MetaboAnalyst 插件合集（共 2 个）

【MetaboAnalyst 核心分析包（MetaboAnalystR）安装教程】—— MetaboAnalyst

■ 前置条件
   · 已安装 R（4.0 及以上）与 RStudio（可选）。
   · 本目录是 MetaboAnalyst 官方 R 包（.tar.gz），用于本地/离线做代谢组学分析。

■ 本插件是什么
   MetaboAnalyst 网页版背后的 R 函数与算法库，覆盖代谢组数据的统计分析、可视化与功能解释，可在本地复现网页版的分析结果。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：源码压缩包（.tar.gz）。
   · .tar.gz 是 R 源码包，用 R 的本地安装命令安装，不要解压。

■ 安装步骤
   1. 打开 R 或 RStudio。
   2. 先装依赖：install.packages(c("remotes","BiocManager"))，再按包内 DESCRIPTION 提示安装依赖（如 mzR、MSnbase 等 Bioconductor 包）。
   3. 本地安装本包（把路径换成你存放 .tar.gz 的目录）：
      install.packages("本包文件名.tar.gz", repos = NULL, type = "source")
   4. 加载验证：library(MetaboAnalystR)（或对应包名），不报错即安装成功。

■ 注意事项
   · Windows 上部分依赖需要 Rtools 才能源码编译，建议用 Rtools44 对应你的 R 版本。
   · 网页版 MetaboAnalyst 与本地 R 包的分析结果一致，离线/数据保密的场景建议用本地包。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「MetaboAnalyst 核心分析包」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/xia-lab/MetaboAnalystR
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【质谱数据处理模块（OptiLCMS）安装教程】—— MetaboAnalyst

■ 前置条件
   · 已安装 R（4.0 及以上）与 RStudio（可选）。
   · 本目录是 MetaboAnalyst 官方 R 包（.tar.gz），用于本地/离线做代谢组学分析。

■ 本插件是什么
   MetaboAnalyst 的 MS Spectral Processing 模块的 R 实现，提供优化的 LC-MS 原始数据处理流程，可在本地复现网页版的质谱谱图处理结果。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：源码压缩包（.tar.gz）。
   · .tar.gz 是 R 源码包，用 R 的本地安装命令安装，不要解压。

■ 安装步骤
   1. 打开 R 或 RStudio。
   2. 先装依赖：install.packages(c("remotes","BiocManager"))，再按包内 DESCRIPTION 提示安装依赖（如 mzR、MSnbase 等 Bioconductor 包）。
   3. 本地安装本包（把路径换成你存放 .tar.gz 的目录）：
      install.packages("本包文件名.tar.gz", repos = NULL, type = "source")
   4. 加载验证：library(MetaboAnalystR)（或对应包名），不报错即安装成功。

■ 注意事项
   · Windows 上部分依赖需要 Rtools 才能源码编译，建议用 Rtools44 对应你的 R 版本。
   · 网页版 MetaboAnalyst 与本地 R 包的分析结果一致，离线/数据保密的场景建议用本地包。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「质谱数据处理模块」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/xia-lab/OptiLCMS
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。