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Grand Challenge Grand Challenge 插件合集(共 16 个)
医学影像挑战赛平台(官方算法与组件) | 分类:病理图片处理 | 每个插件都附中文说明与安装教程,下载走百度网盘 / 夸克网盘。
插件清单
cobb-angle-algorithm · 脊柱Cobb角测量算法
util | 0.01 MB | 1 个文件
基于脊柱X线影像自动测量Cobb角的算法,用于评估脊柱侧弯程度并输出结构化的测量结果。
包含文件:cobb-angle-algorithm-main.zip
安装教程(点击展开)
【脊柱Cobb角测量算法(cobb-angle-algorithm)安装教程】—— Grand Challenge
■ 前置条件
· 算法类:Linux + Docker,Python 3.10+(官方打包工具 evalutils / panimg)。
· 平台组件类:按仓库 README 准备对应环境。
■ 本组件是什么
基于脊柱X线影像自动测量Cobb角的算法,用于评估脊柱侧弯程度并输出结构化的测量结果。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 为官方仓库源码包,解压后按下面方式使用。
■ 使用步骤(算法容器)
1. 解压本目录的包,进入仓库根目录。
2. 按 README 安装依赖: pip install -r requirements.txt (或 pip install -e .)
3. 用官方工具打包镜像: evalutils build (或按 README 里的 docker build 命令)。
4. 在 grand-challenge.org 算法页面把镜像提交/上传,平台会自动跑推理。
■ 使用步骤(平台组件)
1. 解压后按 README 用 docker compose 或 pip 安装运行。
■ 常用工具说明
· evalutils / panimg:官方提供的算法打包与影像格式转换工具(本目录已含源码包)。
· demo-algorithm-template:官方给的算法模板,照着它改自己的模型最快。
■ 常见问题
· 打包失败:Docker Desktop 记得开;镜像内 Python 版本与 requirements 要对齐。
· 提交后跑不出结果:输入输出接口必须按官方规范(算法要能被平台调用)。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/cobb-angle-algorithm
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「脊柱Cobb角测量算法」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/cobb-angle-algorithm
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
demo-algorithm-template · 算法容器示例模板
util | 0.02 MB | 1 个文件
Grand Challenge平台提供的算法容器模板,展示Docker镜像与接口约定的基本结构,供开发者快速起步。
包含文件:demo-algorithm-template-main.zip
安装教程(点击展开)
【算法容器示例模板(demo-algorithm-template)安装教程】—— Grand Challenge
■ 前置条件
· 算法类:Linux + Docker,Python 3.10+(官方打包工具 evalutils / panimg)。
· 平台组件类:按仓库 README 准备对应环境。
■ 本组件是什么
Grand Challenge平台提供的算法容器模板,展示Docker镜像与接口约定的基本结构,供开发者快速起步。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 为官方仓库源码包,解压后按下面方式使用。
■ 使用步骤(算法容器)
1. 解压本目录的包,进入仓库根目录。
2. 按 README 安装依赖: pip install -r requirements.txt (或 pip install -e .)
3. 用官方工具打包镜像: evalutils build (或按 README 里的 docker build 命令)。
4. 在 grand-challenge.org 算法页面把镜像提交/上传,平台会自动跑推理。
■ 使用步骤(平台组件)
1. 解压后按 README 用 docker compose 或 pip 安装运行。
■ 常用工具说明
· evalutils / panimg:官方提供的算法打包与影像格式转换工具(本目录已含源码包)。
· demo-algorithm-template:官方给的算法模板,照着它改自己的模型最快。
■ 常见问题
· 打包失败:Docker Desktop 记得开;镜像内 Python 版本与 requirements 要对齐。
· 提交后跑不出结果:输入输出接口必须按官方规范(算法要能被平台调用)。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/demo-algorithm-template
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「算法容器示例模板」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/demo-algorithm-template
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
demo-challenge-pack · 演示挑战赛打包
util | 0.06 MB | 1 个文件
演示用挑战赛的打包配置,包含数据与评分等结构示例,帮助主办方搭建和测试自己的挑战赛。
包含文件:demo-challenge-pack-main.zip
安装教程(点击展开)
【演示挑战赛打包(demo-challenge-pack)安装教程】—— Grand Challenge
■ 前置条件
· 算法类:Linux + Docker,Python 3.10+(官方打包工具 evalutils / panimg)。
· 平台组件类:按仓库 README 准备对应环境。
■ 本组件是什么
演示用挑战赛的打包配置,包含数据与评分等结构示例,帮助主办方搭建和测试自己的挑战赛。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 为官方仓库源码包,解压后按下面方式使用。
■ 使用步骤(算法容器)
1. 解压本目录的包,进入仓库根目录。
2. 按 README 安装依赖: pip install -r requirements.txt (或 pip install -e .)
3. 用官方工具打包镜像: evalutils build (或按 README 里的 docker build 命令)。
4. 在 grand-challenge.org 算法页面把镜像提交/上传,平台会自动跑推理。
■ 使用步骤(平台组件)
1. 解压后按 README 用 docker compose 或 pip 安装运行。
■ 常用工具说明
· evalutils / panimg:官方提供的算法打包与影像格式转换工具(本目录已含源码包)。
· demo-algorithm-template:官方给的算法模板,照着它改自己的模型最快。
■ 常见问题
· 打包失败:Docker Desktop 记得开;镜像内 Python 版本与 requirements 要对齐。
· 提交后跑不出结果:输入输出接口必须按官方规范(算法要能被平台调用)。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/demo-challenge-pack
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「演示挑战赛打包」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/demo-challenge-pack
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LEOPARD-challenge-submission-example · LEOPARD挑战提交示例
util | 0.01 MB | 1 个文件
LEOPARD挑战赛的提交示例工程,演示组织算法提交所需的文件、目录与配置结构。
包含文件:LEOPARD-challenge-submission-example-main.zip
安装教程(点击展开)
【LEOPARD挑战提交示例(LEOPARD-challenge-submission-example)安装教程】—— Grand Challenge
■ 前置条件
· 算法类:Linux + Docker,Python 3.10+(官方打包工具 evalutils / panimg)。
· 平台组件类:按仓库 README 准备对应环境。
■ 本组件是什么
LEOPARD挑战赛的提交示例工程,演示组织算法提交所需的文件、目录与配置结构。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 为官方仓库源码包,解压后按下面方式使用。
■ 使用步骤(算法容器)
1. 解压本目录的包,进入仓库根目录。
2. 按 README 安装依赖: pip install -r requirements.txt (或 pip install -e .)
3. 用官方工具打包镜像: evalutils build (或按 README 里的 docker build 命令)。
4. 在 grand-challenge.org 算法页面把镜像提交/上传,平台会自动跑推理。
■ 使用步骤(平台组件)
1. 解压后按 README 用 docker compose 或 pip 安装运行。
■ 常用工具说明
· evalutils / panimg:官方提供的算法打包与影像格式转换工具(本目录已含源码包)。
· demo-algorithm-template:官方给的算法模板,照着它改自己的模型最快。
■ 常见问题
· 打包失败:Docker Desktop 记得开;镜像内 Python 版本与 requirements 要对齐。
· 提交后跑不出结果:输入输出接口必须按官方规范(算法要能被平台调用)。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/LEOPARD-challenge-submission-example
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「LEOPARD挑战提交示例」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/LEOPARD-challenge-submission-example
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pathology-tiger-algorithm-example · TIGER病理算法示例
util | 0.42 MB | 1 个文件
TIGER病理挑战赛的示例算法与Docker配置,演示如何打包并提交病理图像分析算法。
包含文件:pathology-tiger-algorithm-example-main.zip
安装教程(点击展开)
【TIGER病理算法示例(pathology-tiger-algorithm-example)安装教程】—— Grand Challenge
■ 前置条件
· 算法类:Linux + Docker,Python 3.10+(官方打包工具 evalutils / panimg)。
· 平台组件类:按仓库 README 准备对应环境。
■ 本组件是什么
TIGER病理挑战赛的示例算法与Docker配置,演示如何打包并提交病理图像分析算法。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 为官方仓库源码包,解压后按下面方式使用。
■ 使用步骤(算法容器)
1. 解压本目录的包,进入仓库根目录。
2. 按 README 安装依赖: pip install -r requirements.txt (或 pip install -e .)
3. 用官方工具打包镜像: evalutils build (或按 README 里的 docker build 命令)。
4. 在 grand-challenge.org 算法页面把镜像提交/上传,平台会自动跑推理。
■ 使用步骤(平台组件)
1. 解压后按 README 用 docker compose 或 pip 安装运行。
■ 常用工具说明
· evalutils / panimg:官方提供的算法打包与影像格式转换工具(本目录已含源码包)。
· demo-algorithm-template:官方给的算法模板,照着它改自己的模型最快。
■ 常见问题
· 打包失败:Docker Desktop 记得开;镜像内 Python 版本与 requirements 要对齐。
· 提交后跑不出结果:输入输出接口必须按官方规范(算法要能被平台调用)。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/pathology-tiger-algorithm-example
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「TIGER病理算法示例」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/pathology-tiger-algorithm-example
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picai_nndetection_semi_supervised_gc_algorithm · PI-CAI半监督nnDetection算法
util | 0.06 MB | 1 个文件
基于半监督nnDetection的模型,在bpMRI上完成3D临床显著前列腺癌检测与诊断,可部署于grand-challenge.org。
包含文件:picai_nndetection_semi_supervised_gc_algorithm-master.zip
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【PI-CAI半监督nnDetection算法(picai_nndetection_semi_supervised_gc_algorithm)安装教程】—— Grand Challenge
■ 前置条件
· 算法类:Linux + Docker,Python 3.10+(官方打包工具 evalutils / panimg)。
· 平台组件类:按仓库 README 准备对应环境。
■ 本组件是什么
基于半监督nnDetection的模型,在bpMRI上完成3D临床显著前列腺癌检测与诊断,可部署于grand-challenge.org。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 为官方仓库源码包,解压后按下面方式使用。
■ 使用步骤(算法容器)
1. 解压本目录的包,进入仓库根目录。
2. 按 README 安装依赖: pip install -r requirements.txt (或 pip install -e .)
3. 用官方工具打包镜像: evalutils build (或按 README 里的 docker build 命令)。
4. 在 grand-challenge.org 算法页面把镜像提交/上传,平台会自动跑推理。
■ 使用步骤(平台组件)
1. 解压后按 README 用 docker compose 或 pip 安装运行。
■ 常用工具说明
· evalutils / panimg:官方提供的算法打包与影像格式转换工具(本目录已含源码包)。
· demo-algorithm-template:官方给的算法模板,照着它改自己的模型最快。
■ 常见问题
· 打包失败:Docker Desktop 记得开;镜像内 Python 版本与 requirements 要对齐。
· 提交后跑不出结果:输入输出接口必须按官方规范(算法要能被平台调用)。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/picai_nndetection_semi_supervised_gc_algorithm
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「PI-CAI半监督nnDetection算法」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/picai_nndetection_semi_supervised_gc_algorithm
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
picai_nnunet_gc_algorithm · PI-CAI nnUNet前列腺算法
util | 0.04 MB | 1 个文件
基于nnUNet的模型,在bpMRI上进行3D临床显著前列腺癌检测与诊断,可部署到grand-challenge.org平台。
包含文件:picai_nnunet_gc_algorithm-main.zip
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【PI-CAI nnUNet前列腺算法(picai_nnunet_gc_algorithm)安装教程】—— Grand Challenge
■ 前置条件
· 算法类:Linux + Docker,Python 3.10+(官方打包工具 evalutils / panimg)。
· 平台组件类:按仓库 README 准备对应环境。
■ 本组件是什么
基于nnUNet的模型,在bpMRI上进行3D临床显著前列腺癌检测与诊断,可部署到grand-challenge.org平台。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 为官方仓库源码包,解压后按下面方式使用。
■ 使用步骤(算法容器)
1. 解压本目录的包,进入仓库根目录。
2. 按 README 安装依赖: pip install -r requirements.txt (或 pip install -e .)
3. 用官方工具打包镜像: evalutils build (或按 README 里的 docker build 命令)。
4. 在 grand-challenge.org 算法页面把镜像提交/上传,平台会自动跑推理。
■ 使用步骤(平台组件)
1. 解压后按 README 用 docker compose 或 pip 安装运行。
■ 常用工具说明
· evalutils / panimg:官方提供的算法打包与影像格式转换工具(本目录已含源码包)。
· demo-algorithm-template:官方给的算法模板,照着它改自己的模型最快。
■ 常见问题
· 打包失败:Docker Desktop 记得开;镜像内 Python 版本与 requirements 要对齐。
· 提交后跑不出结果:输入输出接口必须按官方规范(算法要能被平台调用)。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/picai_nnunet_gc_algorithm
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「PI-CAI nnUNet前列腺算法」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/picai_nnunet_gc_algorithm
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
picai_nnunet_semi_supervised_gc_algorithm · PI-CAI半监督nnUNet算法
util | 0.04 MB | 1 个文件
采用半监督训练的nnUNet模型,在bpMRI上完成3D临床显著前列腺癌的检测与诊断,支持平台部署。
包含文件:picai_nnunet_semi_supervised_gc_algorithm-master.zip
安装教程(点击展开)
【PI-CAI半监督nnUNet算法(picai_nnunet_semi_supervised_gc_algorithm)安装教程】—— Grand Challenge
■ 前置条件
· 算法类:Linux + Docker,Python 3.10+(官方打包工具 evalutils / panimg)。
· 平台组件类:按仓库 README 准备对应环境。
■ 本组件是什么
采用半监督训练的nnUNet模型,在bpMRI上完成3D临床显著前列腺癌的检测与诊断,支持平台部署。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 为官方仓库源码包,解压后按下面方式使用。
■ 使用步骤(算法容器)
1. 解压本目录的包,进入仓库根目录。
2. 按 README 安装依赖: pip install -r requirements.txt (或 pip install -e .)
3. 用官方工具打包镜像: evalutils build (或按 README 里的 docker build 命令)。
4. 在 grand-challenge.org 算法页面把镜像提交/上传,平台会自动跑推理。
■ 使用步骤(平台组件)
1. 解压后按 README 用 docker compose 或 pip 安装运行。
■ 常用工具说明
· evalutils / panimg:官方提供的算法打包与影像格式转换工具(本目录已含源码包)。
· demo-algorithm-template:官方给的算法模板,照着它改自己的模型最快。
■ 常见问题
· 打包失败:Docker Desktop 记得开;镜像内 Python 版本与 requirements 要对齐。
· 提交后跑不出结果:输入输出接口必须按官方规范(算法要能被平台调用)。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/picai_nnunet_semi_supervised_gc_algorithm
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「PI-CAI半监督nnUNet算法」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/picai_nnunet_semi_supervised_gc_algorithm
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
picai_unet_gc_algorithm · PI-CAI U-Net前列腺算法
util | 0.02 MB | 1 个文件
基于U-Net的模型,在bpMRI上进行3D临床显著前列腺癌检测与诊断,可部署于grand-challenge.org。
包含文件:picai_unet_gc_algorithm-main.zip
安装教程(点击展开)
【PI-CAI U-Net前列腺算法(picai_unet_gc_algorithm)安装教程】—— Grand Challenge
■ 前置条件
· 算法类:Linux + Docker,Python 3.10+(官方打包工具 evalutils / panimg)。
· 平台组件类:按仓库 README 准备对应环境。
■ 本组件是什么
基于U-Net的模型,在bpMRI上进行3D临床显著前列腺癌检测与诊断,可部署于grand-challenge.org。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 为官方仓库源码包,解压后按下面方式使用。
■ 使用步骤(算法容器)
1. 解压本目录的包,进入仓库根目录。
2. 按 README 安装依赖: pip install -r requirements.txt (或 pip install -e .)
3. 用官方工具打包镜像: evalutils build (或按 README 里的 docker build 命令)。
4. 在 grand-challenge.org 算法页面把镜像提交/上传,平台会自动跑推理。
■ 使用步骤(平台组件)
1. 解压后按 README 用 docker compose 或 pip 安装运行。
■ 常用工具说明
· evalutils / panimg:官方提供的算法打包与影像格式转换工具(本目录已含源码包)。
· demo-algorithm-template:官方给的算法模板,照着它改自己的模型最快。
■ 常见问题
· 打包失败:Docker Desktop 记得开;镜像内 Python 版本与 requirements 要对齐。
· 提交后跑不出结果:输入输出接口必须按官方规范(算法要能被平台调用)。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/picai_unet_gc_algorithm
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「PI-CAI U-Net前列腺算法」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/picai_unet_gc_algorithm
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
picai_unet_semi_supervised_gc_algorithm · PI-CAI半监督U-Net算法
util | 0.02 MB | 1 个文件
采用半监督训练的U-Net模型,在bpMRI上完成3D临床显著前列腺癌检测与诊断,支持平台部署。
包含文件:picai_unet_semi_supervised_gc_algorithm-main.zip
安装教程(点击展开)
【PI-CAI半监督U-Net算法(picai_unet_semi_supervised_gc_algorithm)安装教程】—— Grand Challenge
■ 前置条件
· 算法类:Linux + Docker,Python 3.10+(官方打包工具 evalutils / panimg)。
· 平台组件类:按仓库 README 准备对应环境。
■ 本组件是什么
采用半监督训练的U-Net模型,在bpMRI上完成3D临床显著前列腺癌检测与诊断,支持平台部署。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 为官方仓库源码包,解压后按下面方式使用。
■ 使用步骤(算法容器)
1. 解压本目录的包,进入仓库根目录。
2. 按 README 安装依赖: pip install -r requirements.txt (或 pip install -e .)
3. 用官方工具打包镜像: evalutils build (或按 README 里的 docker build 命令)。
4. 在 grand-challenge.org 算法页面把镜像提交/上传,平台会自动跑推理。
■ 使用步骤(平台组件)
1. 解压后按 README 用 docker compose 或 pip 安装运行。
■ 常用工具说明
· evalutils / panimg:官方提供的算法打包与影像格式转换工具(本目录已含源码包)。
· demo-algorithm-template:官方给的算法模板,照着它改自己的模型最快。
■ 常见问题
· 打包失败:Docker Desktop 记得开;镜像内 Python 版本与 requirements 要对齐。
· 提交后跑不出结果:输入输出接口必须按官方规范(算法要能被平台调用)。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/picai_unet_semi_supervised_gc_algorithm
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「PI-CAI半监督U-Net算法」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/picai_unet_semi_supervised_gc_algorithm
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
rse-gcapi · GC平台API客户端
util | 0.22 MB | 1 个文件
面向grand-challenge.org接口的Python客户端,用于访问平台数据并自动化提交与评测工作流程。
包含文件:rse-gcapi-main.zip
安装教程(点击展开)
【GC平台API客户端(rse-gcapi)安装教程】—— Grand Challenge
■ 前置条件
· 算法类:Linux + Docker,Python 3.10+(官方打包工具 evalutils / panimg)。
· 平台组件类:按仓库 README 准备对应环境。
■ 本组件是什么
面向grand-challenge.org接口的Python客户端,用于访问平台数据并自动化提交与评测工作流程。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 为官方仓库源码包,解压后按下面方式使用。
■ 使用步骤(算法容器)
1. 解压本目录的包,进入仓库根目录。
2. 按 README 安装依赖: pip install -r requirements.txt (或 pip install -e .)
3. 用官方工具打包镜像: evalutils build (或按 README 里的 docker build 命令)。
4. 在 grand-challenge.org 算法页面把镜像提交/上传,平台会自动跑推理。
■ 使用步骤(平台组件)
1. 解压后按 README 用 docker compose 或 pip 安装运行。
■ 常用工具说明
· evalutils / panimg:官方提供的算法打包与影像格式转换工具(本目录已含源码包)。
· demo-algorithm-template:官方给的算法模板,照着它改自己的模型最快。
■ 常见问题
· 打包失败:Docker Desktop 记得开;镜像内 Python 版本与 requirements 要对齐。
· 提交后跑不出结果:输入输出接口必须按官方规范(算法要能被平台调用)。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/rse-gcapi
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「GC平台API客户端」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/rse-gcapi
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
rse-grand-challenge-dicom-de-id-procedure · DICOM去标识流程
util | 5.31 MB | 1 个文件
面向Grand-Challenge.org的DICOM去标识操作流程定义,规范患者隐私数据的处理步骤,供审查与复用。
包含文件:rse-grand-challenge-dicom-de-id-procedure-main.zip
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【DICOM去标识流程(rse-grand-challenge-dicom-de-id-procedure)安装教程】—— Grand Challenge
■ 前置条件
· 算法类:Linux + Docker,Python 3.10+(官方打包工具 evalutils / panimg)。
· 平台组件类:按仓库 README 准备对应环境。
■ 本组件是什么
面向Grand-Challenge.org的DICOM去标识操作流程定义,规范患者隐私数据的处理步骤,供审查与复用。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 为官方仓库源码包,解压后按下面方式使用。
■ 使用步骤(算法容器)
1. 解压本目录的包,进入仓库根目录。
2. 按 README 安装依赖: pip install -r requirements.txt (或 pip install -e .)
3. 用官方工具打包镜像: evalutils build (或按 README 里的 docker build 命令)。
4. 在 grand-challenge.org 算法页面把镜像提交/上传,平台会自动跑推理。
■ 使用步骤(平台组件)
1. 解压后按 README 用 docker compose 或 pip 安装运行。
■ 常用工具说明
· evalutils / panimg:官方提供的算法打包与影像格式转换工具(本目录已含源码包)。
· demo-algorithm-template:官方给的算法模板,照着它改自己的模型最快。
■ 常见问题
· 打包失败:Docker Desktop 记得开;镜像内 Python 版本与 requirements 要对齐。
· 提交后跑不出结果:输入输出接口必须按官方规范(算法要能被平台调用)。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/rse-grand-challenge-dicom-de-id-procedure
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■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「DICOM去标识流程」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
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rse-grand-challenge-dicom-de-identifier · DICOM去标识Python工具
util | 0.03 MB | 1 个文件
使用预设流程对一组DICOM文件进行去标识处理的Python包,移除影像中的患者隐私信息。
包含文件:rse-grand-challenge-dicom-de-identifier-main.zip
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【DICOM去标识Python工具(rse-grand-challenge-dicom-de-identifier)安装教程】—— Grand Challenge
■ 前置条件
· 算法类:Linux + Docker,Python 3.10+(官方打包工具 evalutils / panimg)。
· 平台组件类:按仓库 README 准备对应环境。
■ 本组件是什么
使用预设流程对一组DICOM文件进行去标识处理的Python包,移除影像中的患者隐私信息。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 为官方仓库源码包,解压后按下面方式使用。
■ 使用步骤(算法容器)
1. 解压本目录的包,进入仓库根目录。
2. 按 README 安装依赖: pip install -r requirements.txt (或 pip install -e .)
3. 用官方工具打包镜像: evalutils build (或按 README 里的 docker build 命令)。
4. 在 grand-challenge.org 算法页面把镜像提交/上传,平台会自动跑推理。
■ 使用步骤(平台组件)
1. 解压后按 README 用 docker compose 或 pip 安装运行。
■ 常用工具说明
· evalutils / panimg:官方提供的算法打包与影像格式转换工具(本目录已含源码包)。
· demo-algorithm-template:官方给的算法模板,照着它改自己的模型最快。
■ 常见问题
· 打包失败:Docker Desktop 记得开;镜像内 Python 版本与 requirements 要对齐。
· 提交后跑不出结果:输入输出接口必须按官方规范(算法要能被平台调用)。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/rse-grand-challenge-dicom-de-identifier
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「DICOM去标识Python工具」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
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rse-grand-challenge-metrics · evalutils评测扩展工具
util | 0.05 MB | 1 个文件
evalutils帮助用户为grand-challenge.org创建扩展,用于实现算法评测所需的指标计算与结果打分。
包含文件:rse-grand-challenge-metrics-main.zip
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【evalutils评测扩展工具(rse-grand-challenge-metrics)安装教程】—— Grand Challenge
■ 前置条件
· 算法类:Linux + Docker,Python 3.10+(官方打包工具 evalutils / panimg)。
· 平台组件类:按仓库 README 准备对应环境。
■ 本组件是什么
evalutils帮助用户为grand-challenge.org创建扩展,用于实现算法评测所需的指标计算与结果打分。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 为官方仓库源码包,解压后按下面方式使用。
■ 使用步骤(算法容器)
1. 解压本目录的包,进入仓库根目录。
2. 按 README 安装依赖: pip install -r requirements.txt (或 pip install -e .)
3. 用官方工具打包镜像: evalutils build (或按 README 里的 docker build 命令)。
4. 在 grand-challenge.org 算法页面把镜像提交/上传,平台会自动跑推理。
■ 使用步骤(平台组件)
1. 解压后按 README 用 docker compose 或 pip 安装运行。
■ 常用工具说明
· evalutils / panimg:官方提供的算法打包与影像格式转换工具(本目录已含源码包)。
· demo-algorithm-template:官方给的算法模板,照着它改自己的模型最快。
■ 常见问题
· 打包失败:Docker Desktop 记得开;镜像内 Python 版本与 requirements 要对齐。
· 提交后跑不出结果:输入输出接口必须按官方规范(算法要能被平台调用)。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/rse-grand-challenge-metrics
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「evalutils评测扩展工具」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/rse-grand-challenge-metrics
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rse-panimg · 医学影像转MHA与TIFF
util | 4.86 MB | 1 个文件
将医学影像转换为MHA与TIFF格式,便于在Grand Challenge平台上统一读取并进行后续处理。
包含文件:rse-panimg-main.zip
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【医学影像转MHA与TIFF(rse-panimg)安装教程】—— Grand Challenge
■ 前置条件
· 算法类:Linux + Docker,Python 3.10+(官方打包工具 evalutils / panimg)。
· 平台组件类:按仓库 README 准备对应环境。
■ 本组件是什么
将医学影像转换为MHA与TIFF格式,便于在Grand Challenge平台上统一读取并进行后续处理。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 为官方仓库源码包,解压后按下面方式使用。
■ 使用步骤(算法容器)
1. 解压本目录的包,进入仓库根目录。
2. 按 README 安装依赖: pip install -r requirements.txt (或 pip install -e .)
3. 用官方工具打包镜像: evalutils build (或按 README 里的 docker build 命令)。
4. 在 grand-challenge.org 算法页面把镜像提交/上传,平台会自动跑推理。
■ 使用步骤(平台组件)
1. 解压后按 README 用 docker compose 或 pip 安装运行。
■ 常用工具说明
· evalutils / panimg:官方提供的算法打包与影像格式转换工具(本目录已含源码包)。
· demo-algorithm-template:官方给的算法模板,照着它改自己的模型最快。
■ 常见问题
· 打包失败:Docker Desktop 记得开;镜像内 Python 版本与 requirements 要对齐。
· 提交后跑不出结果:输入输出接口必须按官方规范(算法要能被平台调用)。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/rse-panimg
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「医学影像转MHA与TIFF」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/rse-panimg
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rse-panimg-models · panimg影像模型定义
util | 0.02 MB | 1 个文件
panimg的数据模型定义,描述影像转换过程中使用的数据结构,供相关扩展开发时引用。
包含文件:rse-panimg-models-main.zip
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【panimg影像模型定义(rse-panimg-models)安装教程】—— Grand Challenge
■ 前置条件
· 算法类:Linux + Docker,Python 3.10+(官方打包工具 evalutils / panimg)。
· 平台组件类:按仓库 README 准备对应环境。
■ 本组件是什么
panimg的数据模型定义,描述影像转换过程中使用的数据结构,供相关扩展开发时引用。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 为官方仓库源码包,解压后按下面方式使用。
■ 使用步骤(算法容器)
1. 解压本目录的包,进入仓库根目录。
2. 按 README 安装依赖: pip install -r requirements.txt (或 pip install -e .)
3. 用官方工具打包镜像: evalutils build (或按 README 里的 docker build 命令)。
4. 在 grand-challenge.org 算法页面把镜像提交/上传,平台会自动跑推理。
■ 使用步骤(平台组件)
1. 解压后按 README 用 docker compose 或 pip 安装运行。
■ 常用工具说明
· evalutils / panimg:官方提供的算法打包与影像格式转换工具(本目录已含源码包)。
· demo-algorithm-template:官方给的算法模板,照着它改自己的模型最快。
■ 常见问题
· 打包失败:Docker Desktop 记得开;镜像内 Python 版本与 requirements 要对齐。
· 提交后跑不出结果:输入输出接口必须按官方规范(算法要能被平台调用)。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/rse-panimg-models
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「panimg影像模型定义」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/DIAGNijmegen/rse-panimg-models
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
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