Schrödinger Maestro 插件合集（共 19 个）

【平均原子电荷计算脚本（Average_charges_Maestro）安装教程】—— Schrödinger Maestro

■ 前置条件
   · 已装 Schrödinger 套件（Maestro 正版授权）；需编译的库另需 C++ 编译环境。

■ 本扩展是什么
   从 Maestro 导出的 .mol2 文件提取各构象的原子电荷并按权重平均，用于把多构象的 ESP 电荷归并到最终分子上。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是脚本/库源码包（Python 脚本、C++ 库、文档）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. Maestro 脚本：菜单 脚本 → Run Script，选择包内 .py 运行（先用 $SCHRODINGER/run 设置环境）。
   3. Python 库：把目录加入 PYTHONPATH，或用 Schrödinger 自带 python 运行 setup.py。
   4. C++ 库：按仓库 README 用 CMake 编译后再引用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「平均原子电荷计算脚本」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/1ofyouall/Average_charges_Maestro
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【二维坐标生成库（coordgenlibs）安装教程】—— Schrödinger Maestro

■ 前置条件
   · 已装 Schrödinger 套件（Maestro 正版授权）；需编译的库另需 C++ 编译环境。

■ 本扩展是什么
   Schrödinger 官方开源的二维坐标生成库，为小分子、大环与金属配合物生成高质量二维分子结构图，已被其商业软件长期采用。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是脚本/库源码包（Python 脚本、C++ 库、文档）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. Maestro 脚本：菜单 脚本 → Run Script，选择包内 .py 运行（先用 $SCHRODINGER/run 设置环境）。
   3. Python 库：把目录加入 PYTHONPATH，或用 Schrödinger 自带 python 运行 setup.py。
   4. C++ 库：按仓库 README 用 CMake 编译后再引用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「二维坐标生成库」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/schrodinger/coordgenlibs
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【共价对接工作流（CovDFlow）安装教程】—— Schrödinger Maestro

■ 前置条件
   · 已装 Schrödinger 套件（Maestro 正版授权）；需编译的库另需 C++ 编译环境。

■ 本扩展是什么
   基于 Schrödinger 的共价对接自动化工作流，支持指定反应类型与靶标残基，批量完成共价对接并按打分排序，含动力学对接分析。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是脚本/库源码包（Python 脚本、C++ 库、文档）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. Maestro 脚本：菜单 脚本 → Run Script，选择包内 .py 运行（先用 $SCHRODINGER/run 设置环境）。
   3. Python 库：把目录加入 PYTHONPATH，或用 Schrödinger 自带 python 运行 setup.py。
   4. C++ 库：按仓库 README 用 CMake 编译后再引用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「共价对接工作流」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/kostassdrakas01/CovDFlow
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【构象SMILES编码工具（csmiles）安装教程】—— Schrödinger Maestro

■ 前置条件
   · 已装 Schrödinger 套件（Maestro 正版授权）；需编译的库另需 C++ 编译环境。

■ 本扩展是什么
   对 SMILES 行表示法的扩展，以紧凑方式编码构象结构信息，提供命令行工具与 Python 接口，便于比较与检索分子构象。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是脚本/库源码包（Python 脚本、C++ 库、文档）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. Maestro 脚本：菜单 脚本 → Run Script，选择包内 .py 运行（先用 $SCHRODINGER/run 设置环境）。
   3. Python 库：把目录加入 PYTHONPATH，或用 Schrödinger 自带 python 运行 setup.py。
   4. C++ 库：按仓库 README 用 CMake 编译后再引用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「构象SMILES编码工具」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/schrodinger/csmiles
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【Desmond模拟构建工具（desmondtools）安装教程】—— Schrödinger Maestro

■ 前置条件
   · 已装 Schrödinger 套件（Maestro 正版授权）；需编译的库另需 C++ 编译环境。

■ 本扩展是什么
   为 Desmond 分子动力学准备模拟的 Python 库与命令行脚本，可读取并修改 .msj 与 .cfg 模板，批量搭建多副本模拟。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是脚本/库源码包（Python 脚本、C++ 库、文档）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. Maestro 脚本：菜单 脚本 → Run Script，选择包内 .py 运行（先用 $SCHRODINGER/run 设置环境）。
   3. Python 库：把目录加入 PYTHONPATH，或用 Schrödinger 自带 python 运行 setup.py。
   4. C++ 库：按仓库 README 用 CMake 编译后再引用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Desmond模拟构建工具」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/sunghunbae/desmondtools
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【FEP约束设置工具（fep-restraints）安装教程】—— Schrödinger Maestro

■ 前置条件
   · 已装 Schrödinger 套件（Maestro 正版授权）；需编译的库另需 C++ 编译环境。

■ 本扩展是什么
   为 FEP+ 计算添加限制势的脚本工具集，可从普通分子动力学模拟分析并确定参考结构与约束宽度，生成 ABFEP 输入文件。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是脚本/库源码包（Python 脚本、C++ 库、文档）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. Maestro 脚本：菜单 脚本 → Run Script，选择包内 .py 运行（先用 $SCHRODINGER/run 设置环境）。
   3. Python 库：把目录加入 PYTHONPATH，或用 Schrödinger 自带 python 运行 setup.py。
   4. C++ 库：按仓库 README 用 CMake 编译后再引用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「FEP约束设置工具」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/schrodinger/fep-restraints
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【GPU指纹相似性检索（gpusimilarity）安装教程】—— Schrödinger Maestro

■ 前置条件
   · 已装 Schrödinger 套件（Maestro 正版授权）；需编译的库另需 C++ 编译环境。

■ 本扩展是什么
   基于 GPU 的化学指纹相似性检索工具，用 Python 结合 RDKit 生成指纹，在显卡内存中对上亿化合物做暴力相似度搜索。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是脚本/库源码包（Python 脚本、C++ 库、文档）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. Maestro 脚本：菜单 脚本 → Run Script，选择包内 .py 运行（先用 $SCHRODINGER/run 设置环境）。
   3. Python 库：把目录加入 PYTHONPATH，或用 Schrödinger 自带 python 运行 setup.py。
   4. C++ 库：按仓库 README 用 CMake 编译后再引用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「GPU指纹相似性检索」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/schrodinger/gpusimilarity
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【Linux依赖包检查脚本（linux_package_requirement）安装教程】—— Schrödinger Maestro

■ 前置条件
   · 已装 Schrödinger 套件（Maestro 正版授权）；需编译的库另需 C++ 编译环境。

■ 本扩展是什么
   检查 Linux 系统是否满足 Schrödinger 套件运行依赖的脚本，按发行版与版本列出所需软件包并报告缺失项，便于安装前排查。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是脚本/库源码包（Python 脚本、C++ 库、文档）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. Maestro 脚本：菜单 脚本 → Run Script，选择包内 .py 运行（先用 $SCHRODINGER/run 设置环境）。
   3. Python 库：把目录加入 PYTHONPATH，或用 Schrödinger 自带 python 运行 setup.py。
   4. C++ 库：按仓库 README 用 CMake 编译后再引用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Linux依赖包检查脚本」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/schrodinger/linux_package_requirement
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【Maestro结构文件解析库（maeparser）安装教程】—— Schrödinger Maestro

■ 前置条件
   · 已装 Schrödinger 套件（Maestro 正版授权）；需编译的库另需 C++ 编译环境。

■ 本扩展是什么
   Schrödinger 官方开源的 Maestro 结构文件解析库，用 C++ 读写 .mae、.maegz 等多结构文件，可嵌入自研程序读取分子建模数据。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是脚本/库源码包（Python 脚本、C++ 库、文档）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. Maestro 脚本：菜单 脚本 → Run Script，选择包内 .py 运行（先用 $SCHRODINGER/run 设置环境）。
   3. Python 库：把目录加入 PYTHONPATH，或用 Schrödinger 自带 python 运行 setup.py。
   4. C++ 库：按仓库 README 用 CMake 编译后再引用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Maestro结构文件解析库」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/schrodinger/maeparser
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【Maestro命令封装库（maestrowrapper）安装教程】—— Schrödinger Maestro

■ 前置条件
   · 已装 Schrödinger 套件（Maestro 正版授权）；需编译的库另需 C++ 编译环境。

■ 本扩展是什么
   用 Python 封装 Maestro 与 Desmond 常用操作的轻量库，提供 mae、maestro、mmgbsa 等模块，简化命令调用与结果处理。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是脚本/库源码包（Python 脚本、C++ 库、文档）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. Maestro 脚本：菜单 脚本 → Run Script，选择包内 .py 运行（先用 $SCHRODINGER/run 设置环境）。
   3. Python 库：把目录加入 PYTHONPATH，或用 Schrödinger 自带 python 运行 setup.py。
   4. C++ 库：按仓库 README 用 CMake 编译后再引用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Maestro命令封装库」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/kelsieking23/maestrowrapper
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【配体构象聚类流程（md-ligand-clustering-pipeline）安装教程】—— Schrödinger Maestro

■ 前置条件
   · 已装 Schrödinger 套件（Maestro 正版授权）；需编译的库另需 C++ 编译环境。

■ 本扩展是什么
   面向 Schrödinger 与 Desmond 轨迹的配体构象聚类流程，自动提取、对齐、聚类并排序配体构象，按占有与结合特征给出综合评分。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是脚本/库源码包（Python 脚本、C++ 库、文档）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. Maestro 脚本：菜单 脚本 → Run Script，选择包内 .py 运行（先用 $SCHRODINGER/run 设置环境）。
   3. Python 库：把目录加入 PYTHONPATH，或用 Schrödinger 自带 python 运行 setup.py。
   4. C++ 库：按仓库 README 用 CMake 编译后再引用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「配体构象聚类流程」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/DurdagiLab/md-ligand-clustering-pipeline
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【序参量计算与绘图脚本（Order_parameter_Desmond_public）安装教程】—— Schrödinger Maestro

■ 前置条件
   · 已装 Schrödinger 套件（Maestro 正版授权）；需编译的库另需 C++ 编译环境。

■ 本扩展是什么
   读取 Desmond 分子动力学输出的 .csv 文件，计算并绘制分子体系序参量，可给出平均取向及考虑方向符号的修正结果。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是脚本/库源码包（Python 脚本、C++ 库、文档）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. Maestro 脚本：菜单 脚本 → Run Script，选择包内 .py 运行（先用 $SCHRODINGER/run 设置环境）。
   3. Python 库：把目录加入 PYTHONPATH，或用 Schrödinger 自带 python 运行 setup.py。
   4. C++ 库：按仓库 README 用 CMake 编译后再引用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「序参量计算与绘图脚本」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/1ofyouall/Order_parameter_Desmond_public
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【相互作用数据后处理（Processing-Interaction_dat_files-from-Maestro）安装教程】—— Schrödinger Maestro

■ 前置条件
   · 已装 Schrödinger 套件（Maestro 正版授权）；需编译的库另需 C++ 编译环境。

■ 本扩展是什么
   处理 Maestro 中 Desmond 分子动力学输出的 .dat 相互作用文件，用 Jupyter 笔记本解析氢键、疏水、离子与 π 等接触并汇总。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是脚本/库源码包（Python 脚本、C++ 库、文档）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. Maestro 脚本：菜单 脚本 → Run Script，选择包内 .py 运行（先用 $SCHRODINGER/run 设置环境）。
   3. Python 库：把目录加入 PYTHONPATH，或用 Schrödinger 自带 python 运行 setup.py。
   4. C++ 库：按仓库 README 用 CMake 编译后再引用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「相互作用数据后处理」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/malegria01/Processing-Interaction_dat_files-from-Maestro
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【远程对接作业自动化脚本（remote-schrodinger-tools）安装教程】—— Schrödinger Maestro

■ 前置条件
   · 已装 Schrödinger 套件（Maestro 正版授权）；需编译的库另需 C++ 编译环境。

■ 本扩展是什么
   在 Linux 服务器上批量准备与提交 Schrödinger 对接作业的自动化脚本，可用配置文件生成 Glide 网格与对接任务并排队运行。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是脚本/库源码包（Python 脚本、C++ 库、文档）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. Maestro 脚本：菜单 脚本 → Run Script，选择包内 .py 运行（先用 $SCHRODINGER/run 设置环境）。
   3. Python 库：把目录加入 PYTHONPATH，或用 Schrödinger 自带 python 运行 setup.py。
   4. C++ 库：按仓库 README 用 CMake 编译后再引用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「远程对接作业自动化脚本」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/hannafad/remote-schrodinger-tools
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【Maestro命令行操作脚本（Schrodinger-Program-Operation）安装教程】—— Schrödinger Maestro

■ 前置条件
   · 已装 Schrödinger 套件（Maestro 正版授权）；需编译的库另需 C++ 编译环境。

■ 本扩展是什么
   通过 Python 脚本在命令行下操作 Maestro 程序的示例代码，演示用命令方式驱动 Schrödinger 建模与计算流程。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是脚本/库源码包（Python 脚本、C++ 库、文档）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. Maestro 脚本：菜单 脚本 → Run Script，选择包内 .py 运行（先用 $SCHRODINGER/run 设置环境）。
   3. Python 库：把目录加入 PYTHONPATH，或用 Schrödinger 自带 python 运行 setup.py。
   4. C++ 库：按仓库 README 用 CMake 编译后再引用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Maestro命令行操作脚本」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/minjaeju/Schrodinger-Program-Operation
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【Maestro脚本工具集（schrodinger_utils）安装教程】—— Schrödinger Maestro

■ 前置条件
   · 已装 Schrödinger 套件（Maestro 正版授权）；需编译的库另需 C++ 编译环境。

■ 本扩展是什么
   面向 Schrödinger 生态的脚本与插件合集，侧重 Desmond 分子动力学分析，含 Maestro 菜单脚本、模板与使用技巧文档。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是脚本/库源码包（Python 脚本、C++ 库、文档）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. Maestro 脚本：菜单 脚本 → Run Script，选择包内 .py 运行（先用 $SCHRODINGER/run 设置环境）。
   3. Python 库：把目录加入 PYTHONPATH，或用 Schrödinger 自带 python 运行 setup.py。
   4. C++ 库：按仓库 README 用 CMake 编译后再引用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Maestro脚本工具集」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/rebelot/schrodinger_utils
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【Scipion对接流程插件（scipion-chem-schrodinger）安装教程】—— Schrödinger Maestro

■ 前置条件
   · 已装 Schrödinger 套件（Maestro 正版授权）；需编译的库另需 C++ 编译环境。

■ 本扩展是什么
   把 Schrödinger 套件工具接入 Scipion 框架的插件，可在统一工作流中调用其程序完成虚拟药物筛选等计算任务。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是脚本/库源码包（Python 脚本、C++ 库、文档）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. Maestro 脚本：菜单 脚本 → Run Script，选择包内 .py 运行（先用 $SCHRODINGER/run 设置环境）。
   3. Python 库：把目录加入 PYTHONPATH，或用 Schrödinger 自带 python 运行 setup.py。
   4. C++ 库：按仓库 README 用 CMake 编译后再引用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「Scipion对接流程插件」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/scipion-chem/scipion-chem-schrodinger
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【分子结构绘制器（sketcher）安装教程】—— Schrödinger Maestro

■ 前置条件
   · 已装 Schrödinger 套件（Maestro 正版授权）；需编译的库另需 C++ 编译环境。

■ 本扩展是什么
   Schrödinger 官方开源的分子结构绘制器，可独立使用或集成到化学信息学流程，用于创建与编辑分子、反应式及化学结构图。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是脚本/库源码包（Python 脚本、C++ 库、文档）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. Maestro 脚本：菜单 脚本 → Run Script，选择包内 .py 运行（先用 $SCHRODINGER/run 设置环境）。
   3. Python 库：把目录加入 PYTHONPATH，或用 Schrödinger 自带 python 运行 setup.py。
   4. C++ 库：按仓库 README 用 CMake 编译后再引用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「分子结构绘制器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/schrodinger/sketcher
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【系统突变与对接分析（SystematicMutagenesis_Ligand_Docking_Analysis）安装教程】—— Schrödinger Maestro

■ 前置条件
   · 已装 Schrödinger 套件（Maestro 正版授权）；需编译的库另需 C++ 编译环境。

■ 本扩展是什么
   在 Maestro 环境中批量执行系统性突变与对接的流程脚本，将每个残基突变为各种氨基酸后能量最小化并对接，结果存入 SQLite 数据库。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是脚本/库源码包（Python 脚本、C++ 库、文档）。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. Maestro 脚本：菜单 脚本 → Run Script，选择包内 .py 运行（先用 $SCHRODINGER/run 设置环境）。
   3. Python 库：把目录加入 PYTHONPATH，或用 Schrödinger 自带 python 运行 setup.py。
   4. C++ 库：按仓库 README 用 CMake 编译后再引用。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「系统突变与对接分析」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/JGBurgess1/SystematicMutagenesis_Ligand_Docking_Analysis
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。