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HistoQC 插件合集(共 16 个)

全片图像质量控制系统(官方配套工具与插件) | 分类:病理图片处理 | 每个插件都附中文说明与安装教程,下载走百度网盘 / 夸克网盘。

插件清单

BiopTort · 组织曲折度测量工具

util | 1.74 MB | 1 个文件

用于计算组织切片中纤维等结构的曲折度指标,为形态学定量分析提供辅助测量结果。

包含文件:BiopTort-main.zip
安装教程(点击展开)
【组织曲折度测量工具(BiopTort)安装教程】—— HistoQC

■ 前置条件
   · 已安装 Python 3.9 及以上(建议用 Conda 环境);建议同时装 OpenSlide(读 .svs 等全片图需要)。

■ 本扩展是什么
   用于计算组织切片中纤维等结构的曲折度指标,为形态学定量分析提供辅助测量结果。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
   · .zip 是官方仓库源码包;DSA 插件为可直接上传的插件包。

■ 安装步骤
   1. 解压本目录的 .zip。
   2. 命令行进入解压目录,执行 pip install -e .  (或 pip install -r requirements.txt)
   3. 运行质控:histoqc 切片目录 -o 输出目录 -c 配置文件  (具体参数见包内 README)
   4. 若本包是 Digital Slide Archive 插件:登录 DSA → 插件 页面 → 上传本 .zip → 启用。
   5. 若是 QuPath 配合脚本:把脚本放到 QuPath 的 scripts 目录,在 Extensions → Script Editor 里运行。

■ 验证是否装好
   · 命令行执行 histoqc --help 能输出帮助。
   · DSA 插件上传后能在插件列表里看到 HistoQC。

■ 常见问题
   · 报 OpenSlide 缺失:先装 openslide-python 与 OpenSlide 二进制(Windows 解压官方 release 后加入 PATH)。
   · 读图报错:确认切片格式在 OpenSlide 支持范围内。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/BiopTort
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「组织曲折度测量工具」,即为成功。
   · 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
   · 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/BiopTort
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

CohortFinder · 样本队列分群工具

util | 11.99 MB | 1 个文件

利用质量控制指标对大规模样本进行智能分群与数据划分,便于构建均衡队列用于后续分析研究。

包含文件:CohortFinder-main.zip
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【样本队列分群工具(CohortFinder)安装教程】—— HistoQC

■ 前置条件
   · 已安装 Python 3.9 及以上(建议用 Conda 环境);建议同时装 OpenSlide(读 .svs 等全片图需要)。

■ 本扩展是什么
   利用质量控制指标对大规模样本进行智能分群与数据划分,便于构建均衡队列用于后续分析研究。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
   · .zip 是官方仓库源码包;DSA 插件为可直接上传的插件包。

■ 安装步骤
   1. 解压本目录的 .zip。
   2. 命令行进入解压目录,执行 pip install -e .  (或 pip install -r requirements.txt)
   3. 运行质控:histoqc 切片目录 -o 输出目录 -c 配置文件  (具体参数见包内 README)
   4. 若本包是 Digital Slide Archive 插件:登录 DSA → 插件 页面 → 上传本 .zip → 启用。
   5. 若是 QuPath 配合脚本:把脚本放到 QuPath 的 scripts 目录,在 Extensions → Script Editor 里运行。

■ 验证是否装好
   · 命令行执行 histoqc --help 能输出帮助。
   · DSA 插件上传后能在插件列表里看到 HistoQC。

■ 常见问题
   · 报 OpenSlide 缺失:先装 openslide-python 与 OpenSlide 二进制(Windows 解压官方 release 后加入 PATH)。
   · 读图报错:确认切片格式在 OpenSlide 支持范围内。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/CohortFinder
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「样本队列分群工具」,即为成功。
   · 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
   · 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/CohortFinder
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

dicom2tiff · 切片格式转换工具

util | 0.01 MB | 1 个文件

将医学数字成像格式的病理切片批量转换为普通图像格式,方便在常规工具中读取、处理与共享。

包含文件:dicom2tiff-main.zip
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【切片格式转换工具(dicom2tiff)安装教程】—— HistoQC

■ 前置条件
   · 已安装 Python 3.9 及以上(建议用 Conda 环境);建议同时装 OpenSlide(读 .svs 等全片图需要)。

■ 本扩展是什么
   将医学数字成像格式的病理切片批量转换为普通图像格式,方便在常规工具中读取、处理与共享。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
   · .zip 是官方仓库源码包;DSA 插件为可直接上传的插件包。

■ 安装步骤
   1. 解压本目录的 .zip。
   2. 命令行进入解压目录,执行 pip install -e .  (或 pip install -r requirements.txt)
   3. 运行质控:histoqc 切片目录 -o 输出目录 -c 配置文件  (具体参数见包内 README)
   4. 若本包是 Digital Slide Archive 插件:登录 DSA → 插件 页面 → 上传本 .zip → 启用。
   5. 若是 QuPath 配合脚本:把脚本放到 QuPath 的 scripts 目录,在 Extensions → Script Editor 里运行。

■ 验证是否装好
   · 命令行执行 histoqc --help 能输出帮助。
   · DSA 插件上传后能在插件列表里看到 HistoQC。

■ 常见问题
   · 报 OpenSlide 缺失:先装 openslide-python 与 OpenSlide 二进制(Windows 解压官方 release 后加入 PATH)。
   · 读图报错:确认切片格式在 OpenSlide 支持范围内。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/dicom2tiff
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「切片格式转换工具」,即为成功。
   · 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
   · 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/dicom2tiff
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FeatureAnalysis · 图像特征分析工具

util | 0.91 MB | 1 个文件

对病理图像提取并分析多种图像特征,帮助研究者观察特征分布、比较切片差异并支撑后续建模。

包含文件:FeatureAnalysis-main.zip
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【图像特征分析工具(FeatureAnalysis)安装教程】—— HistoQC

■ 前置条件
   · 已安装 Python 3.9 及以上(建议用 Conda 环境);建议同时装 OpenSlide(读 .svs 等全片图需要)。

■ 本扩展是什么
   对病理图像提取并分析多种图像特征,帮助研究者观察特征分布、比较切片差异并支撑后续建模。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
   · .zip 是官方仓库源码包;DSA 插件为可直接上传的插件包。

■ 安装步骤
   1. 解压本目录的 .zip。
   2. 命令行进入解压目录,执行 pip install -e .  (或 pip install -r requirements.txt)
   3. 运行质控:histoqc 切片目录 -o 输出目录 -c 配置文件  (具体参数见包内 README)
   4. 若本包是 Digital Slide Archive 插件:登录 DSA → 插件 页面 → 上传本 .zip → 启用。
   5. 若是 QuPath 配合脚本:把脚本放到 QuPath 的 scripts 目录,在 Extensions → Script Editor 里运行。

■ 验证是否装好
   · 命令行执行 histoqc --help 能输出帮助。
   · DSA 插件上传后能在插件列表里看到 HistoQC。

■ 常见问题
   · 报 OpenSlide 缺失:先装 openslide-python 与 OpenSlide 二进制(Windows 解压官方 release 后加入 PATH)。
   · 读图报错:确认切片格式在 OpenSlide 支持范围内。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/FeatureAnalysis
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「图像特征分析工具」,即为成功。
   · 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
   · 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/FeatureAnalysis
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HistoBlur · 切片模糊检测工具

util | 2.78 MB | 1 个文件

检测数字病理切片中的失焦与模糊区域,输出模糊程度指标,用于切片质量筛查与成像质量评估。

包含文件:HistoBlur-main.zip
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【切片模糊检测工具(HistoBlur)安装教程】—— HistoQC

■ 前置条件
   · 已安装 Python 3.9 及以上(建议用 Conda 环境);建议同时装 OpenSlide(读 .svs 等全片图需要)。

■ 本扩展是什么
   检测数字病理切片中的失焦与模糊区域,输出模糊程度指标,用于切片质量筛查与成像质量评估。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
   · .zip 是官方仓库源码包;DSA 插件为可直接上传的插件包。

■ 安装步骤
   1. 解压本目录的 .zip。
   2. 命令行进入解压目录,执行 pip install -e .  (或 pip install -r requirements.txt)
   3. 运行质控:histoqc 切片目录 -o 输出目录 -c 配置文件  (具体参数见包内 README)
   4. 若本包是 Digital Slide Archive 插件:登录 DSA → 插件 页面 → 上传本 .zip → 启用。
   5. 若是 QuPath 配合脚本:把脚本放到 QuPath 的 scripts 目录,在 Extensions → Script Editor 里运行。

■ 验证是否装好
   · 命令行执行 histoqc --help 能输出帮助。
   · DSA 插件上传后能在插件列表里看到 HistoQC。

■ 常见问题
   · 报 OpenSlide 缺失:先装 openslide-python 与 OpenSlide 二进制(Windows 解压官方 release 后加入 PATH)。
   · 读图报错:确认切片格式在 OpenSlide 支持范围内。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/HistoBlur
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「切片模糊检测工具」,即为成功。
   · 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
   · 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/HistoBlur
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HistoQC · 病理切片质控工具

util | 24.84 MB | 1 个文件

开源的全片数字病理图像质量控制工具,自动计算多项图像指标并检测模糊、笔迹、组织缺失等缺陷,助力筛选可用切片。

包含文件:HistoQC-master.zip
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【病理切片质控工具(HistoQC)安装教程】—— HistoQC

■ 前置条件
   · 已安装 Python 3.9 及以上(建议用 Conda 环境);建议同时装 OpenSlide(读 .svs 等全片图需要)。

■ 本扩展是什么
   开源的全片数字病理图像质量控制工具,自动计算多项图像指标并检测模糊、笔迹、组织缺失等缺陷,助力筛选可用切片。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
   · .zip 是官方仓库源码包;DSA 插件为可直接上传的插件包。

■ 安装步骤
   1. 解压本目录的 .zip。
   2. 命令行进入解压目录,执行 pip install -e .  (或 pip install -r requirements.txt)
   3. 运行质控:histoqc 切片目录 -o 输出目录 -c 配置文件  (具体参数见包内 README)
   4. 若本包是 Digital Slide Archive 插件:登录 DSA → 插件 页面 → 上传本 .zip → 启用。
   5. 若是 QuPath 配合脚本:把脚本放到 QuPath 的 scripts 目录,在 Extensions → Script Editor 里运行。

■ 验证是否装好
   · 命令行执行 histoqc --help 能输出帮助。
   · DSA 插件上传后能在插件列表里看到 HistoQC。

■ 常见问题
   · 报 OpenSlide 缺失:先装 openslide-python 与 OpenSlide 二进制(Windows 解压官方 release 后加入 PATH)。
   · 读图报错:确认切片格式在 OpenSlide 支持范围内。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/HistoQC
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「病理切片质控工具」,即为成功。
   · 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
   · 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/HistoQC
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

histoqc-dsa-plugin · 数字切片档案质控插件

util | 0.02 MB | 1 个文件

把质控工具集成到数字切片档案平台中,可在平台内直接对切片运行质量分析并查看质控结果。

包含文件:histoqc-dsa-plugin-production.zip
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【数字切片档案质控插件(histoqc-dsa-plugin)安装教程】—— HistoQC

■ 前置条件
   · 已安装 Python 3.9 及以上(建议用 Conda 环境);建议同时装 OpenSlide(读 .svs 等全片图需要)。

■ 本扩展是什么
   把质控工具集成到数字切片档案平台中,可在平台内直接对切片运行质量分析并查看质控结果。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
   · .zip 是官方仓库源码包;DSA 插件为可直接上传的插件包。

■ 安装步骤
   1. 解压本目录的 .zip。
   2. 命令行进入解压目录,执行 pip install -e .  (或 pip install -r requirements.txt)
   3. 运行质控:histoqc 切片目录 -o 输出目录 -c 配置文件  (具体参数见包内 README)
   4. 若本包是 Digital Slide Archive 插件:登录 DSA → 插件 页面 → 上传本 .zip → 启用。
   5. 若是 QuPath 配合脚本:把脚本放到 QuPath 的 scripts 目录,在 Extensions → Script Editor 里运行。

■ 验证是否装好
   · 命令行执行 histoqc --help 能输出帮助。
   · DSA 插件上传后能在插件列表里看到 HistoQC。

■ 常见问题
   · 报 OpenSlide 缺失:先装 openslide-python 与 OpenSlide 二进制(Windows 解压官方 release 后加入 PATH)。
   · 读图报错:确认切片格式在 OpenSlide 支持范围内。

■ 来源与版权
   https://github.com/DigitalSlideArchive/histoqc-dsa-plugin
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「数字切片档案质控插件」,即为成功。
   · 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
   · 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/DigitalSlideArchive/histoqc-dsa-plugin
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

HoverFast · 细胞核快速分割

util | 39.54 MB | 1 个文件

面向明场全片图像的高效细胞核分割工具,快速从切片图像中提取细胞核轮廓,用于计数与形态定量分析。

包含文件:HoverFast-main.zip
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【细胞核快速分割(HoverFast)安装教程】—— HistoQC

■ 前置条件
   · 已安装 Python 3.9 及以上(建议用 Conda 环境);建议同时装 OpenSlide(读 .svs 等全片图需要)。

■ 本扩展是什么
   面向明场全片图像的高效细胞核分割工具,快速从切片图像中提取细胞核轮廓,用于计数与形态定量分析。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
   · .zip 是官方仓库源码包;DSA 插件为可直接上传的插件包。

■ 安装步骤
   1. 解压本目录的 .zip。
   2. 命令行进入解压目录,执行 pip install -e .  (或 pip install -r requirements.txt)
   3. 运行质控:histoqc 切片目录 -o 输出目录 -c 配置文件  (具体参数见包内 README)
   4. 若本包是 Digital Slide Archive 插件:登录 DSA → 插件 页面 → 上传本 .zip → 启用。
   5. 若是 QuPath 配合脚本:把脚本放到 QuPath 的 scripts 目录,在 Extensions → Script Editor 里运行。

■ 验证是否装好
   · 命令行执行 histoqc --help 能输出帮助。
   · DSA 插件上传后能在插件列表里看到 HistoQC。

■ 常见问题
   · 报 OpenSlide 缺失:先装 openslide-python 与 OpenSlide 二进制(Windows 解压官方 release 后加入 PATH)。
   · 读图报错:确认切片格式在 OpenSlide 支持范围内。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/HoverFast
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「细胞核快速分割」,即为成功。
   · 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
   · 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/HoverFast
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

loopicide · 组织环状伪影处理

util | 0.11 MB | 1 个文件

用于识别和处理病理图像中的环状或折叠状组织伪影,降低其对图像分析与质控结果的干扰。

包含文件:loopicide-main.zip
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【组织环状伪影处理(loopicide)安装教程】—— HistoQC

■ 前置条件
   · 已安装 Python 3.9 及以上(建议用 Conda 环境);建议同时装 OpenSlide(读 .svs 等全片图需要)。

■ 本扩展是什么
   用于识别和处理病理图像中的环状或折叠状组织伪影,降低其对图像分析与质控结果的干扰。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
   · .zip 是官方仓库源码包;DSA 插件为可直接上传的插件包。

■ 安装步骤
   1. 解压本目录的 .zip。
   2. 命令行进入解压目录,执行 pip install -e .  (或 pip install -r requirements.txt)
   3. 运行质控:histoqc 切片目录 -o 输出目录 -c 配置文件  (具体参数见包内 README)
   4. 若本包是 Digital Slide Archive 插件:登录 DSA → 插件 页面 → 上传本 .zip → 启用。
   5. 若是 QuPath 配合脚本:把脚本放到 QuPath 的 scripts 目录,在 Extensions → Script Editor 里运行。

■ 验证是否装好
   · 命令行执行 histoqc --help 能输出帮助。
   · DSA 插件上传后能在插件列表里看到 HistoQC。

■ 常见问题
   · 报 OpenSlide 缺失:先装 openslide-python 与 OpenSlide 二进制(Windows 解压官方 release 后加入 PATH)。
   · 读图报错:确认切片格式在 OpenSlide 支持范围内。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/loopicide
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「组织环状伪影处理」,即为成功。
   · 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
   · 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/loopicide
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

PatchSorter · 图像块快速标注

util | 4.13 MB | 1 个文件

借助深度学习特征嵌入对图像块进行快速分类与标注,帮助用户在大量候选对象中高效筛选目标样本。

包含文件:PatchSorter-main.zip
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【图像块快速标注(PatchSorter)安装教程】—— HistoQC

■ 前置条件
   · 已安装 Python 3.9 及以上(建议用 Conda 环境);建议同时装 OpenSlide(读 .svs 等全片图需要)。

■ 本扩展是什么
   借助深度学习特征嵌入对图像块进行快速分类与标注,帮助用户在大量候选对象中高效筛选目标样本。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
   · .zip 是官方仓库源码包;DSA 插件为可直接上传的插件包。

■ 安装步骤
   1. 解压本目录的 .zip。
   2. 命令行进入解压目录,执行 pip install -e .  (或 pip install -r requirements.txt)
   3. 运行质控:histoqc 切片目录 -o 输出目录 -c 配置文件  (具体参数见包内 README)
   4. 若本包是 Digital Slide Archive 插件:登录 DSA → 插件 页面 → 上传本 .zip → 启用。
   5. 若是 QuPath 配合脚本:把脚本放到 QuPath 的 scripts 目录,在 Extensions → Script Editor 里运行。

■ 验证是否装好
   · 命令行执行 histoqc --help 能输出帮助。
   · DSA 插件上传后能在插件列表里看到 HistoQC。

■ 常见问题
   · 报 OpenSlide 缺失:先装 openslide-python 与 OpenSlide 二进制(Windows 解压官方 release 后加入 PATH)。
   · 读图报错:确认切片格式在 OpenSlide 支持范围内。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/PatchSorter
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「图像块快速标注」,即为成功。
   · 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
   · 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/PatchSorter
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

PytorchDigitalPathology · 数字病理深度学习工具

util | 4.89 MB | 1 个文件

基于深度学习框架的数字病理工具集合,提供图像分类与分割等模型的训练和推理示例,供研究使用。

包含文件:PytorchDigitalPathology-master.zip
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【数字病理深度学习工具(PytorchDigitalPathology)安装教程】—— HistoQC

■ 前置条件
   · 已安装 Python 3.9 及以上(建议用 Conda 环境);建议同时装 OpenSlide(读 .svs 等全片图需要)。

■ 本扩展是什么
   基于深度学习框架的数字病理工具集合,提供图像分类与分割等模型的训练和推理示例,供研究使用。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
   · .zip 是官方仓库源码包;DSA 插件为可直接上传的插件包。

■ 安装步骤
   1. 解压本目录的 .zip。
   2. 命令行进入解压目录,执行 pip install -e .  (或 pip install -r requirements.txt)
   3. 运行质控:histoqc 切片目录 -o 输出目录 -c 配置文件  (具体参数见包内 README)
   4. 若本包是 Digital Slide Archive 插件:登录 DSA → 插件 页面 → 上传本 .zip → 启用。
   5. 若是 QuPath 配合脚本:把脚本放到 QuPath 的 scripts 目录,在 Extensions → Script Editor 里运行。

■ 验证是否装好
   · 命令行执行 histoqc --help 能输出帮助。
   · DSA 插件上传后能在插件列表里看到 HistoQC。

■ 常见问题
   · 报 OpenSlide 缺失:先装 openslide-python 与 OpenSlide 二进制(Windows 解压官方 release 后加入 PATH)。
   · 读图报错:确认切片格式在 OpenSlide 支持范围内。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/PytorchDigitalPathology
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「数字病理深度学习工具」,即为成功。
   · 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
   · 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/PytorchDigitalPathology
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

qcsliderepo-web · 质控切片网页库

util | 1.21 MB | 1 个文件

基于网页的质控切片存储与浏览平台,用于集中展示、检索和管理经过质量评估的病理切片及其结果。

包含文件:qcsliderepo-web-master.zip
安装教程(点击展开)
【质控切片网页库(qcsliderepo-web)安装教程】—— HistoQC

■ 前置条件
   · 已安装 Python 3.9 及以上(建议用 Conda 环境);建议同时装 OpenSlide(读 .svs 等全片图需要)。

■ 本扩展是什么
   基于网页的质控切片存储与浏览平台,用于集中展示、检索和管理经过质量评估的病理切片及其结果。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
   · .zip 是官方仓库源码包;DSA 插件为可直接上传的插件包。

■ 安装步骤
   1. 解压本目录的 .zip。
   2. 命令行进入解压目录,执行 pip install -e .  (或 pip install -r requirements.txt)
   3. 运行质控:histoqc 切片目录 -o 输出目录 -c 配置文件  (具体参数见包内 README)
   4. 若本包是 Digital Slide Archive 插件:登录 DSA → 插件 页面 → 上传本 .zip → 启用。
   5. 若是 QuPath 配合脚本:把脚本放到 QuPath 的 scripts 目录,在 Extensions → Script Editor 里运行。

■ 验证是否装好
   · 命令行执行 histoqc --help 能输出帮助。
   · DSA 插件上传后能在插件列表里看到 HistoQC。

■ 常见问题
   · 报 OpenSlide 缺失:先装 openslide-python 与 OpenSlide 二进制(Windows 解压官方 release 后加入 PATH)。
   · 读图报错:确认切片格式在 OpenSlide 支持范围内。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/qcsliderepo-web
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「质控切片网页库」,即为成功。
   · 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
   · 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/qcsliderepo-web
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QuickAnnotator · 快速图像标注工具

util | 3.75 MB | 1 个文件

开源的数字病理图像快速标注工具,支持交互式绘制标注区域,用于构建训练数据与验证标注结果。

包含文件:QuickAnnotator-main.zip
安装教程(点击展开)
【快速图像标注工具(QuickAnnotator)安装教程】—— HistoQC

■ 前置条件
   · 已安装 Python 3.9 及以上(建议用 Conda 环境);建议同时装 OpenSlide(读 .svs 等全片图需要)。

■ 本扩展是什么
   开源的数字病理图像快速标注工具,支持交互式绘制标注区域,用于构建训练数据与验证标注结果。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
   · .zip 是官方仓库源码包;DSA 插件为可直接上传的插件包。

■ 安装步骤
   1. 解压本目录的 .zip。
   2. 命令行进入解压目录,执行 pip install -e .  (或 pip install -r requirements.txt)
   3. 运行质控:histoqc 切片目录 -o 输出目录 -c 配置文件  (具体参数见包内 README)
   4. 若本包是 Digital Slide Archive 插件:登录 DSA → 插件 页面 → 上传本 .zip → 启用。
   5. 若是 QuPath 配合脚本:把脚本放到 QuPath 的 scripts 目录,在 Extensions → Script Editor 里运行。

■ 验证是否装好
   · 命令行执行 histoqc --help 能输出帮助。
   · DSA 插件上传后能在插件列表里看到 HistoQC。

■ 常见问题
   · 报 OpenSlide 缺失:先装 openslide-python 与 OpenSlide 二进制(Windows 解压官方 release 后加入 PATH)。
   · 读图报错:确认切片格式在 OpenSlide 支持范围内。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/QuickAnnotator
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「快速图像标注工具」,即为成功。
   · 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
   · 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/QuickAnnotator
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QuickReviewer · 切片质控审阅工具

util | 3.3 MB | 1 个文件

用于快速浏览和审阅病理切片质控结果的界面工具,帮助评审者查看问题区域并确认切片可否用于分析。

包含文件:QuickReviewer-master.zip
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【切片质控审阅工具(QuickReviewer)安装教程】—— HistoQC

■ 前置条件
   · 已安装 Python 3.9 及以上(建议用 Conda 环境);建议同时装 OpenSlide(读 .svs 等全片图需要)。

■ 本扩展是什么
   用于快速浏览和审阅病理切片质控结果的界面工具,帮助评审者查看问题区域并确认切片可否用于分析。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
   · .zip 是官方仓库源码包;DSA 插件为可直接上传的插件包。

■ 安装步骤
   1. 解压本目录的 .zip。
   2. 命令行进入解压目录,执行 pip install -e .  (或 pip install -r requirements.txt)
   3. 运行质控:histoqc 切片目录 -o 输出目录 -c 配置文件  (具体参数见包内 README)
   4. 若本包是 Digital Slide Archive 插件:登录 DSA → 插件 页面 → 上传本 .zip → 启用。
   5. 若是 QuPath 配合脚本:把脚本放到 QuPath 的 scripts 目录,在 Extensions → Script Editor 里运行。

■ 验证是否装好
   · 命令行执行 histoqc --help 能输出帮助。
   · DSA 插件上传后能在插件列表里看到 HistoQC。

■ 常见问题
   · 报 OpenSlide 缺失:先装 openslide-python 与 OpenSlide 二进制(Windows 解压官方 release 后加入 PATH)。
   · 读图报错:确认切片格式在 OpenSlide 支持范围内。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/QuickReviewer
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「切片质控审阅工具」,即为成功。
   · 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
   · 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/QuickReviewer
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QuPathPaquoIntegration · 标注软件数据集成

util | 0.01 MB | 1 个文件

实现病理图像分析软件与编程标注库之间的数据交互,便于在脚本中读写和管理切片的标注结果。

包含文件:QuPathPaquoIntegration-main.zip
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【标注软件数据集成(QuPathPaquoIntegration)安装教程】—— HistoQC

■ 前置条件
   · 已安装 Python 3.9 及以上(建议用 Conda 环境);建议同时装 OpenSlide(读 .svs 等全片图需要)。

■ 本扩展是什么
   实现病理图像分析软件与编程标注库之间的数据交互,便于在脚本中读写和管理切片的标注结果。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
   · .zip 是官方仓库源码包;DSA 插件为可直接上传的插件包。

■ 安装步骤
   1. 解压本目录的 .zip。
   2. 命令行进入解压目录,执行 pip install -e .  (或 pip install -r requirements.txt)
   3. 运行质控:histoqc 切片目录 -o 输出目录 -c 配置文件  (具体参数见包内 README)
   4. 若本包是 Digital Slide Archive 插件:登录 DSA → 插件 页面 → 上传本 .zip → 启用。
   5. 若是 QuPath 配合脚本:把脚本放到 QuPath 的 scripts 目录,在 Extensions → Script Editor 里运行。

■ 验证是否装好
   · 命令行执行 histoqc --help 能输出帮助。
   · DSA 插件上传后能在插件列表里看到 HistoQC。

■ 常见问题
   · 报 OpenSlide 缺失:先装 openslide-python 与 OpenSlide 二进制(Windows 解压官方 release 后加入 PATH)。
   · 读图报错:确认切片格式在 OpenSlide 支持范围内。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/QuPathPaquoIntegration
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「标注软件数据集成」,即为成功。
   · 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
   · 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/QuPathPaquoIntegration
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

TortuGrade · 组织曲折度分级工具

util | 0 MB | 1 个文件

对组织或纤维结构的曲折程度进行量化分级,用于病理形态学研究中比较不同样本之间的形态差异。

包含文件:TortuGrade-main.zip
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【组织曲折度分级工具(TortuGrade)安装教程】—— HistoQC

■ 前置条件
   · 已安装 Python 3.9 及以上(建议用 Conda 环境);建议同时装 OpenSlide(读 .svs 等全片图需要)。

■ 本扩展是什么
   对组织或纤维结构的曲折程度进行量化分级,用于病理形态学研究中比较不同样本之间的形态差异。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
   · .zip 是官方仓库源码包;DSA 插件为可直接上传的插件包。

■ 安装步骤
   1. 解压本目录的 .zip。
   2. 命令行进入解压目录,执行 pip install -e .  (或 pip install -r requirements.txt)
   3. 运行质控:histoqc 切片目录 -o 输出目录 -c 配置文件  (具体参数见包内 README)
   4. 若本包是 Digital Slide Archive 插件:登录 DSA → 插件 页面 → 上传本 .zip → 启用。
   5. 若是 QuPath 配合脚本:把脚本放到 QuPath 的 scripts 目录,在 Extensions → Script Editor 里运行。

■ 验证是否装好
   · 命令行执行 histoqc --help 能输出帮助。
   · DSA 插件上传后能在插件列表里看到 HistoQC。

■ 常见问题
   · 报 OpenSlide 缺失:先装 openslide-python 与 OpenSlide 二进制(Windows 解压官方 release 后加入 PATH)。
   · 读图报错:确认切片格式在 OpenSlide 支持范围内。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/TortuGrade
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「组织曲折度分级工具」,即为成功。
   · 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
   · 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/choosehappy/TortuGrade
   开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。

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