PLIP 插件合集（共 5 个）

【晶体文件转换管道（cif2plip）安装教程】—— PLIP

■ 前置条件
   · 已装 PLIP（pip install plip；PyMOL/Chimera 插件需先装宿主软件）。

■ 本扩展是什么
   把 AlphaFold3、Boltz-2 等共折叠工具输出的 ModelCIF 转换为标准 PDB 并调用 PLIP 分析相互作用，修复链号与成键表问题，输出 XML、CSV 与 PyMOL 会话文件。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是插件/脚本源码（PyMOL 插件、统计脚本或 Python 扩展库）。

■ 安装步骤
   1. Python 扩展库：pip install 包内目录（或 pip install 包名，如 plipify）。
   2. PyMOL 插件：解压后把插件目录/脚本加入 PyMOL 插件目录，或用 Plugin → Plugin Manager → Install 安装。
   3. Chimera 类插件：按 README 放入 Chimera 的 Tools 目录。
   4. 输入 PDB 结构即可得到相互作用报告（文本/表格/图片）。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「晶体文件转换管道」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/bellcheddar/cif2plip
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【分子可视化交互面板（PLIP-pymol-plugin）安装教程】—— PLIP

■ 前置条件
   · 已装 PLIP（pip install plip；PyMOL/Chimera 插件需先装宿主软件）。

■ 本扩展是什么
   社区项目 BetaPLIP 的 PyMOL 插件，提供图形界面在本地运行 PLIP 并交互查看蛋白-配体相互作用结果，免去命令行操作，兼容 PyMOL 官方与开源版本。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是插件/脚本源码（PyMOL 插件、统计脚本或 Python 扩展库）。

■ 安装步骤
   1. Python 扩展库：pip install 包内目录（或 pip install 包名，如 plipify）。
   2. PyMOL 插件：解压后把插件目录/脚本加入 PyMOL 插件目录，或用 Plugin → Plugin Manager → Install 安装。
   3. Chimera 类插件：按 README 放入 Chimera 的 Tools 目录。
   4. 输入 PDB 结构即可得到相互作用报告（文本/表格/图片）。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「分子可视化交互面板」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/nimstepf/PLIP-pymol-plugin
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【相互作用频率指纹（plipify）安装教程】—— PLIP

■ 前置条件
   · 已装 PLIP（pip install plip；PyMOL/Chimera 插件需先装宿主软件）。

■ 本扩展是什么
   Volkamer 实验室开发的 Python 库，封装 PLIP 批量计算多个结构，把蛋白-配体相互作用映射为频率指纹并可视化，用于识别结合热点。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是插件/脚本源码（PyMOL 插件、统计脚本或 Python 扩展库）。

■ 安装步骤
   1. Python 扩展库：pip install 包内目录（或 pip install 包名，如 plipify）。
   2. PyMOL 插件：解压后把插件目录/脚本加入 PyMOL 插件目录，或用 Plugin → Plugin Manager → Install 安装。
   3. Chimera 类插件：按 README 放入 Chimera 的 Tools 目录。
   4. 输入 PDB 结构即可得到相互作用报告（文本/表格/图片）。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「相互作用频率指纹」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/volkamerlab/plipify
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【相互作用统计脚本（plipinteractor）安装教程】—— PLIP

■ 前置条件
   · 已装 PLIP（pip install plip；PyMOL/Chimera 插件需先装宿主软件）。

■ 本扩展是什么
   基于 Pandas 的脚本集，按原子、残基、链等层级整理并统计 PLIP 输出的相互作用结果，可计算多次模拟之间的均值与标准差，便于批量汇总分析。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是插件/脚本源码（PyMOL 插件、统计脚本或 Python 扩展库）。

■ 安装步骤
   1. Python 扩展库：pip install 包内目录（或 pip install 包名，如 plipify）。
   2. PyMOL 插件：解压后把插件目录/脚本加入 PyMOL 插件目录，或用 Plugin → Plugin Manager → Install 安装。
   3. Chimera 类插件：按 README 放入 Chimera 的 Tools 目录。
   4. 输入 PDB 结构即可得到相互作用报告（文本/表格/图片）。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「相互作用统计脚本」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/aolgac/plipinteractor
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【嵌合体交互分析面板（tangram_plipgui）安装教程】—— PLIP

■ 前置条件
   · 已装 PLIP（pip install plip；PyMOL/Chimera 插件需先装宿主软件）。

■ 本扩展是什么
   InsiliChem 团队为 UCSF Chimera 开发的图形界面扩展，调用 PLIP 后端计算并展示蛋白-配体相互作用，需预先安装 PLIP 与 OpenBabel 依赖。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是插件/脚本源码（PyMOL 插件、统计脚本或 Python 扩展库）。

■ 安装步骤
   1. Python 扩展库：pip install 包内目录（或 pip install 包名，如 plipify）。
   2. PyMOL 插件：解压后把插件目录/脚本加入 PyMOL 插件目录，或用 Plugin → Plugin Manager → Install 安装。
   3. Chimera 类插件：按 README 放入 Chimera 的 Tools 目录。
   4. 输入 PDB 结构即可得到相互作用报告（文本/表格/图片）。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「嵌合体交互分析面板」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/insilichem/tangram_plipgui
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。