OpenMM 插件合集(共 20 个)
分子动力学工具包(官方与社区插件) | 分类:分子与网络分析 | 每个插件都附中文说明与安装教程,下载走百度网盘 / 夸克网盘。
插件清单
meld-openmm-plugin · 多尺度采样插件
util | 0.08 MB | 1 个文件
社区插件,为 OpenMM 提供 MELD 多尺度增强采样方法,用于加速蛋白质折叠等复杂构象的搜索过程。
包含文件:meld-openmm-plugin-master.zip
安装教程(点击展开)
【多尺度采样插件(meld-openmm-plugin)安装教程】—— OpenMM
■ 前置条件
· 已装 OpenMM(conda 或 pip 安装,Python 环境可用 import openmm)。
■ 本扩展是什么
社区插件,为 OpenMM 提供 MELD 多尺度增强采样方法,用于加速蛋白质折叠等复杂构象的搜索过程。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是插件源码(C++/CUDA 内核、CMake 构建脚本、Python 接口)。
■ 安装步骤
1. 官方与多数社区插件可用 conda/pip 直接安装(如 conda install -c conda-forge openmm-plumed)。
2. 需要自行编译的插件:解压后用 CMake 配置(指定 OpenMM_DIR)并编译安装。
3. Python 里 import 对应模块(如 openmmtorch、openmmml)后即可在力场/积分器里使用。
4. 报错缺少符号时,确认 OpenMM 与插件版本一致。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「多尺度采样插件」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/maccallumlab/meld-openmm-plugin
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
mlipops · 机器学习势函数算子
util | 0.54 MB | 1 个文件
OpenMM 官方 PyTorch 算符库,用于构建机器学习原子间势能模型,并提供高效的计算与训练支持。
包含文件:mlipops-main.zip
安装教程(点击展开)
【机器学习势函数算子(mlipops)安装教程】—— OpenMM
■ 前置条件
· 已装 OpenMM(conda 或 pip 安装,Python 环境可用 import openmm)。
■ 本扩展是什么
OpenMM 官方 PyTorch 算符库,用于构建机器学习原子间势能模型,并提供高效的计算与训练支持。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是插件源码(C++/CUDA 内核、CMake 构建脚本、Python 接口)。
■ 安装步骤
1. 官方与多数社区插件可用 conda/pip 直接安装(如 conda install -c conda-forge openmm-plumed)。
2. 需要自行编译的插件:解压后用 CMake 配置(指定 OpenMM_DIR)并编译安装。
3. Python 里 import 对应模块(如 openmmtorch、openmmml)后即可在力场/积分器里使用。
4. 报错缺少符号时,确认 OpenMM 与插件版本一致。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「机器学习势函数算子」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/openmm/mlipops
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
NNPOps · 神经网络势能算子
util | 0.84 MB | 1 个文件
OpenMM 官方高性能算符库,为神经网络势能提供优化实现,显著加速分子模拟中的机器学习计算。
包含文件:NNPOps-master.zip
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【神经网络势能算子(NNPOps)安装教程】—— OpenMM
■ 前置条件
· 已装 OpenMM(conda 或 pip 安装,Python 环境可用 import openmm)。
■ 本扩展是什么
OpenMM 官方高性能算符库,为神经网络势能提供优化实现,显著加速分子模拟中的机器学习计算。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是插件源码(C++/CUDA 内核、CMake 构建脚本、Python 接口)。
■ 安装步骤
1. 官方与多数社区插件可用 conda/pip 直接安装(如 conda install -c conda-forge openmm-plumed)。
2. 需要自行编译的插件:解压后用 CMake 配置(指定 OpenMM_DIR)并编译安装。
3. Python 里 import 对应模块(如 openmmtorch、openmmml)后即可在力场/积分器里使用。
4. 报错缺少符号时,确认 OpenMM 与插件版本一致。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「神经网络势能算子」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/openmm/NNPOps
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
openmm-atmmetaforce-plugin · 炼金转移势插件
util | 3.06 MB | 1 个文件
社区插件,实现炼金转移势与元动力学方法,用于高效计算配体结合自由能与溶剂化自由能。
包含文件:openmm-atmmetaforce-plugin-main.zip
安装教程(点击展开)
【炼金转移势插件(openmm-atmmetaforce-plugin)安装教程】—— OpenMM
■ 前置条件
· 已装 OpenMM(conda 或 pip 安装,Python 环境可用 import openmm)。
■ 本扩展是什么
社区插件,实现炼金转移势与元动力学方法,用于高效计算配体结合自由能与溶剂化自由能。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是插件源码(C++/CUDA 内核、CMake 构建脚本、Python 接口)。
■ 安装步骤
1. 官方与多数社区插件可用 conda/pip 直接安装(如 conda install -c conda-forge openmm-plumed)。
2. 需要自行编译的插件:解压后用 CMake 配置(指定 OpenMM_DIR)并编译安装。
3. Python 里 import 对应模块(如 openmmtorch、openmmml)后即可在力场/积分器里使用。
4. 报错缺少符号时,确认 OpenMM 与插件版本一致。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「炼金转移势插件」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/Gallicchio-Lab/openmm-atmmetaforce-plugin
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
openmm-cph · 恒定酸碱度模拟插件
util | 0.14 MB | 1 个文件
OpenMM 官方插件,实现恒定酸碱度的分子动力学模拟,可在仿真过程中动态处理质子的加合与解离。
包含文件:openmm-cph-main.zip
安装教程(点击展开)
【恒定酸碱度模拟插件(openmm-cph)安装教程】—— OpenMM
■ 前置条件
· 已装 OpenMM(conda 或 pip 安装,Python 环境可用 import openmm)。
■ 本扩展是什么
OpenMM 官方插件,实现恒定酸碱度的分子动力学模拟,可在仿真过程中动态处理质子的加合与解离。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是插件源码(C++/CUDA 内核、CMake 构建脚本、Python 接口)。
■ 安装步骤
1. 官方与多数社区插件可用 conda/pip 直接安装(如 conda install -c conda-forge openmm-plumed)。
2. 需要自行编译的插件:解压后用 CMake 配置(指定 OpenMM_DIR)并编译安装。
3. Python 里 import 对应模块(如 openmmtorch、openmmml)后即可在力场/积分器里使用。
4. 报错缺少符号时,确认 OpenMM 与插件版本一致。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「恒定酸碱度模拟插件」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/openmm/openmm-cph
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
openmm-dlext · 数组数据接口插件
util | 0.04 MB | 1 个文件
社区插件,通过 DLPack 标准把 OpenMM 的仿真数据映射为数组接口,方便与机器学习框架进行数据交换。
包含文件:openmm-dlext-main.zip
安装教程(点击展开)
【数组数据接口插件(openmm-dlext)安装教程】—— OpenMM
■ 前置条件
· 已装 OpenMM(conda 或 pip 安装,Python 环境可用 import openmm)。
■ 本扩展是什么
社区插件,通过 DLPack 标准把 OpenMM 的仿真数据映射为数组接口,方便与机器学习框架进行数据交换。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是插件源码(C++/CUDA 内核、CMake 构建脚本、Python 接口)。
■ 安装步骤
1. 官方与多数社区插件可用 conda/pip 直接安装(如 conda install -c conda-forge openmm-plumed)。
2. 需要自行编译的插件:解压后用 CMake 配置(指定 OpenMM_DIR)并编译安装。
3. Python 里 import 对应模块(如 openmmtorch、openmmml)后即可在力场/积分器里使用。
4. 报错缺少符号时,确认 OpenMM 与插件版本一致。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「数组数据接口插件」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/SSAGESLabs/openmm-dlext
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
openmm-mdanalysis-reporter · 轨迹分析报告器
util | 0.64 MB | 1 个文件
社区报告器插件,在 OpenMM 模拟过程中实时把轨迹输出给 MDAnalysis,便于在线分析与轨迹记录。
包含文件:openmm-mdanalysis-reporter-main.zip
安装教程(点击展开)
【轨迹分析报告器(openmm-mdanalysis-reporter)安装教程】—— OpenMM
■ 前置条件
· 已装 OpenMM(conda 或 pip 安装,Python 环境可用 import openmm)。
■ 本扩展是什么
社区报告器插件,在 OpenMM 模拟过程中实时把轨迹输出给 MDAnalysis,便于在线分析与轨迹记录。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是插件源码(C++/CUDA 内核、CMake 构建脚本、Python 接口)。
■ 安装步骤
1. 官方与多数社区插件可用 conda/pip 直接安装(如 conda install -c conda-forge openmm-plumed)。
2. 需要自行编译的插件:解压后用 CMake 配置(指定 OpenMM_DIR)并编译安装。
3. Python 里 import 对应模块(如 openmmtorch、openmmml)后即可在力场/积分器里使用。
4. 报错缺少符号时,确认 OpenMM 与插件版本一致。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「轨迹分析报告器」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/sef43/openmm-mdanalysis-reporter
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
openmm-ml · 机器学习模型接口
util | 4.22 MB | 1 个文件
OpenMM 官方高层接口,统一加载并使用各类机器学习势能模型,简化机器学习力场在 OpenMM 中的部署。
包含文件:openmm-ml-main.zip
安装教程(点击展开)
【机器学习模型接口(openmm-ml)安装教程】—— OpenMM
■ 前置条件
· 已装 OpenMM(conda 或 pip 安装,Python 环境可用 import openmm)。
■ 本扩展是什么
OpenMM 官方高层接口,统一加载并使用各类机器学习势能模型,简化机器学习力场在 OpenMM 中的部署。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是插件源码(C++/CUDA 内核、CMake 构建脚本、Python 接口)。
■ 安装步骤
1. 官方与多数社区插件可用 conda/pip 直接安装(如 conda install -c conda-forge openmm-plumed)。
2. 需要自行编译的插件:解压后用 CMake 配置(指定 OpenMM_DIR)并编译安装。
3. Python 里 import 对应模块(如 openmmtorch、openmmml)后即可在力场/积分器里使用。
4. 报错缺少符号时,确认 OpenMM 与插件版本一致。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「机器学习模型接口」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/openmm/openmm-ml
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
openmm-onnx · ONNX 模型力场插件
util | 0.04 MB | 1 个文件
OpenMM 官方插件,支持在 OpenMM 仿真中加载并运行 ONNX 格式的机器学习模型,用其来定义原子间作用力。
包含文件:openmm-onnx-main.zip
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【ONNX 模型力场插件(openmm-onnx)安装教程】—— OpenMM
■ 前置条件
· 已装 OpenMM(conda 或 pip 安装,Python 环境可用 import openmm)。
■ 本扩展是什么
OpenMM 官方插件,支持在 OpenMM 仿真中加载并运行 ONNX 格式的机器学习模型,用其来定义原子间作用力。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是插件源码(C++/CUDA 内核、CMake 构建脚本、Python 接口)。
■ 安装步骤
1. 官方与多数社区插件可用 conda/pip 直接安装(如 conda install -c conda-forge openmm-plumed)。
2. 需要自行编译的插件:解压后用 CMake 配置(指定 OpenMM_DIR)并编译安装。
3. Python 里 import 对应模块(如 openmmtorch、openmmml)后即可在力场/积分器里使用。
4. 报错缺少符号时,确认 OpenMM 与插件版本一致。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「ONNX 模型力场插件」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/openmm/openmm-onnx
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
openmm-plumed · PLUMED 增强采样接口
util | 5.48 MB | 1 个文件
OpenMM 官方插件,把 PLUMED 增强采样库接入 OpenMM 仿真,支持元动力学、伞形采样与自由能计算。
包含文件:openmm-plumed-master.zip
安装教程(点击展开)
【PLUMED 增强采样接口(openmm-plumed)安装教程】—— OpenMM
■ 前置条件
· 已装 OpenMM(conda 或 pip 安装,Python 环境可用 import openmm)。
■ 本扩展是什么
OpenMM 官方插件,把 PLUMED 增强采样库接入 OpenMM 仿真,支持元动力学、伞形采样与自由能计算。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是插件源码(C++/CUDA 内核、CMake 构建脚本、Python 接口)。
■ 安装步骤
1. 官方与多数社区插件可用 conda/pip 直接安装(如 conda install -c conda-forge openmm-plumed)。
2. 需要自行编译的插件:解压后用 CMake 配置(指定 OpenMM_DIR)并编译安装。
3. Python 里 import 对应模块(如 openmmtorch、openmmml)后即可在力场/积分器里使用。
4. 报错缺少符号时,确认 OpenMM 与插件版本一致。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「PLUMED 增强采样接口」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/openmm/openmm-plumed
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
openmm-setup · 模拟图形配置工具
util | 0.3 MB | 1 个文件
OpenMM 官方图形界面工具,帮助用户可视化配置并运行分子动力学模拟,自动生成可执行的模拟脚本。
包含文件:openmm-setup-master.zip
安装教程(点击展开)
【模拟图形配置工具(openmm-setup)安装教程】—— OpenMM
■ 前置条件
· 已装 OpenMM(conda 或 pip 安装,Python 环境可用 import openmm)。
■ 本扩展是什么
OpenMM 官方图形界面工具,帮助用户可视化配置并运行分子动力学模拟,自动生成可执行的模拟脚本。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是插件源码(C++/CUDA 内核、CMake 构建脚本、Python 接口)。
■ 安装步骤
1. 官方与多数社区插件可用 conda/pip 直接安装(如 conda install -c conda-forge openmm-plumed)。
2. 需要自行编译的插件:解压后用 CMake 配置(指定 OpenMM_DIR)并编译安装。
3. Python 里 import 对应模块(如 openmmtorch、openmmml)后即可在力场/积分器里使用。
4. 报错缺少符号时,确认 OpenMM 与插件版本一致。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「模拟图形配置工具」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/openmm/openmm-setup
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
openmm-tensorflow · TensorFlow 力场插件
util | 0.11 MB | 1 个文件
OpenMM 官方插件,允许使用 TensorFlow 计算神经网络力场,为 OpenMM 仿真提供机器学习势能支持。
包含文件:openmm-tensorflow-master.zip
安装教程(点击展开)
【TensorFlow 力场插件(openmm-tensorflow)安装教程】—— OpenMM
■ 前置条件
· 已装 OpenMM(conda 或 pip 安装,Python 环境可用 import openmm)。
■ 本扩展是什么
OpenMM 官方插件,允许使用 TensorFlow 计算神经网络力场,为 OpenMM 仿真提供机器学习势能支持。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是插件源码(C++/CUDA 内核、CMake 构建脚本、Python 接口)。
■ 安装步骤
1. 官方与多数社区插件可用 conda/pip 直接安装(如 conda install -c conda-forge openmm-plumed)。
2. 需要自行编译的插件:解压后用 CMake 配置(指定 OpenMM_DIR)并编译安装。
3. Python 里 import 对应模块(如 openmmtorch、openmmml)后即可在力场/积分器里使用。
4. 报错缺少符号时,确认 OpenMM 与插件版本一致。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「TensorFlow 力场插件」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/openmm/openmm-tensorflow
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
openmm-tensorrt · TensorRT 加速力场插件
util | 0.04 MB | 1 个文件
OpenMM 官方插件,使用 TensorRT 计算图定义力场,在显卡上加速机器学习势能的推理与分子动力学模拟。
包含文件:openmm-tensorrt-master.zip
安装教程(点击展开)
【TensorRT 加速力场插件(openmm-tensorrt)安装教程】—— OpenMM
■ 前置条件
· 已装 OpenMM(conda 或 pip 安装,Python 环境可用 import openmm)。
■ 本扩展是什么
OpenMM 官方插件,使用 TensorRT 计算图定义力场,在显卡上加速机器学习势能的推理与分子动力学模拟。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是插件源码(C++/CUDA 内核、CMake 构建脚本、Python 接口)。
■ 安装步骤
1. 官方与多数社区插件可用 conda/pip 直接安装(如 conda install -c conda-forge openmm-plumed)。
2. 需要自行编译的插件:解压后用 CMake 配置(指定 OpenMM_DIR)并编译安装。
3. Python 里 import 对应模块(如 openmmtorch、openmmml)后即可在力场/积分器里使用。
4. 报错缺少符号时,确认 OpenMM 与插件版本一致。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「TensorRT 加速力场插件」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/openmm/openmm-tensorrt
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
openmm-torch · PyTorch 力场插件
util | 0.13 MB | 1 个文件
OpenMM 官方插件,通过 PyTorch 定义神经网络势能,在分子模拟中直接调用训练好的机器学习力场模型。
包含文件:openmm-torch-master.zip
安装教程(点击展开)
【PyTorch 力场插件(openmm-torch)安装教程】—— OpenMM
■ 前置条件
· 已装 OpenMM(conda 或 pip 安装,Python 环境可用 import openmm)。
■ 本扩展是什么
OpenMM 官方插件,通过 PyTorch 定义神经网络势能,在分子模拟中直接调用训练好的机器学习力场模型。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是插件源码(C++/CUDA 内核、CMake 构建脚本、Python 接口)。
■ 安装步骤
1. 官方与多数社区插件可用 conda/pip 直接安装(如 conda install -c conda-forge openmm-plumed)。
2. 需要自行编译的插件:解压后用 CMake 配置(指定 OpenMM_DIR)并编译安装。
3. Python 里 import 对应模块(如 openmmtorch、openmmml)后即可在力场/积分器里使用。
4. 报错缺少符号时,确认 OpenMM 与插件版本一致。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「PyTorch 力场插件」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/openmm/openmm-torch
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
openmm-xtb · xTB 半经验力场接口
util | 0.04 MB | 1 个文件
OpenMM 官方插件,封装 xTB 半经验量子化学程序,为分子动力学模拟提供半经验级别的势能与受力计算。
包含文件:openmm-xtb-main.zip
安装教程(点击展开)
【xTB 半经验力场接口(openmm-xtb)安装教程】—— OpenMM
■ 前置条件
· 已装 OpenMM(conda 或 pip 安装,Python 环境可用 import openmm)。
■ 本扩展是什么
OpenMM 官方插件,封装 xTB 半经验量子化学程序,为分子动力学模拟提供半经验级别的势能与受力计算。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是插件源码(C++/CUDA 内核、CMake 构建脚本、Python 接口)。
■ 安装步骤
1. 官方与多数社区插件可用 conda/pip 直接安装(如 conda install -c conda-forge openmm-plumed)。
2. 需要自行编译的插件:解压后用 CMake 配置(指定 OpenMM_DIR)并编译安装。
3. Python 里 import 对应模块(如 openmmtorch、openmmml)后即可在力场/积分器里使用。
4. 报错缺少符号时,确认 OpenMM 与插件版本一致。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「xTB 半经验力场接口」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/openmm/openmm-xtb
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
openmm_agbnp_plugin · 隐式溶剂 AGBNP 插件
util | 4.56 MB | 1 个文件
社区插件,为 OpenMM 加入 AGBNP 隐式溶剂模型,用于加速生物大分子在水环境中的分子动力学模拟。
包含文件:openmm_agbnp_plugin-master.zip
安装教程(点击展开)
【隐式溶剂 AGBNP 插件(openmm_agbnp_plugin)安装教程】—— OpenMM
■ 前置条件
· 已装 OpenMM(conda 或 pip 安装,Python 环境可用 import openmm)。
■ 本扩展是什么
社区插件,为 OpenMM 加入 AGBNP 隐式溶剂模型,用于加速生物大分子在水环境中的分子动力学模拟。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是插件源码(C++/CUDA 内核、CMake 构建脚本、Python 接口)。
■ 安装步骤
1. 官方与多数社区插件可用 conda/pip 直接安装(如 conda install -c conda-forge openmm-plumed)。
2. 需要自行编译的插件:解压后用 CMake 配置(指定 OpenMM_DIR)并编译安装。
3. Python 里 import 对应模块(如 openmmtorch、openmmml)后即可在力场/积分器里使用。
4. 报错缺少符号时,确认 OpenMM 与插件版本一致。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「隐式溶剂 AGBNP 插件」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/Gallicchio-Lab/openmm_agbnp_plugin
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
openmmexampleplugin · 插件开发示例
util | 0.06 MB | 1 个文件
OpenMM 官方提供的插件开发示例,完整演示如何编写、编译并注册一个自定义的 OpenMM 功能插件。
包含文件:openmmexampleplugin-master.zip
安装教程(点击展开)
【插件开发示例(openmmexampleplugin)安装教程】—— OpenMM
■ 前置条件
· 已装 OpenMM(conda 或 pip 安装,Python 环境可用 import openmm)。
■ 本扩展是什么
OpenMM 官方提供的插件开发示例,完整演示如何编写、编译并注册一个自定义的 OpenMM 功能插件。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是插件源码(C++/CUDA 内核、CMake 构建脚本、Python 接口)。
■ 安装步骤
1. 官方与多数社区插件可用 conda/pip 直接安装(如 conda install -c conda-forge openmm-plumed)。
2. 需要自行编译的插件:解压后用 CMake 配置(指定 OpenMM_DIR)并编译安装。
3. Python 里 import 对应模块(如 openmmtorch、openmmml)后即可在力场/积分器里使用。
4. 报错缺少符号时,确认 OpenMM 与插件版本一致。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「插件开发示例」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/openmm/openmmexampleplugin
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
openmmforcefields · 分子力场扩展库
util | 31.61 MB | 1 个文件
OpenMM 官方力场扩展库,补充 CHARMM 与 AMBER 系列力场并支持小分子参数化,方便搭建复杂模拟体系。
包含文件:openmmforcefields-main.zip
安装教程(点击展开)
【分子力场扩展库(openmmforcefields)安装教程】—— OpenMM
■ 前置条件
· 已装 OpenMM(conda 或 pip 安装,Python 环境可用 import openmm)。
■ 本扩展是什么
OpenMM 官方力场扩展库,补充 CHARMM 与 AMBER 系列力场并支持小分子参数化,方便搭建复杂模拟体系。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是插件源码(C++/CUDA 内核、CMake 构建脚本、Python 接口)。
■ 安装步骤
1. 官方与多数社区插件可用 conda/pip 直接安装(如 conda install -c conda-forge openmm-plumed)。
2. 需要自行编译的插件:解压后用 CMake 配置(指定 OpenMM_DIR)并编译安装。
3. Python 里 import 对应模块(如 openmmtorch、openmmml)后即可在力场/积分器里使用。
4. 报错缺少符号时,确认 OpenMM 与插件版本一致。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「分子力场扩展库」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/openmm/openmmforcefields
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
openmmtools · 模拟增强采样工具集
util | 11.75 MB | 1 个文件
社区常用工具库,提供热力学态、增强采样与自由能计算等高层工具,大幅简化 OpenMM 模拟的设置流程。
包含文件:openmmtools-main.zip
安装教程(点击展开)
【模拟增强采样工具集(openmmtools)安装教程】—— OpenMM
■ 前置条件
· 已装 OpenMM(conda 或 pip 安装,Python 环境可用 import openmm)。
■ 本扩展是什么
社区常用工具库,提供热力学态、增强采样与自由能计算等高层工具,大幅简化 OpenMM 模拟的设置流程。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是插件源码(C++/CUDA 内核、CMake 构建脚本、Python 接口)。
■ 安装步骤
1. 官方与多数社区插件可用 conda/pip 直接安装(如 conda install -c conda-forge openmm-plumed)。
2. 需要自行编译的插件:解压后用 CMake 配置(指定 OpenMM_DIR)并编译安装。
3. Python 里 import 对应模块(如 openmmtorch、openmmml)后即可在力场/积分器里使用。
4. 报错缺少符号时,确认 OpenMM 与插件版本一致。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「模拟增强采样工具集」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/choderalab/openmmtools
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
pdbfixer · PDB 结构修复工具
util | 0.67 MB | 1 个文件
OpenMM 官方配套工具,自动修复 PDB 文件中缺失的原子、残基与氢原子等问题,便于模拟前预处理。
包含文件:pdbfixer-master.zip
安装教程(点击展开)
【PDB 结构修复工具(pdbfixer)安装教程】—— OpenMM
■ 前置条件
· 已装 OpenMM(conda 或 pip 安装,Python 环境可用 import openmm)。
■ 本扩展是什么
OpenMM 官方配套工具,自动修复 PDB 文件中缺失的原子、残基与氢原子等问题,便于模拟前预处理。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是插件源码(C++/CUDA 内核、CMake 构建脚本、Python 接口)。
■ 安装步骤
1. 官方与多数社区插件可用 conda/pip 直接安装(如 conda install -c conda-forge openmm-plumed)。
2. 需要自行编译的插件:解压后用 CMake 配置(指定 OpenMM_DIR)并编译安装。
3. Python 里 import 对应模块(如 openmmtorch、openmmml)后即可在力场/积分器里使用。
4. 报错缺少符号时,确认 OpenMM 与插件版本一致。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「PDB 结构修复工具」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/openmm/pdbfixer
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
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