Molsoft ICM 插件合集（共 9 个）

【突变预测描述符脚本（CompoMug）安装教程】—— Molsoft ICM

■ 前置条件
   · 已装 Molsoft ICM（正版授权）。

■ 本扩展是什么
   发表于 eLife 的 CompoMug 官方仓库，提供基于 ICM 的突变描述符提取脚本，用于预测并优化受体等蛋白的稳定化突变。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是社区 ICM 脚本集（.icm 脚本、.sh/.py 配套脚本）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. ICM 里菜单 File → Load Script 选择 .icm 脚本；或用 icm-shell 命令行执行。
   3. 按脚本说明准备输入结构文件（PDB/SDF 等）与工作目录。
   4. 运行后结果（对接构象、打分表、图片）在脚本输出目录。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「突变预测描述符脚本」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/elifesciences-publications/CompoMug
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【突变稳定化预测脚本（CompoMug_v1.1）安装教程】—— Molsoft ICM

■ 前置条件
   · 已装 Molsoft ICM（正版授权）。

■ 本扩展是什么
   CompoMug 突变稳定化预测的描述符脚本，用 ICM 计算蛋白点突变的结构描述符，支撑机器学习预测膜蛋白稳定化突变。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是社区 ICM 脚本集（.icm 脚本、.sh/.py 配套脚本）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. ICM 里菜单 File → Load Script 选择 .icm 脚本；或用 icm-shell 命令行执行。
   3. 按脚本说明准备输入结构文件（PDB/SDF 等）与工作目录。
   4. 运行后结果（对接构象、打分表、图片）在脚本输出目录。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「突变稳定化预测脚本」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/katritchlab/CompoMug_v1.1
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【批量对接脚本集（docking-scripts）安装教程】—— Molsoft ICM

■ 前置条件
   · 已装 Molsoft ICM（正版授权）。

■ 本扩展是什么
   面向 ICM-Pro 的批量对接辅助脚本，用 Perl 与 Python 封装多配体分子对接与多次对接任务的批量提交，简化重复对接操作。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是社区 ICM 脚本集（.icm 脚本、.sh/.py 配套脚本）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. ICM 里菜单 File → Load Script 选择 .icm 脚本；或用 icm-shell 命令行执行。
   3. 按脚本说明准备输入结构文件（PDB/SDF 等）与工作目录。
   4. 运行后结果（对接构象、打分表、图片）在脚本输出目录。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「批量对接脚本集」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/sorinlab/docking-scripts
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【交联整合建模脚本（IcmXlink）安装教程】—— Molsoft ICM

■ 前置条件
   · 已装 Molsoft ICM（正版授权）。

■ 本扩展是什么
   ICM 交联质谱整合建模脚本组，把交联约束读入结构并进行变量显示、最小化、蒙特卡洛采样与性能评估，支撑整合结构建模。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是社区 ICM 脚本集（.icm 脚本、.sh/.py 配套脚本）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. ICM 里菜单 File → Load Script 选择 .icm 脚本；或用 icm-shell 命令行执行。
   3. 按脚本说明准备输入结构文件（PDB/SDF 等）与工作目录。
   4. 运行后结果（对接构象、打分表、图片）在脚本输出目录。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「交联整合建模脚本」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/jhmlam/MolsoftUnofficial
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【突变效应分析脚本（MutationEffect）安装教程】—— Molsoft ICM

■ 前置条件
   · 已装 Molsoft ICM（正版授权）。

■ 本扩展是什么
   ICM 突变效应分析脚本组，可批量尝试氨基酸突变、整理输出表格并并置对比结构，用于评估点突变对蛋白结构的影响。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是社区 ICM 脚本集（.icm 脚本、.sh/.py 配套脚本）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. ICM 里菜单 File → Load Script 选择 .icm 脚本；或用 icm-shell 命令行执行。
   3. 按脚本说明准备输入结构文件（PDB/SDF 等）与工作目录。
   4. 运行后结果（对接构象、打分表、图片）在脚本输出目录。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「突变效应分析脚本」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/jhmlam/MolsoftUnofficial
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【对接建库脚本工具集（PyIcmDocking）安装教程】—— Molsoft ICM

■ 前置条件
   · 已装 Molsoft ICM（正版授权）。

■ 本扩展是什么
   Python 驱动的 ICM 对接工具集，含受体与配体预处理、格点图生成、批量对接的脚本模板与集群作业调度脚本，面向大规模虚拟筛选流程。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是社区 ICM 脚本集（.icm 脚本、.sh/.py 配套脚本）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. ICM 里菜单 File → Load Script 选择 .icm 脚本；或用 icm-shell 命令行执行。
   3. 按脚本说明准备输入结构文件（PDB/SDF 等）与工作目录。
   4. 运行后结果（对接构象、打分表、图片）在脚本输出目录。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「对接建库脚本工具集」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/jhmlam/PyIcmDocking
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【脚本编程工作坊（ScriptingWorkshop2010）安装教程】—— Molsoft ICM

■ 前置条件
   · 已装 Molsoft ICM（正版授权）。

■ 本扩展是什么
   Molsoft 2010 年 ICM 脚本编程工作坊资料包，含教学用脚本与示例数据，用于学习 ICM 脚本语言与建模流程自动化。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是社区 ICM 脚本集（.icm 脚本、.sh/.py 配套脚本）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. ICM 里菜单 File → Load Script 选择 .icm 脚本；或用 icm-shell 命令行执行。
   3. 按脚本说明准备输入结构文件（PDB/SDF 等）与工作目录。
   4. 运行后结果（对接构象、打分表、图片）在脚本输出目录。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「脚本编程工作坊」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/jhmlam/MolsoftUnofficial
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【虚拟筛选流程脚本（V-SYNTHES）安装教程】—— Molsoft ICM

■ 前置条件
   · 已装 Molsoft ICM（正版授权）。

■ 本扩展是什么
   V-SYNTHES 虚拟筛选流程的 ICM 脚本，涵盖片段枚举、过滤、对接启动与命中加载索引，用于超大化学库的合成可行空间筛选。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是社区 ICM 脚本集（.icm 脚本、.sh/.py 配套脚本）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. ICM 里菜单 File → Load Script 选择 .icm 脚本；或用 icm-shell 命令行执行。
   3. 按脚本说明准备输入结构文件（PDB/SDF 等）与工作目录。
   4. 运行后结果（对接构象、打分表、图片）在脚本输出目录。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「虚拟筛选流程脚本」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/katritchlab/V-SYNTHES
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【虚拟筛选流程脚本二代（V-SYNTHES2）安装教程】—— Molsoft ICM

■ 前置条件
   · 已装 Molsoft ICM（正版授权）。

■ 本扩展是什么
   V-SYNTHES2 第二代虚拟筛选流程脚本，新增片段选择、随机库生成与对接后处理，并附结果评估脚本，扩展了筛选的化学空间。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是社区 ICM 脚本集（.icm 脚本、.sh/.py 配套脚本）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. ICM 里菜单 File → Load Script 选择 .icm 脚本；或用 icm-shell 命令行执行。
   3. 按脚本说明准备输入结构文件（PDB/SDF 等）与工作目录。
   4. 运行后结果（对接构象、打分表、图片）在脚本输出目录。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「虚拟筛选流程脚本二代」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/katritchlab/V-SYNTHES2
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。