f7815a0df4

安装教程（点击展开）

【水平集分割（level_sets）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「水平集分割」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「水平集分割」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/level_sets/1.0.2/level_sets-1.0.2.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Snakuscule_ · 主动轮廓圆检测

seg ｜ 0.04 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.0

主动轮廓圆检测，快速圈选圆形细胞核

包含文件：Snakuscule_-2.0.0.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1arFCXyScxgZ5nlli5PZAkA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/9d6c3faf8e0e

安装教程（点击展开）

【主动轮廓圆检测（Snakuscule_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「主动轮廓圆检测」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「主动轮廓圆检测」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Snakuscule_/2.0.0/Snakuscule_-2.0.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Threshold_Colour · 彩色阈值分割

seg ｜ 0.03 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.1

按颜色阈值分割，适合彩色图像

包含文件：Threshold_Colour-2.0.1.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1lSaUHBq_AuOUSpic2tsy_w?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/eb9414b95da2

安装教程（点击展开）

【彩色阈值分割（Threshold_Colour）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「彩色阈值分割」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「彩色阈值分割」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Threshold_Colour/2.0.1/Threshold_Colour-2.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

3D_Viewer · 三维查看器

three ｜ 3.75 MB ｜ 1 个文件｜版本 5.0.1

以三维方式交互查看图像栈，支持体渲染与旋转

包含文件：3D_Viewer-5.0.1.jar、依赖库/VIB-lib.jar、依赖库/ij.jar、依赖库/legacy-imglib1.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1qnBQSzM7Il_X0-gJ4w1DBQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/93e900240262

安装教程（点击展开）

【三维查看器（3D_Viewer）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「三维查看器」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「三维查看器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/3D_Viewer/5.0.1/3D_Viewer-5.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

bigdataviewer_fiji · BigDataViewer 多维查看器

three ｜ 0.18 MB ｜ 1 个文件｜版本 6.4.2

大体积多维数据的快速浏览与探索

包含文件：bigdataviewer_fiji-6.4.2.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1sHEqQUHFpWqKiPgiGbafyQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/1c0f3bd33b2f

安装教程（点击展开）

【BigDataViewer 多维查看器（bigdataviewer_fiji）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   以多分辨率方式快速浏览大规模多维图像数据，支持沿任意方向切片查看。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「BigDataViewer 多维查看器」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「BigDataViewer 多维查看器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/bigdataviewer_fiji/6.4.2/bigdataviewer_fiji-6.4.2.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Color_Inspector_3D · 三维彩色检视器

three ｜ 2.03 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.5.0

三维彩色空间检视，分析色彩分布

包含文件：Color_Inspector_3D-2.5.0.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1ZjViI1WydzJHuBEqVBKCcQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/5fac4b59de1d

安装教程（点击展开）

【三维彩色检视器（Color_Inspector_3D）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「三维彩色检视器」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「三维彩色检视器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Color_Inspector_3D/2.5.0/Color_Inspector_3D-2.5.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Extended_Depth_Field · 扩展景深

three ｜ 0.11 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.1

扩展景深：把不同焦平面合成为全清晰图像

包含文件：Extended_Depth_Field-2.0.1.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1fugleEanQn-1RjzHg_13Qg?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/d562b7c71007

安装教程（点击展开）

【扩展景深（Extended_Depth_Field）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「扩展景深」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「扩展景深」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Extended_Depth_Field/2.0.1/Extended_Depth_Field-2.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Image_5D · 五维图像管理

three ｜ 1.91 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.2

把图像栈扩展到五维（x、y、z、时间、通道）管理

包含文件：Image_5D-2.0.2.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1CAruXQe87SLbvd8TRX1s3Q?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/e44cd80ce844

安装教程（点击展开）

【五维图像管理（Image_5D）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「五维图像管理」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「五维图像管理」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Image_5D/2.0.2/Image_5D-2.0.2.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Interactive_3D_Surface_Plot · 三维表面图

three ｜ 1.88 MB ｜ 1 个文件｜版本 3.0.1

交互式三维表面图，拖动旋转观察亮度曲面

包含文件：Interactive_3D_Surface_Plot-3.0.1.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1uY3nVm_bzlgUbCNXgi6b-w?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/b27695ed8e69

安装教程（点击展开）

【三维表面图（Interactive_3D_Surface_Plot）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「三维表面图」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「三维表面图」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Interactive_3D_Surface_Plot/3.0.1/Interactive_3D_Surface_Plot-3.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

LocalThickness_ · 局部厚度计算

three ｜ 1.81 MB ｜ 1 个文件｜版本 5.0.0

计算三维物体的局部厚度（最大内切球）

包含文件：LocalThickness_-5.0.0.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1up4-BUJZymSD8igNtg4myw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/97bdccea395b

安装教程（点击展开）

【局部厚度计算（LocalThickness_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「局部厚度计算」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「局部厚度计算」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/LocalThickness_/5.0.0/LocalThickness_-5.0.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

n5-viewer_fiji · N5 数据查看器

three ｜ 0.09 MB ｜ 1 个文件｜版本 6.2.0

基于 BigDataViewer 的 N5 数据集可视化

包含文件：n5-viewer_fiji-6.2.0.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1_u0LZvgd0xrR8NqOo12ccA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/75d3a375be93

安装教程（点击展开）

【N5 数据查看器（n5-viewer_fiji）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   浏览存储在 N5 格式中的多维大数据集，支持多分辨率金字塔与任意切片查看。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「N5 数据查看器」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「N5 数据查看器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   Maven org.janelia.saalfeldlab:n5-viewer_fiji
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

SPIM_Opener · SPIM 数据打开

three ｜ 1.91 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.2

打开光片显微镜（SPIM）采集的多视角数据

包含文件：SPIM_Opener-2.0.2.jar、依赖库/fiji-lib.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1wd3iEK5Nu6w7YoWXbQbPmA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/e1b540105e1e

安装教程（点击展开）

【SPIM 数据打开（SPIM_Opener）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   打开单平面照明显微镜（SPIM）采集的多视角图像数据，便于拼接与三维可视化。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「SPIM 数据打开」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「SPIM 数据打开」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/SPIM_Opener/2.0.2/SPIM_Opener-2.0.2.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Vaa3d_Reader · Vaa3D 格式读取

three ｜ 1.89 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.3

读取 Vaa3D 三维重建数据（.v3draw 等）

包含文件：Vaa3d_Reader-2.0.3.jar、依赖库/fiji-lib.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1jM_dpNeirVDANzbJcJhRGw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/f3c1df1d7b96

安装教程（点击展开）

【Vaa3D 格式读取（Vaa3d_Reader）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   读取 Vaa3D 软件使用的图像与神经元重建数据，便于在 ImageJ 中查看与分析。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「Vaa3D 格式读取」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Vaa3D 格式读取」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Vaa3d_Reader/2.0.3/Vaa3d_Reader-2.0.3.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Vaa3d_Writer · Vaa3D 格式写出

three ｜ 1.79 MB ｜ 1 个文件｜版本 1.0.3

写出 Vaa3D 可读的 .v3draw 文件

包含文件：Vaa3d_Writer-1.0.3.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/18nm5DjV8ESJUWkHbxWI2dw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/77100c940483

安装教程（点击展开）

【Vaa3D 格式写出（Vaa3d_Writer）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   把图像与神经元追踪结果导出为 Vaa3D 支持的格式，方便与三维可视化软件交换数据。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「Vaa3D 格式写出」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Vaa3D 格式写出」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Vaa3d_Writer/1.0.3/Vaa3d_Writer-1.0.3.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Volume_Calculator · 体积计算器

three ｜ 2.41 MB ｜ 1 个文件｜版本 3.0.0

测量三维物体的体积与表面积

包含文件：Volume_Calculator-3.0.0.jar、依赖库/3D_Viewer.jar、依赖库/AnalyzeSkeleton_.jar、依赖库/Skeletonize3D_.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/11mjq12d-1D4b_oyhMGlCnA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/4a59cc2fbd71

安装教程（点击展开）

【体积计算器（Volume_Calculator）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「体积计算器」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「体积计算器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Volume_Calculator/3.0.0/Volume_Calculator-3.0.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Volume_Viewer · 体渲染查看

three ｜ 1.9 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.01.4

体渲染查看器，用于立体渲染展示

包含文件：Volume_Viewer-2.01.4.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1eirtHf7R66sbAncwFjD-PQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/be469096e510

安装教程（点击展开）

【体渲染查看（Volume_Viewer）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「体渲染查看」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「体渲染查看」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Volume_Viewer/2.01.4/Volume_Viewer-2.01.4.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

3D_Objects_Counter · 三维物体计数

track ｜ 1.81 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.1

统计三维图像中物体的数量、体积与位置

包含文件：3D_Objects_Counter-2.0.1.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1jZZNJBBoa2dpXDMuC8vLwQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/aadc14a4e868

安装教程（点击展开）

【三维物体计数（3D_Objects_Counter）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「三维物体计数」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「三维物体计数」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/3D_Objects_Counter/2.0.1/3D_Objects_Counter-2.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Cell_Counter · 细胞计数

track ｜ 2.1 MB ｜ 1 个文件｜版本 3.0.0

手动点选计数细胞，并保存计数结果

包含文件：Cell_Counter-3.0.0.jar、依赖库/ij.jar、依赖库/scijava-common.jar、依赖库/scijava-ui-awt.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1kl1vWxAF43DI28FXrupWPw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/0ee1a3dcd776

安装教程（点击展开）

【细胞计数（Cell_Counter）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「细胞计数」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「细胞计数」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Cell_Counter/3.0.0/Cell_Counter-3.0.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Manual_Tracking · 手动追踪

track ｜ 1.93 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.1.1

手动逐帧追踪运动物体并输出轨迹

包含文件：Manual_Tracking-2.1.1.jar、依赖库/Image_5D.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1jJZo6vkGVVb_qO-JTV08jw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/de4a6b48a464

安装教程（点击展开）

【手动追踪（Manual_Tracking）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「手动追踪」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「手动追踪」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Manual_Tracking/2.1.1/Manual_Tracking-2.1.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

MTrack2_ · 二维多目标追踪 (MTrack2)

track ｜ 1.79 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.1

二维多目标自动追踪，统计速度与方向

包含文件：MTrack2_-2.0.1.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1TBI31gM69J1w89PjL3P7vA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/591bc777a673

安装教程（点击展开）

【二维多目标追踪 (MTrack2)（MTrack2_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「二维多目标追踪 (MTrack2)」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「二维多目标追踪 (MTrack2)」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/MTrack2_/2.0.1/MTrack2_-2.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Skeletonize3D_ · 三维骨架化

track ｜ 1.79 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.1.1

三维骨架化：把三维结构细化为中心线

包含文件：Skeletonize3D_-2.1.1.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1AwrsZiL6BRHasrmNzCXbrQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/1268ef331ca9

安装教程（点击展开）

【三维骨架化（Skeletonize3D_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「三维骨架化」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「三维骨架化」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Skeletonize3D_/2.1.1/Skeletonize3D_-2.1.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Algorithm_Launcher · 算法启动器

util ｜ 0.01 MB ｜ 1 个文件

按名称快速调用算法的启动器（Fiji 内置组件）

包含文件：Algorithm_Launcher.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1JOYbyJ3J7SJtqeBtzckm5Q?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/221e5223f2a4

安装教程（点击展开）

【算法启动器（Algorithm_Launcher）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「算法启动器」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「算法启动器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://sites.imagej.net/Fiji/plugins/Algorithm_Launcher.jar-20100610024221
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

AnalyzeSkeleton_ · 骨架分析

util ｜ 1.83 MB ｜ 1 个文件｜版本 3.4.2

分析二维与三维骨架，统计分支、端点与长度

包含文件：AnalyzeSkeleton_-3.4.2.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1a_O5W_gja701t4PckLYP8A?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/a0de627c44e6

安装教程（点击展开）

【骨架分析（AnalyzeSkeleton_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「骨架分析」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「骨架分析」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/AnalyzeSkeleton_/3.4.2/AnalyzeSkeleton_-3.4.2.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Anisotropic_Diffusion_2D · 各向异性扩散滤波

util ｜ 1.79 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.1

各向异性扩散滤波：保边去噪，适合荧光图像

包含文件：Anisotropic_Diffusion_2D-2.0.1.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1c3p_utgXRjoVSQjOSwVanw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/5f3a4de238e0

安装教程（点击展开）

【各向异性扩散滤波（Anisotropic_Diffusion_2D）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「各向异性扩散滤波」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「各向异性扩散滤波」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Anisotropic_Diffusion_2D/2.0.1/Anisotropic_Diffusion_2D-2.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Arrow_ · 箭头标注

util ｜ 1.9 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.2

在图像上绘制箭头标注

包含文件：Arrow_-2.0.2.jar、依赖库/fiji-lib.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1GLinjrysGQqKaeq_Pto-yQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/73fd8d595a93

安装教程（点击展开）

【箭头标注（Arrow_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「箭头标注」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「箭头标注」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Arrow_/2.0.2/Arrow_-2.0.2.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

BalloonSegmentation_ · 气球分割

util ｜ 1.85 MB ｜ 1 个文件｜版本 3.0.1

气球力主动轮廓分割，适合圆形椭圆结构

包含文件：BalloonSegmentation_-3.0.1.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1DNzUQc4UPW7FuRdWut7Mfw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/698c1e3b89b3

安装教程（点击展开）

【气球分割（BalloonSegmentation_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「气球分割」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「气球分割」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/BalloonSegmentation_/3.0.1/BalloonSegmentation_-3.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

BeanShell_Interpreter · BeanShell 脚本解释器

util ｜ 0.01 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.0

BeanShell 脚本解释器（Fiji 内置）

包含文件：BeanShell_Interpreter-2.0.0-SNAPSHOT.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/12NpSG14_LniINEUQqVoOtA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/80a748dbcbdb

安装教程（点击展开）

【BeanShell 脚本解释器（BeanShell_Interpreter）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「BeanShell 脚本解释器」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「BeanShell 脚本解释器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://sites.imagej.net/Fiji/plugins/BeanShell_Interpreter-2.0.0-SNAPSHOT.jar-20130618171344
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

bUnwarpJ_ · bUnwarpJ 弹性配准

util ｜ 1.97 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.6.13

双向弹性配准，适合有弹性形变的图像序列

包含文件：bUnwarpJ_-2.6.13.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1RU6u_hCqPhxQh6E-NQOjnA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/c3efdb8f3ba3

安装教程（点击展开）

【bUnwarpJ 弹性配准（bUnwarpJ_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   实现基于 B 样条的弹性图像配准，可对形变较大的两幅图像进行双向非刚性对齐。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「bUnwarpJ 弹性配准」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「bUnwarpJ 弹性配准」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/bUnwarpJ_/2.6.13/bUnwarpJ_-2.6.13.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Calculator_Plus · 图像计算器 Plus

util ｜ 1.79 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.1

图像之间的加减乘除运算，支持背景校正

包含文件：Calculator_Plus-2.0.1.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1MkfbOSnp8ZAKEUnJ-JZlbw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/9eb5023476e2

安装教程（点击展开）

【图像计算器 Plus（Calculator_Plus）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「图像计算器 Plus」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「图像计算器 Plus」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Calculator_Plus/2.0.1/Calculator_Plus-2.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Clojure_Interpreter · Clojure 脚本解释器

util ｜ 0.01 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.0

Clojure 脚本解释器（Fiji 内置）

包含文件：Clojure_Interpreter-2.0.0-SNAPSHOT.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/13GeUN2WBjx6Qj8CHf-3K7w?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/0e518c955a30

安装教程（点击展开）

【Clojure 脚本解释器（Clojure_Interpreter）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「Clojure 脚本解释器」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Clojure 脚本解释器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://sites.imagej.net/Fiji/plugins/Clojure_Interpreter-2.0.0-SNAPSHOT.jar-20130618171344
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Colocalisation_Analysis · 共定位分析

util ｜ 2.02 MB ｜ 1 个文件｜版本 3.1.0

共定位分析（Pearson、Manders、Costes 等系数）

包含文件：Colocalisation_Analysis-3.1.0.jar、依赖库/fiji-lib.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1P7ycgdPbzFPIBHEKMrVk6Q?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/bcbfddafaa58

安装教程（点击展开）

【共定位分析（Colocalisation_Analysis）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「共定位分析」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「共定位分析」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Colocalisation_Analysis/3.1.0/Colocalisation_Analysis-3.1.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Descriptor_based_registration · 特征描述子配准

util ｜ 4.42 MB ｜ 1 个文件｜版本 3.0.3

基于特征描述子的自动图像配准

包含文件：Descriptor_based_registration-3.0.3.jar、依赖库/Fiji_Plugins.jar、依赖库/SPIM_Registration.jar、依赖库/fiji-lib.jar、依赖库/ij.jar、依赖库/legacy-imglib1.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1T22RtoYUF67SLtusCwM84A?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/bd998922ee89

安装教程（点击展开）

【特征描述子配准（Descriptor_based_registration）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「特征描述子配准」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「特征描述子配准」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Descriptor_based_registration/3.0.3/Descriptor_based_registration-3.0.3.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Dichromacy_ · 色觉模拟 (红绿色盲)

util ｜ 1.8 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.1.2

模拟红绿色盲视角，检查图像辨识效果

包含文件：Dichromacy_-2.1.2.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1j9s8cxQAq6qPCF4727laWw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/0ffe26cc19cc

安装教程（点击展开）

【色觉模拟 (红绿色盲)（Dichromacy_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「色觉模拟 (红绿色盲)」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「色觉模拟 (红绿色盲)」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Dichromacy_/2.1.2/Dichromacy_-2.1.2.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Directionality_ · 方向性分析

util ｜ 1.81 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.3.0

方向性分析：统计纤维与结构的取向分布

包含文件：Directionality_-2.3.0.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1121dSzL2atDdwPV1q-KODA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/e0ad53e183ae

安装教程（点击展开）

【方向性分析（Directionality_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「方向性分析」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「方向性分析」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Directionality_/2.3.0/Directionality_-2.3.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Feature_Detection · 特征检测

util ｜ 2.63 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.3

在图像中检测点状、线状等特征

包含文件：Feature_Detection-2.0.3.jar、依赖库/ij.jar、依赖库/legacy-imglib1.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1R2haQ4W2JIjB73tV3GnHKw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/6203edfa63a3

安装教程（点击展开）

【特征检测（Feature_Detection）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「特征检测」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「特征检测」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Feature_Detection/2.0.3/Feature_Detection-2.0.3.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

FeatureJ_ · 特征提取

util ｜ 0.04 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.0

特征提取：Hessian、拉普拉斯、结构张量等滤波器

包含文件：FeatureJ_-2.0.0.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1ZN3MxCD8O5meFEH_Hip_Cw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/e170fc8db51a

安装教程（点击展开）

【特征提取（FeatureJ_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「特征提取」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「特征提取」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/FeatureJ_/2.0.0/FeatureJ_-2.0.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Fiji_Archipelago · Archipelago 集群支持

util ｜ 1.96 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.1

Fiji 的集群计算支持组件

包含文件：Fiji_Archipelago-2.0.1.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1xHc01zP4120RrHpEr-E6_A?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/f1704f850000

安装教程（点击展开）

【Archipelago 集群支持（Fiji_Archipelago）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   为 Fiji 集成 Archipelago 集群框架，可将批量图像处理任务分发到多台计算机并行计算。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「Archipelago 集群支持」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Archipelago 集群支持」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Fiji_Archipelago/2.0.1/Fiji_Archipelago-2.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Graph_Cut · 图割分割

util ｜ 2.73 MB ｜ 1 个文件｜版本 1.0.2

图割分割：交互式分割复杂结构

包含文件：Graph_Cut-1.0.2.jar、依赖库/fiji-lib.jar、依赖库/ij.jar、依赖库/legacy-imglib1.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1hp6LerUqIe3QLiz_ksWu2A?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/001c6ae52245

安装教程（点击展开）

【图割分割（Graph_Cut）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「图割分割」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「图割分割」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Graph_Cut/1.0.2/Graph_Cut-1.0.2.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Image_Expression_Parser · 图像表达式解析器

util ｜ 3.26 MB ｜ 1 个文件｜版本 3.0.1

用数学表达式逐像素计算生成新图像

包含文件：Image_Expression_Parser-3.0.1.jar、依赖库/ij.jar、依赖库/jep.jar、依赖库/legacy-imglib1.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1lsHjmXXMplVU4GwjlpuQqQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/666ab858f228

安装教程（点击展开）

【图像表达式解析器（Image_Expression_Parser）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「图像表达式解析器」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「图像表达式解析器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Image_Expression_Parser/3.0.1/Image_Expression_Parser-3.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

JRuby_Interpreter · JRuby 脚本解释器

util ｜ 0.01 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.0

JRuby 脚本解释器（Fiji 内置）

包含文件：JRuby_Interpreter-2.0.0-SNAPSHOT.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1l-IYC03aJvtelj8pm08AaA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/11c4062cd7d9

安装教程（点击展开）

【JRuby 脚本解释器（JRuby_Interpreter）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「JRuby 脚本解释器」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「JRuby 脚本解释器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://sites.imagej.net/Fiji/plugins/JRuby_Interpreter-2.0.0-SNAPSHOT.jar-20140911164637
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Lasso_and_Blow_Tool · 套索放大工具

util ｜ 1.89 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.2

套索选区局部放大，便于精细观察与编辑

包含文件：Lasso_and_Blow_Tool-2.0.2.jar、依赖库/fiji-lib.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1VL066U57alOSjLnw7UAajw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/9a51dbbe214c

安装教程（点击展开）

【套索放大工具（Lasso_and_Blow_Tool）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「套索放大工具」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「套索放大工具」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Lasso_and_Blow_Tool/2.0.2/Lasso_and_Blow_Tool-2.0.2.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Linear_Kuwahara · 线性 Kuwahara 滤波

util ｜ 1.79 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.1

线性 Kuwahara 滤波，保边平滑的快速版本

包含文件：Linear_Kuwahara-2.0.1.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/11_0nG9E3MjDRECFSJUnG-g?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/fa615c70a788

安装教程（点击展开）

【线性 Kuwahara 滤波（Linear_Kuwahara）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「线性 Kuwahara 滤波」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「线性 Kuwahara 滤波」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Linear_Kuwahara/2.0.1/Linear_Kuwahara-2.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

LSM_Toolbox · 共聚焦工具箱

util ｜ 2.13 MB ｜ 1 个文件｜版本 4.1.2

蔡司 LSM 共聚焦图像的元数据查看与处理

包含文件：LSM_Toolbox-4.1.2.jar、依赖库/LSM_Reader.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1b4zZ2iZoarngVbKzlFoTaA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/33226d755512

安装教程（点击展开）

【共聚焦工具箱（LSM_Toolbox）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「共聚焦工具箱」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「共聚焦工具箱」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/LSM_Toolbox/4.1.2/LSM_Toolbox-4.1.2.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

M_I_P · 最大强度投影 (MIP)

util ｜ 1.8 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.1

最大强度投影：把三维栈压成二维投影图

包含文件：M_I_P-2.0.1.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/185p4RF5miTx97LMOJvdUdQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/4496ab30dfe5

安装教程（点击展开）

【最大强度投影 (MIP)（M_I_P）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「最大强度投影 (MIP)」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「最大强度投影 (MIP)」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/M_I_P/2.0.1/M_I_P-2.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

MosaicJ_ · 图像拼接 (MosaicJ)

util ｜ 0.06 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.0

交互式拼接多张有重叠区域的图像

包含文件：MosaicJ_-2.0.0.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1p_ANgndUpd-SxYbWZPohGQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/ea9bb7d7b42b

安装教程（点击展开）

【图像拼接 (MosaicJ)（MosaicJ_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「图像拼接 (MosaicJ)」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「图像拼接 (MosaicJ)」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/MosaicJ_/2.0.0/MosaicJ_-2.0.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

MTrackJ_ · 手动轨迹追踪 (MTrackJ)

util ｜ 0.1 MB ｜ 1 个文件｜版本 1.5.4

手动标注并追踪多个目标，支持多种轨迹模型

包含文件：MTrackJ_-1.5.4.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1gVH_b1zPxjvIaY3cCcr2YQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/192a14233251

安装教程（点击展开）

【手动轨迹追踪 (MTrackJ)（MTrackJ_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「手动轨迹追踪 (MTrackJ)」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「手动轨迹追踪 (MTrackJ)」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/MTrackJ_/1.5.4/MTrackJ_-1.5.4.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

QuickPALM_ · 超分辨定位 (QuickPALM)

util ｜ 1.84 MB ｜ 1 个文件｜版本 1.1.2

超分辨单分子定位（PALM/STORM）分析

包含文件：QuickPALM_-1.1.2.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1ig_cJT2bnSZWgN5ZgzeZnw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/537eed1f9d65

安装教程（点击展开）

【超分辨定位 (QuickPALM)（QuickPALM_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「超分辨定位 (QuickPALM)」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「超分辨定位 (QuickPALM)」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/QuickPALM_/1.1.2/QuickPALM_-1.1.2.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

RandomJ_ · 随机图像生成

util ｜ 0.03 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.0

生成随机图像与噪声，用于算法测试

包含文件：RandomJ_-2.0.0.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/18XPReHi7JrTD1Sr7LbTbyA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/7d235c2038e8

安装教程（点击展开）

【随机图像生成（RandomJ_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「随机图像生成」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「随机图像生成」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/RandomJ_/2.0.0/RandomJ_-2.0.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

RATS_ · 噪声时间序列分析 (RATS)

util ｜ 1.8 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.2

噪声时间序列分析（RATS）：检测信号显著性

包含文件：RATS_-2.0.2.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1igHzJACDnySfgyBtRUKV5A?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/9679211ad802

安装教程（点击展开）

【噪声时间序列分析 (RATS)（RATS_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「噪声时间序列分析 (RATS)」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「噪声时间序列分析 (RATS)」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/RATS_/2.0.2/RATS_-2.0.2.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Reconstruct_Reader · Reconstruct 格式读取

util ｜ 4.11 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.5

读取 Reconstruct 软件生成的系列图像数据

包含文件：Reconstruct_Reader-2.0.5.jar、依赖库/TrakEM2_.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1prujITKZBKLvMak0rMvJeQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/bae6cb391a67

安装教程（点击展开）

【Reconstruct 格式读取（Reconstruct_Reader）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   读取 Reconstruct 软件生成的连续切片图像序列与对齐信息，便于后续三维重建。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「Reconstruct 格式读取」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Reconstruct 格式读取」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Reconstruct_Reader/2.0.5/Reconstruct_Reader-2.0.5.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Refresh_Javas · 刷新 Java 插件

util ｜ 0.01 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.0

重新扫描并加载 Java 插件，改完插件后无需重启

包含文件：Refresh_Javas-2.0.0-SNAPSHOT.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1FOTV6faD_nu5vUlFw_AIKw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/f0047a137d78

安装教程（点击展开）

【刷新 Java 插件（Refresh_Javas）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「刷新 Java 插件」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「刷新 Java 插件」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://sites.imagej.net/Fiji/plugins/Refresh_Javas-2.0.0-SNAPSHOT.jar-20140214165714
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

register_virtual_stack_slices · 虚拟切片序列配准

util ｜ 4.57 MB ｜ 1 个文件｜版本 3.0.8

配准保存在本地硬盘的虚拟切片序列

包含文件：register_virtual_stack_slices-3.0.8.jar、依赖库/IO_.jar、依赖库/TrakEM2_.jar、依赖库/bUnwarpJ_.jar、依赖库/fiji-lib.jar、依赖库/ij.jar、依赖库/trakem2-transform.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/12Ldmlel9NYJg26UhlPDxdA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/7d972e059659

安装教程（点击展开）

【虚拟切片序列配准（register_virtual_stack_slices）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「虚拟切片序列配准」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「虚拟切片序列配准」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/register_virtual_stack_slices/3.0.8/register_virtual_stack_slices-3.0.8.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Samples_ · 示例图像集

util ｜ 0.01 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.3

内置示例图像，用于练习与演示

包含文件：Samples_-2.0.3.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/10WczTzb48EqHlcbbDSS2xQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/b45ad4e1dd6d

安装教程（点击展开）

【示例图像集（Samples_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「示例图像集」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「示例图像集」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Samples_/2.0.3/Samples_-2.0.3.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Series_Labeler · 序列标注

util ｜ 1.82 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.1

为序列图像批量添加名称标注

包含文件：Series_Labeler-2.0.1.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1arKYjYmUMDyDqzgUAo5v_g?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/4348a9d48e46

安装教程（点击展开）

【序列标注（Series_Labeler）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「序列标注」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「序列标注」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Series_Labeler/2.0.1/Series_Labeler-2.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

SheppLogan_ · Shepp-Logan 体模

util ｜ 0.01 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.0

生成 Shepp-Logan 体模，用于重建算法测试

包含文件：SheppLogan_-2.0.0.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1yFZdMCn7mlIu9u80ZhOdNw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/b72eb9f3bae7

安装教程（点击展开）

【Shepp-Logan 体模（SheppLogan_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   生成 Shepp-Logan 标准体模图像，用于测试与评估图像重建及断层成像算法。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「Shepp-Logan 体模」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Shepp-Logan 体模」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/SheppLogan_/2.0.0/SheppLogan_-2.0.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Simple_Neurite_Tracer · 神经元追踪

util ｜ 0.35 MB ｜ 1 个文件｜版本 3.1.10

半自动追踪神经元突起，统计长度与分支

包含文件：Simple_Neurite_Tracer-3.1.10.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1EWF6IWm7D0Nah1OlsSLW3A?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/6b94294cb685

安装教程（点击展开）

【神经元追踪（Simple_Neurite_Tracer）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「神经元追踪」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「神经元追踪」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Simple_Neurite_Tracer/3.1.10/Simple_Neurite_Tracer-3.1.10.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Siox_Segmentation · SIOX 交互分割

util ｜ 1.98 MB ｜ 1 个文件｜版本 1.0.5

SIOX 交互式分割：涂几笔即可分割目标

包含文件：Siox_Segmentation-1.0.5.jar、依赖库/fiji-lib.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1P1vNCcmx9ZstAHvSLl0WyQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/6b43a2814427

安装教程（点击展开）

【SIOX 交互分割（Siox_Segmentation）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   提供基于 SIOX 算法的交互式图像分割，用户只需少量涂抹即可提取目标区域。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「SIOX 交互分割」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「SIOX 交互分割」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Siox_Segmentation/1.0.5/Siox_Segmentation-1.0.5.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Stack_Manipulation · 图像栈操作

util ｜ 1.82 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.1.2

图像栈切片操作：提取、插入、删除与重排

包含文件：Stack_Manipulation-2.1.2.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1JOuZSCeg_o3siYTOn_Sw-w?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/abf1b9663ab5

安装教程（点击展开）

【图像栈操作（Stack_Manipulation）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「图像栈操作」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「图像栈操作」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Stack_Manipulation/2.1.2/Stack_Manipulation-2.1.2.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

StackReg_ · 堆栈配准

util ｜ 0.02 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.0

图像栈配准，校正序列中的平移旋转漂移

包含文件：StackReg_-2.0.0.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/19OQaAnBFwKSRLahZC7BOIA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/614a95bda9c5

安装教程（点击展开）

【堆栈配准（StackReg_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「堆栈配准」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「堆栈配准」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/StackReg_/2.0.0/StackReg_-2.0.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Stitching_ · 图像拼接

util ｜ 3.14 MB ｜ 1 个文件｜版本 3.1.10

基于相位相关的大图与大栈拼接

包含文件：Stitching_-3.1.10.jar、依赖库/Fiji_Plugins.jar、依赖库/fiji-lib.jar、依赖库/ij.jar、依赖库/legacy-imglib1.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1qxH_BJx-f7IiaOZGktGgPQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/cf0bca899a99

安装教程（点击展开）

【图像拼接（Stitching_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「图像拼接」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「图像拼接」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Stitching_/3.1.10/Stitching_-3.1.10.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Sync_Win · 多窗口同步

util ｜ 1.95 MB ｜ 1 个文件｜版本 1.7

多窗口同步浏览：缩放与平移联动

包含文件：Sync_Win-1.7-fiji4.jar、依赖库/Image_5D.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1GkOPXMWNMBm8H7oPvt0VKA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/7b67dca16670

安装教程（点击展开）

【多窗口同步（Sync_Win）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「多窗口同步」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「多窗口同步」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Sync_Win/1.7-fiji4/Sync_Win-1.7-fiji4.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Thread_Killer · 线程终止工具

util ｜ 1.79 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.1

终止卡住的运算线程

包含文件：Thread_Killer-2.0.1.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1hEiJcQ9bLpFf6VZ_C9V_2A?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/627a6b6ac88f

安装教程（点击展开）

【线程终止工具（Thread_Killer）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「线程终止工具」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「线程终止工具」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Thread_Killer/2.0.1/Thread_Killer-2.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Time_Lapse · 延时序列

util ｜ 1.95 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.1.1

延时序列工具：批量处理与导出时间序列

包含文件：Time_Lapse-2.1.1.jar、依赖库/fiji-lib.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1EPYlomAtjDk2cRsddLv5lQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/1c8ab7aea68c

安装教程（点击展开）

【延时序列（Time_Lapse）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「延时序列」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「延时序列」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Time_Lapse/2.1.1/Time_Lapse-2.1.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Time_Stamper · 时间戳标记

util ｜ 1.79 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.1.0

在图像上叠加时间戳

包含文件：Time_Stamper-2.1.0.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/129R9s4e8LtcdRysqYg0nMw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/dc2abc7a8bc3

安装教程（点击展开）

【时间戳标记（Time_Stamper）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「时间戳标记」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「时间戳标记」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Time_Stamper/2.1.0/Time_Stamper-2.1.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

ToAST_ · ToAST 追踪校正

util ｜ 1.81 MB ｜ 1 个文件｜版本 25.0.2

ToAST 追踪校正，修正长时间追踪的漂移

包含文件：ToAST_-25.0.2.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1_jE2i89bd60-Y8IVaanyEg?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/bafc5c834dc7

安装教程（点击展开）

【ToAST 追踪校正（ToAST_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   对图像中的运动轨迹进行自动追踪与漂移校正，用于分析颗粒或细胞的运动。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「ToAST 追踪校正」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「ToAST 追踪校正」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/ToAST_/25.0.2/ToAST_-25.0.2.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

TopoJ_ · TopoJ 像素分类器

util ｜ 1.79 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.1

TopoJ 监督式像素分类器，训练后可分割新图像

包含文件：TopoJ_-2.0.1.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1E6RT4HOiAtpY2xgPtBkgnw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/b35a36d94c76

安装教程（点击展开）

【TopoJ 像素分类器（TopoJ_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   基于拓扑与形态特征的像素分类插件，把图像中的像素按结构类型自动归类。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「TopoJ 像素分类器」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「TopoJ 像素分类器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/TopoJ_/2.0.1/TopoJ_-2.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

TrackMate_ · 目标追踪

util ｜ 1.38 MB ｜ 1 个文件｜版本 6.0.1

强大易用的单粒子与细胞追踪插件，支持 LAP 算法

包含文件：TrackMate_-6.0.1.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1K2BmwXPQp4Pf44c-bYAQRQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/04b933fdd80a

安装教程（点击展开）

【目标追踪（TrackMate_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「目标追踪」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「目标追踪」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/TrackMate_/6.0.1/TrackMate_-6.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Trainable_Segmentation · 可训练分割 (Weka)

util ｜ 3.32 MB ｜ 1 个文件｜版本 4.0.0

可训练分割（Weka）：随手画几笔即可训练分类器

包含文件：Trainable_Segmentation-4.0.0.jar、依赖库/Anisotropic_Diffusion_2D.jar、依赖库/Stitching_.jar、依赖库/VIB-lib.jar、依赖库/fiji-lib.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/15FJWpJbMWPWP0beXSIEowg?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/ffdd11608402

安装教程（点击展开）

【可训练分割 (Weka)（Trainable_Segmentation）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「可训练分割 (Weka)」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「可训练分割 (Weka)」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Trainable_Segmentation/4.0.0/Trainable_Segmentation-4.0.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

TrakEM2_ · 电镜重建与追踪

util ｜ 4.7 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.1

电镜图像序列重建与神经元追踪平台

包含文件：TrakEM2_-2.0.1.jar、依赖库/VIB-lib.jar、依赖库/VectorString.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1whxbPF7p3Old6CktiI7Xvw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/0a47c369d2f7

安装教程（点击展开）

【电镜重建与追踪（TrakEM2_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「电镜重建与追踪」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「电镜重建与追踪」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/TrakEM2_/2.0.1/TrakEM2_-2.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

TrakEM2_Archipelago · TrakEM2 集群支持

util ｜ 4.24 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.4

TrakEM2 的集群计算支持

包含文件：TrakEM2_Archipelago-2.0.4.jar、依赖库/Fiji_Archipelago.jar、依赖库/TrakEM2_.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1FPtvgF3CcZAzlivTqY2a5w?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/0abe43a56b1d

安装教程（点击展开）

【TrakEM2 集群支持（TrakEM2_Archipelago）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   为 TrakEM2 提供集群计算支持，将大规模电镜配准与重建任务分发到多台计算机。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「TrakEM2 集群支持」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「TrakEM2 集群支持」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/TrakEM2_Archipelago/2.0.4/TrakEM2_Archipelago-2.0.4.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

trakem2_tps · TrakEM2 薄板样条

util ｜ 1.79 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.0

TrakEM2 中的薄板样条（TPS）形变模型

包含文件：trakem2_tps-2.0.0.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1eSP843vp_OrzKlc1--Y5SQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/c833ec11588f

安装教程（点击展开）

【TrakEM2 薄板样条（trakem2_tps）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   为 TrakEM2 提供薄板样条变换支持，用于对切片图像进行平滑的非刚性形变对齐。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「TrakEM2 薄板样条」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「TrakEM2 薄板样条」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/trakem2_tps/2.0.0/trakem2_tps-2.0.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

UnwarpJ_ · 弹性配准

util ｜ 0.1 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.0

弹性配准：校正非刚性形变

包含文件：UnwarpJ_-2.0.0.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1npyBWE70u2jrgBQ52JBAaA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/f8133cf88317

安装教程（点击展开）

【弹性配准（UnwarpJ_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「弹性配准」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「弹性配准」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/UnwarpJ_/2.0.0/UnwarpJ_-2.0.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

VIB_ · VIB 协议图像读取

util ｜ 3.73 MB ｜ 1 个文件｜版本 4.0.0

读取 VIB 协议图像（生物图像格式）

包含文件：VIB_-4.0.0.jar、依赖库/3D_Viewer.jar、依赖库/VIB-lib.jar、依赖库/fiji-lib.jar、依赖库/ij.jar、依赖库/pal-optimization.jar、依赖库/scijava-common.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1Cg1hmltkaAN8y3Ia9L_ViA?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/56b83214de2a

安装教程（点击展开）

【VIB 协议图像读取（VIB_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   读取 Bio-Rad VIB 格式的共聚焦显微镜图像文件，支持多通道与元数据解析，便于后续分析处理。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「VIB 协议图像读取」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「VIB 协议图像读取」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/VIB_/4.0.0/VIB_-4.0.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Video_Editing · 视频编辑

util ｜ 1.81 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.0.1

视频编辑：裁剪、转码与导出

包含文件：Video_Editing-2.0.1.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1P8OvmLeQu3wBUQhFfcj3eQ?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/e990500cac7a

安装教程（点击展开）

【视频编辑（Video_Editing）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「视频编辑」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「视频编辑」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/Video_Editing/2.0.1/Video_Editing-2.0.1.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

View5D_ · 五维查看器 (View5D)

util ｜ 1.96 MB ｜ 1 个文件｜版本 2.5.0

五维数据查看器，支持任意维度剖切

包含文件：View5D_-2.5.0.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1_0PryuRNHt9bY2QdFzc2nw?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/cef472c2c5db

安装教程（点击展开）

【五维查看器 (View5D)（View5D_）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   详见插件官方说明。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「五维查看器 (View5D)」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「五维查看器 (View5D)」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/View5D_/2.5.0/View5D_-2.5.0.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

z_spacing · Z 间距调整

util ｜ 3.04 MB ｜ 1 个文件｜版本 1.1.3

设置与调整 Z 轴间距，保证三维比例正确

包含文件：z_spacing-1.1.3.jar、依赖库/bigdataviewer-core.jar、依赖库/fiji-lib.jar、依赖库/ij.jar

百度网盘：https://pan.baidu.com/s/1eCOIkT_hX0orgFB4VLqV1A?pwd=6666 提取码 6666 ｜夸克网盘：https://pan.quark.cn/s/b577a88832fc

安装教程（点击展开）

【Z 间距调整（z_spacing）安装教程】—— ImageJ

■ 前置条件
   · 已安装 ImageJ 或 Fiji（推荐 Fiji，插件兼容性最好）。

■ 本插件是什么
   批量调整图像栈的 Z 轴层间距与体素尺寸，保证三维重建时的几何比例正确。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：Java 插件包（.jar）。
   · .jar 是插件本体；.ijm/.txt 是宏脚本；其它后缀为附加数据。

■ 安装步骤
   1. 完全关闭 ImageJ / Fiji。
   2. 把本目录的文件复制到安装目录下：
      · 插件（.jar）      → Fiji.app/plugins/
      · 宏脚本（.ijm）    → Fiji.app/macros/ 或 plugins/Macros/
      · 脚本类（.py/.groovy）→ Fiji.app/scripts/
   3. 重新打开 ImageJ / Fiji。
   4. 菜单 Plugins（插件）里即可看到「Z 间距调整」（有的插件在 Plugins → Macros 下）。

■ 建议
   · 首次安装建议先备份整个 Fiji.app/plugins 目录，出问题可直接还原。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Z 间距调整」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://maven.scijava.org/repository/releases/sc/fiji/z_spacing/1.1.3/z_spacing-1.1.3.jar
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

Fiji / ImageJ 插件合集（共 126 个）

插件清单

PointPicker_ · 点选器

Script_Editor · 脚本编辑器

CLI_ · 命令行接口

Javascript_ · JavaScript 脚本解释器

Jython_Interpreter · Jython(Python) 脚本解释器

Statistical_Region_Merging · 统计区域合并分割

Archipelago_Plugins · Archipelago 集群插件

Bug_Submitter · 问题反馈工具

CPU_Meter · CPU 占用监控

Fiji_Developer · Fiji 开发工具

Fiji_Package_Maker · Fiji 打包工具

Fiji_Plugins · Fiji 插件集

Fiji_Updater · Fiji 更新器

IJ_Robot · ImageJ 自动化脚本

CorrectBleach_ · 荧光漂白校正

Daltonize_ · 色觉校正

Gray_Morphology · 灰度形态学

Kuwahara_Filter · Kuwahara 滤波

Analyze_Reader_Writer · Analyze 格式读写

bio-formats_plugins · Bio-Formats 格式支持

H5J_Loader_Plugin · H5J 图像加载器

HDF5_Vibez · HDF5 读写

ij-ImageIO_ · 图像读写扩展 (ImageIO)

IO_ · 输入输出工具集

loci_plugins · LOCI 插件集

LSM_Reader · LSM 格式读取

Multi_Kymograph · 多点 Kymograph 分析

SplineDeformationGenerator_ · 样条形变生成器

Color_Histogram · 彩色直方图

Colour_Deconvolution · 色彩反卷积

Differentials_ · 微分算子

FlowJ_ · 流式细胞分析 (FlowJ)

Helmholtz_Analysis · 亥姆霍兹分析

KymographBuilder · Kymograph 生成器

PIV_analyser · 粒子图像测速 (PIV)

TransformJ_ · 图像变换工具集 (TransformJ)

bigwarp_fiji · BigWarp 手动形变配准

blockmatching_ · 块匹配拼接

Correct_3D_Drift · 三维漂移校正

FS_Align_TrakEM2 · TrakEM2 序列对齐

mpicbg_ · mpicbg 配准库

panorama_ · 全景拼接

registration_3d · 三维配准

SPIM_Registration · 光片显微配准

TurboReg_ · 快速配准

3D_Blob_Segmentation · 三维团块分割

Auto_Local_Threshold · 自动局部阈值

Auto_Threshold · 自动阈值

ij_ridge_detect · 脊线检测

IsoData_Classifier · IsoData 分类器

level_sets · 水平集分割

Snakuscule_ · 主动轮廓圆检测

Threshold_Colour · 彩色阈值分割

3D_Viewer · 三维查看器

bigdataviewer_fiji · BigDataViewer 多维查看器

Color_Inspector_3D · 三维彩色检视器

Extended_Depth_Field · 扩展景深

Image_5D · 五维图像管理

Interactive_3D_Surface_Plot · 三维表面图

LocalThickness_ · 局部厚度计算

n5-viewer_fiji · N5 数据查看器

SPIM_Opener · SPIM 数据打开

Vaa3d_Reader · Vaa3D 格式读取

Vaa3d_Writer · Vaa3D 格式写出

Volume_Calculator · 体积计算器

Volume_Viewer · 体渲染查看

3D_Objects_Counter · 三维物体计数

Cell_Counter · 细胞计数

Manual_Tracking · 手动追踪

MTrack2_ · 二维多目标追踪 (MTrack2)

Skeletonize3D_ · 三维骨架化

Algorithm_Launcher · 算法启动器

AnalyzeSkeleton_ · 骨架分析

Anisotropic_Diffusion_2D · 各向异性扩散滤波

Arrow_ · 箭头标注

BalloonSegmentation_ · 气球分割

BeanShell_Interpreter · BeanShell 脚本解释器

bUnwarpJ_ · bUnwarpJ 弹性配准