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MOE (Molecular Operating Environment) MOE (Molecular Operating Environment) 插件合集(共 33 个)
分子建模与计算平台(SVL Exchange 免费脚本) | 分类:分子与网络分析 | 每个插件都附中文说明与安装教程,下载走百度网盘 / 夸克网盘。
插件清单
ABangle · 抗体几何描述符
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2020-03-04
提供 ABangle 抗体 Fv 区几何描述符,量化重链与轻链的相对取向,用于抗体结构比较与工程化分析。
包含文件:ABangle.svlx
安装教程(点击展开)
【抗体几何描述符(ABangle)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
提供 ABangle 抗体 Fv 区几何描述符,量化重链与轻链的相对取向,用于抗体结构比较与工程化分析。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「抗体几何描述符」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/ABangle.svlx
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
ADMET_AI · 成药性人工智能预测
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2026-06-02
通过图形界面调用 ADMET-AI 的 Chemprop 模型,为 MDB 文件中的分子预测 41 项吸收、分布、代谢、排泄与毒性性质。
包含文件:ADMET_AI.svlx
安装教程(点击展开)
【成药性人工智能预测(ADMET_AI)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
通过图形界面调用 ADMET-AI 的 Chemprop 模型,为 MDB 文件中的分子预测 41 项吸收、分布、代谢、排泄与毒性性质。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「成药性人工智能预测」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/ADMET_AI.svlx
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
AlphaFoldColoring · 折叠结构着色
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2022-06-01
依据 AlphaFold 预测结构中的 pLDDT 置信度进行着色,效果与 AlphaFold 蛋白结构数据库的展示一致。
包含文件:AlphaFoldColoring.svlx
安装教程(点击展开)
【折叠结构着色(AlphaFoldColoring)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
依据 AlphaFold 预测结构中的 pLDDT 置信度进行着色,效果与 AlphaFold 蛋白结构数据库的展示一致。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「折叠结构着色」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/AlphaFoldColoring.svlx
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
AutoQuaSAR · 自动QSAR建模
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2024-09-03
用于快速构建 QSAR 模型的工具,可协助生成训练集与测试集、计算描述符并建立定量构效关系模型。
包含文件:AutoQuaSAR.svlx
安装教程(点击展开)
【自动QSAR建模(AutoQuaSAR)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
用于快速构建 QSAR 模型的工具,可协助生成训练集与测试集、计算描述符并建立定量构效关系模型。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「自动QSAR建模」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/AutoQuaSAR.svlx
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
Consensus_Logo · 序列共识标识图
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2021-08-19
创建序列共识 logo 图,直观展示多序列比对中各位置氨基酸的保守程度与偏好,便于识别关键残基。
包含文件:Consensus_Logo.svlx
安装教程(点击展开)
【序列共识标识图(Consensus_Logo)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
创建序列共识 logo 图,直观展示多序列比对中各位置氨基酸的保守程度与偏好,便于识别关键残基。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「序列共识标识图」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/Consensus_Logo.svlx
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
CYP_Predictor · 细胞色素P450预测
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2024-11-11
预测细胞色素 P450 的选择性、反应性与代谢位点,帮助评估候选化合物的代谢稳定性与潜在毒性风险。
包含文件:CYP_Predictor.svlx
安装教程(点击展开)
【细胞色素P450预测(CYP_Predictor)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
预测细胞色素 P450 的选择性、反应性与代谢位点,帮助评估候选化合物的代谢稳定性与潜在毒性风险。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「细胞色素P450预测」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/CYP_Predictor.svlx
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
db_AutoPH4 · 药效团自动生成
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2024-04-23
从数据库中的蛋白结合口袋自动生成药效团模型,无需人工干预即可为靶点批量构建可用的药效团。
包含文件:db_AutoPH4.svlx
安装教程(点击展开)
【药效团自动生成(db_AutoPH4)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
从数据库中的蛋白结合口袋自动生成药效团模型,无需人工干预即可为靶点批量构建可用的药效团。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「药效团自动生成」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/db_AutoPH4.svlx
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
DOCK_ANALYZER · 对接构象分析器
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2025-02-10
对对接、骨架替换或构象搜索产生的配体构象进行过滤与排序,依据打分与相互作用挑选最优结合姿态。
包含文件:DOCK_ANALYZER.svlx
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【对接构象分析器(DOCK_ANALYZER)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
对对接、骨架替换或构象搜索产生的配体构象进行过滤与排序,依据打分与相互作用挑选最优结合姿态。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「对接构象分析器」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/DOCK_ANALYZER.svlx
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Excel_Interface · Excel读写接口
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2019-02-12
在 MOE 数据库与 Excel xlsx 文件之间相互读写,方便用电子表格整理、交换并重新导入分子与描述符数据。
包含文件:Excel_Interface.svlx
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【Excel读写接口(Excel_Interface)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
在 MOE 数据库与 Excel xlsx 文件之间相互读写,方便用电子表格整理、交换并重新导入分子与描述符数据。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Excel读写接口」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/Excel_Interface.svlx
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
Extended_Connectivity_Fingerprints · 扩展连接指纹
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2018-10-11
在 MOE 中提供 ECFP 与 FCFP 扩展连接分子指纹,用于相似性搜索、聚类以及化合物库的化学空间分析。
包含文件:Extended_Connectivity_Fingerprints.svlx
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【扩展连接指纹(Extended_Connectivity_Fingerprints)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
在 MOE 中提供 ECFP 与 FCFP 扩展连接分子指纹,用于相似性搜索、聚类以及化合物库的化学空间分析。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「扩展连接指纹」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/Extended_Connectivity_Fingerprints__ECFP_and_FCFP_.svlx
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
KNIMOE_Nodes_for_MOE_2024 · KNIME节点包2024
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2024-08-16
面向 MOE 2024 的 KNIME SVL 节点包,包含 200 多个节点,覆盖广泛的生命科学建模与计算流程。
包含文件:KNIMOE_Nodes_for_MOE_2024.svlx
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【KNIME节点包2024(KNIMOE_Nodes_for_MOE_2024)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
面向 MOE 2024 的 KNIME SVL 节点包,包含 200 多个节点,覆盖广泛的生命科学建模与计算流程。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「KNIME节点包2024」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/KNIMOE_Nodes_for_MOE_2024.svlx
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
Mcule_Interface · 化合物采购接口
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2024-08-20
对接 mcule.com 的化合物集合 API,在 MOE 中查询与获取可购买化合物数据,辅助虚拟筛选后的采购决策。
包含文件:Mcule_Interface.svlx
安装教程(点击展开)
【化合物采购接口(Mcule_Interface)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
对接 mcule.com 的化合物集合 API,在 MOE 中查询与获取可购买化合物数据,辅助虚拟筛选后的采购决策。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「化合物采购接口」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/Mcule_Interface.svlx
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
MD_PCA · 分子动力学主成分分析
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2020-03-23
对分子动力学轨迹数据执行主成分分析,降维揭示构象运动的主要模式,辅助分析蛋白构象变化。
包含文件:MD_PCA.svlx
安装教程(点击展开)
【分子动力学主成分分析(MD_PCA)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
对分子动力学轨迹数据执行主成分分析,降维揭示构象运动的主要模式,辅助分析蛋白构象变化。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「分子动力学主成分分析」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/MD_PCA.svlx
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
MembraneBuilder · 膜体系构建器
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2020-09-22
将已定位定向的分子按数量复制并随机旋转平铺到二维平面上,用于快速搭建脂质双层等膜体系模型。
包含文件:MembraneBuilder.svlx
安装教程(点击展开)
【膜体系构建器(MembraneBuilder)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
将已定位定向的分子按数量复制并随机旋转平铺到二维平面上,用于快速搭建脂质双层等膜体系模型。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「膜体系构建器」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/MembraneBuilder.svlx
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
ModelPotential · 模型势刚体最小化
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2025-06-01
modelpot.svl 使用当前力场的扭转项与非键相互作用项,对分子进行刚体最小化,快速优化构象与相对位置。
包含文件:ModelPotential.svlx
安装教程(点击展开)
【模型势刚体最小化(ModelPotential)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
modelpot.svl 使用当前力场的扭转项与非键相互作用项,对分子进行刚体最小化,快速优化构象与相对位置。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「模型势刚体最小化」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/ModelPotential.svlx
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
MOE_Clustering · 分子聚类工具集
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2024-12-20
提供层次聚类、Jarvis-Patrick 聚类与并行化 K-Means 聚类工具,用于化合物库的多样性分析与化合物分组。
包含文件:MOE_Clustering.svlx
安装教程(点击展开)
【分子聚类工具集(MOE_Clustering)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
提供层次聚类、Jarvis-Patrick 聚类与并行化 K-Means 聚类工具,用于化合物库的多样性分析与化合物分组。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「分子聚类工具集」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/MOE_Clustering.svlx
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MOE_QFSS_2019 · 超快结构搜索
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2019-06-26
面向存储于多个 mdb 文件的大型分子数据库的超快结构搜索程序,可在海量化合物中快速检索目标子结构。
包含文件:MOE_QFSS_2019.svlx
安装教程(点击展开)
【超快结构搜索(MOE_QFSS_2019)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
面向存储于多个 mdb 文件的大型分子数据库的超快结构搜索程序,可在海量化合物中快速检索目标子结构。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「超快结构搜索」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/MOE_QFSS_2019.svlx
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MolecularFragmentation · 分子片段化工具
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2026-03-16
fragmol.svl 依次切断分子中的每个可旋转键生成成对片段,可将靶点配体拆分为母核与侧链,供片段重组或组合工具复用。
包含文件:MolecularFragmentation.svlx
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【分子片段化工具(MolecularFragmentation)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
fragmol.svl 依次切断分子中的每个可旋转键生成成对片段,可将靶点配体拆分为母核与侧链,供片段重组或组合工具复用。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「分子片段化工具」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/MolecularFragmentation.svlx
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MolecularGlue · 分子胶三元复合物
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2021-11-12
生成并打分分子胶介导的三元复合物构象集合,用于评估分子胶连接靶蛋白与 E3 连接酶时的结合模式。
包含文件:MolecularGlue.svlx
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【分子胶三元复合物(MolecularGlue)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
生成并打分分子胶介导的三元复合物构象集合,用于评估分子胶连接靶蛋白与 E3 连接酶时的结合模式。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「分子胶三元复合物」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
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MolPort_Interface · 化合物目录接口
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2024-05-28
对接 molport.com 的化合物集合 API,可在 MOE 中检索、查询并获取可购买化合物及其结构与供应信息。
包含文件:MolPort_Interface.svlx
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【化合物目录接口(MolPort_Interface)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
对接 molport.com 的化合物集合 API,可在 MOE 中检索、查询并获取可购买化合物及其结构与供应信息。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「化合物目录接口」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/MolPort_Interface.svlx
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NitrogenWalk · 氮原子游走改造
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2025-06-01
nitwalk.svl 基于形状模板枚举,在蛋白口袋内对配体进行系统改造与遍历,探索氮原子替换等结构变化对结合的影响。
包含文件:NitrogenWalk.svlx
安装教程(点击展开)
【氮原子游走改造(NitrogenWalk)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
nitwalk.svl 基于形状模板枚举,在蛋白口袋内对配体进行系统改造与遍历,探索氮原子替换等结构变化对结合的影响。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「氮原子游走改造」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/NitrogenWalk.svlx
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OpsinInterface · 化学名解析接口
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2026-03-10
对接 OPSIN 系统 IUPAC 命名开放解析器,可将 IUPAC 系统化学名解析为分子结构,方便在 MOE 中处理文本命名。
包含文件:OpsinInterface.svlx
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【化学名解析接口(OpsinInterface)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
对接 OPSIN 系统 IUPAC 命名开放解析器,可将 IUPAC 系统化学名解析为分子结构,方便在 MOE 中处理文本命名。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「化学名解析接口」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/OpsinInterface.svlx
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PdbDownloader · PDB结构下载器
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2026-03-10
从 RCSB PDB 或 PSILO 服务器下载结构数据并直接保存为 MOE 数据库文件,便于批量获取晶体结构并投入后续分析。
包含文件:PdbDownloader.svlx
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【PDB结构下载器(PdbDownloader)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
从 RCSB PDB 或 PSILO 服务器下载结构数据并直接保存为 MOE 数据库文件,便于批量获取晶体结构并投入后续分析。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「PDB结构下载器」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/PdbDownloader.svlx
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Peptide-SVL-Scripts · 多肽生成脚本
util | 0.01 MB | 1 个文件
用于从头多肽生成工作流的 MOE SVL 脚本,包含多肽构建、处理与分析相关的实用脚本集合。
包含文件:Peptide-SVL-Scripts-main.zip
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【多肽生成脚本(Peptide-SVL-Scripts)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
用于从头多肽生成工作流的 MOE SVL 脚本,包含多肽构建、处理与分析相关的实用脚本集合。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「多肽生成脚本」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/SufyanAhm/Peptide-SVL-Scripts
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ProjectDock · 项目库相似对接
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2020-09-01
以 MOE 窗口中选中的配体为查询,在 MOE 项目中搜索最相似的配体条目,并可准备靶点并将配体对接至该靶点。
包含文件:ProjectDock.svlx
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【项目库相似对接(ProjectDock)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
以 MOE 窗口中选中的配体为查询,在 MOE 项目中搜索最相似的配体条目,并可准备靶点并将配体对接至该靶点。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「项目库相似对接」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/ProjectDock.svlx
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
ProteinDegraders · 蛋白降解剂建模
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2019-09-09
以五种不同方法生成并打分蛋白降解剂介导的三元复合物构象集合,辅助设计 PROTAC 等靶向降解分子。
包含文件:ProteinDegraders.svlx
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【蛋白降解剂建模(ProteinDegraders)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
以五种不同方法生成并打分蛋白降解剂介导的三元复合物构象集合,辅助设计 PROTAC 等靶向降解分子。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「蛋白降解剂建模」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/ProteinDegraders.svlx
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
PSAdescriptors · 极性表面积描述符
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2025-05-12
根据三维结构计算极性原子与非极性原子的范德华表面积,作为描述符用于 QSAR、成药性与渗透性建模。
包含文件:PSAdescriptors.svlx
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【极性表面积描述符(PSAdescriptors)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
根据三维结构计算极性原子与非极性原子的范德华表面积,作为描述符用于 QSAR、成药性与渗透性建模。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「极性表面积描述符」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/PSAdescriptors.svlx
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
ShapeTemplateEnumeration · 形状模板枚举
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2026-03-16
enummol.svl 接受一个或多个形状模板,在不改变分子拓扑的前提下替换元素生成新结构,可用于向碳氢骨架引入杂原子。
包含文件:ShapeTemplateEnumeration.svlx
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【形状模板枚举(ShapeTemplateEnumeration)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
enummol.svl 接受一个或多个形状模板,在不改变分子拓扑的前提下替换元素生成新结构,可用于向碳氢骨架引入杂原子。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「形状模板枚举」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/ShapeTemplateEnumeration.svlx
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
SVL-scripts · SVL脚本合集
util | 109.39 MB | 1 个文件
个人整理的 MOE SVL 脚本合集,涵盖药效团生成与搜索、对接、同源建模、序列对齐与数据库操作等大量实用工具。
包含文件:SVL-scripts-main.zip
安装教程(点击展开)
【SVL脚本合集(SVL-scripts)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
个人整理的 MOE SVL 脚本合集,涵盖药效团生成与搜索、对接、同源建模、序列对齐与数据库操作等大量实用工具。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「SVL脚本合集」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/gszwabowski/SVL-scripts
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
SVL_Edit_Mode_for_jEdit · jEdit语法高亮
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2024-08-19
为 jEdit 文本编辑器提供 SVL 编辑模式与语法高亮,适配 MOE 2024.06,方便编写与检查 SVL 脚本。
包含文件:SVL_Edit_Mode_for_jEdit.svlx
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【jEdit语法高亮(SVL_Edit_Mode_for_jEdit)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
为 jEdit 文本编辑器提供 SVL 编辑模式与语法高亮,适配 MOE 2024.06,方便编写与检查 SVL 脚本。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「jEdit语法高亮」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/SVL_Edit_Mode_for_jEdit.svlx
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
TallyBits · 环链片段统计器
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2026-08-06
生成输入分子中的各类环与链片段及其结构模板,同时计算分子性质并输出为 MOE 数据库,便于批量整理与分析化合物。
包含文件:TallyBits.svlx
安装教程(点击展开)
【环链片段统计器(TallyBits)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
生成输入分子中的各类环与链片段及其结构模板,同时计算分子性质并输出为 MOE 数据库,便于批量整理与分析化合物。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「环链片段统计器」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/TallyBits.svlx
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UnsharedVolume · 非共享体积计算
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2025-05-12
计算相互接触的分子结构体积之间的并集或交集,用于分析分子重叠与非共享空间,辅助药效团与形状比较。
包含文件:UnsharedVolume.svlx
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【非共享体积计算(UnsharedVolume)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
计算相互接触的分子结构体积之间的并集或交集,用于分析分子重叠与非共享空间,辅助药效团与形状比较。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「非共享体积计算」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/UnsharedVolume.svlx
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ZINC15_conformational_importer · ZINC构象导入器
util | 0.01 MB | 1 个文件 | 版本 2018-07-24
将 ZINC15 数据库中的多构象分子导入 MOE 的 MDB 数据库,便于开展下游虚拟筛选与对接分析。
包含文件:ZINC15_conformational_importer.svlx
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【ZINC构象导入器(ZINC15_conformational_importer)安装教程】—— MOE
■ 前置条件
· 已装 MOE(正版授权;本店提供的是官方 SVL Exchange 上的免费脚本)。
■ 本扩展是什么
将 ZINC15 数据库中的多构象分子导入 MOE 的 MDB 数据库,便于开展下游虚拟筛选与对接分析。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:其它文件(.svlx)。
· .svlx 是 MOE 官方 SVL 脚本条目;.zip 是社区 SVL 脚本包。
■ 安装步骤
1. 在 MOE 里菜单 SVL → Run SVL Script(或 File → Load SVL)。
2. 选择本目录的 .svlx / .svl 脚本;社区 .zip 先解压出 .svl 再用。
3. 脚本可能弹参数面板,按提示选择蛋白/配体与参数。
4. 结果在 MOE 的数据窗口、图表窗口或输出目录查看。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「ZINC构象导入器」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://svl.chemcomp.com/data/ZINC15_conformational_importer__db2_to_MDB_.svlx
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