CERR 插件合集(共 21 个)
放射治疗计算环境(官方扩展与分割模型包) | 分类:医学三维影像 | 每个插件都附中文说明与安装教程,下载走百度网盘 / 夸克网盘。
插件清单
autoseg_container_boilerplate · 自动分割容器样板
util | 0.01 MB | 1 个文件
为自制深度学习模型接入 CERR 自动分割流程提供的样板代码,包含 Python 包装脚本、Singularity 容器配方与网络权重目录,便于把自有模型容器化后在 CERR 中调用。
包含文件:autoseg_container_boilerplate-main.zip
安装教程(点击展开)
【自动分割容器样板(autoseg_container_boilerplate)安装教程】—— CERR
■ 前置条件
· 已安装 CERR(MATLAB 或 Octave 版,官网 https://cerr.github.io/CERR/ )。
■ 本扩展是什么
为自制深度学习模型接入 CERR 自动分割流程提供的样板代码,包含 Python 包装脚本、Singularity 容器配方与网络权重目录,便于把自有模型容器化后在 CERR 中调用。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方扩展 / 深度学习分割模型包(含 MATLAB/Octave 脚本与模型元数据)。
■ 安装步骤
1. 启动 CERR。
2. 深度学习分割模型:用官方模型安装器 model_installer 一键安装,或运行安装脚本后选择本地包。
3. 其它扩展包:解压后把目录加入 CERR 路径(addToPath),或在 CERROptions 里登记插件目录。
4. 重启 CERR,在分割 / 剂量 / 计划评估等模块里即可看到新增功能。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「自动分割容器样板」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/cerr/autoseg_container_boilerplate
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
cerr-docker · CERR容器化运行环境
util | 0.01 MB | 1 个文件
在 Docker 容器中运行 CERR 与 Octave,并可选配 oct2py 桥接,内置放射组学特征提取与深度学习分割示例脚本,方便在没有 MATLAB 的环境下快速部署与演示。
包含文件:cerr-docker-main.zip
安装教程(点击展开)
【CERR容器化运行环境(cerr-docker)安装教程】—— CERR
■ 前置条件
· 已安装 CERR(MATLAB 或 Octave 版,官网 https://cerr.github.io/CERR/ )。
■ 本扩展是什么
在 Docker 容器中运行 CERR 与 Octave,并可选配 oct2py 桥接,内置放射组学特征提取与深度学习分割示例脚本,方便在没有 MATLAB 的环境下快速部署与演示。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方扩展 / 深度学习分割模型包(含 MATLAB/Octave 脚本与模型元数据)。
■ 安装步骤
1. 启动 CERR。
2. 深度学习分割模型:用官方模型安装器 model_installer 一键安装,或运行安装脚本后选择本地包。
3. 其它扩展包:解压后把目录加入 CERR 路径(addToPath),或在 CERROptions 里登记插件目录。
4. 重启 CERR,在分割 / 剂量 / 计划评估等模块里即可看到新增功能。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「CERR容器化运行环境」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/cerr/cerr-docker
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CT_cardiac_structures_deeplab · 心脏亚结构分割模型
util | 0.68 MB | 1 个文件
基于 DeepLab 的深度学习模型,用于头位仰卧位放疗计划 CT 扫描的心脏及其亚结构自动分割,可勾画主动脉、上下腔静脉、肺动脉、左右心房心室以及心包等结构。
包含文件:CT_cardiac_structures_deeplab-master.zip
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【心脏亚结构分割模型(CT_cardiac_structures_deeplab)安装教程】—— CERR
■ 前置条件
· 已安装 CERR(MATLAB 或 Octave 版,官网 https://cerr.github.io/CERR/ )。
■ 本扩展是什么
基于 DeepLab 的深度学习模型,用于头位仰卧位放疗计划 CT 扫描的心脏及其亚结构自动分割,可勾画主动脉、上下腔静脉、肺动脉、左右心房心室以及心包等结构。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方扩展 / 深度学习分割模型包(含 MATLAB/Octave 脚本与模型元数据)。
■ 安装步骤
1. 启动 CERR。
2. 深度学习分割模型:用官方模型安装器 model_installer 一键安装,或运行安装脚本后选择本地包。
3. 其它扩展包:解压后把目录加入 CERR 路径(addToPath),或在 CERROptions 里登记插件目录。
4. 重启 CERR,在分割 / 剂量 / 计划评估等模块里即可看到新增功能。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「心脏亚结构分割模型」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/cerr/CT_cardiac_structures_deeplab
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CT_HeadAndNeck_OARs · 头颈危及器官分割
util | 0.09 MB | 1 个文件
预训练深度学习模型,针对头颈部肿瘤放疗计划 CT 勾画危及器官,涵盖咬肌、翼内肌、喉、咽缩肌、腮腺、下颌下腺与下颌骨等,采用模型集成与自注意力网络。
包含文件:CT_HeadAndNeck_OARs-main.zip
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【头颈危及器官分割(CT_HeadAndNeck_OARs)安装教程】—— CERR
■ 前置条件
· 已安装 CERR(MATLAB 或 Octave 版,官网 https://cerr.github.io/CERR/ )。
■ 本扩展是什么
预训练深度学习模型,针对头颈部肿瘤放疗计划 CT 勾画危及器官,涵盖咬肌、翼内肌、喉、咽缩肌、腮腺、下颌下腺与下颌骨等,采用模型集成与自注意力网络。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方扩展 / 深度学习分割模型包(含 MATLAB/Octave 脚本与模型元数据)。
■ 安装步骤
1. 启动 CERR。
2. 深度学习分割模型:用官方模型安装器 model_installer 一键安装,或运行安装脚本后选择本地包。
3. 其它扩展包:解压后把目录加入 CERR 路径(addToPath),或在 CERROptions 里登记插件目录。
4. 重启 CERR,在分割 / 剂量 / 计划评估等模块里即可看到新增功能。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「头颈危及器官分割」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/cerr/CT_HeadAndNeck_OARs
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CT_HeartSubstruct_SMIT · 心脏亚结构精细分割
util | 0.19 MB | 1 个文件
采用 SMIT 自监督 Transformer 的分割模型,用于放疗计划 CT 中全心及其亚结构(心房、心室、心包等)的自动勾画,辅助心脏剂量评估与放射性心脏损伤研究。
包含文件:CT_HeartSubstruct_SMIT-main.zip
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【心脏亚结构精细分割(CT_HeartSubstruct_SMIT)安装教程】—— CERR
■ 前置条件
· 已安装 CERR(MATLAB 或 Octave 版,官网 https://cerr.github.io/CERR/ )。
■ 本扩展是什么
采用 SMIT 自监督 Transformer 的分割模型,用于放疗计划 CT 中全心及其亚结构(心房、心室、心包等)的自动勾画,辅助心脏剂量评估与放射性心脏损伤研究。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方扩展 / 深度学习分割模型包(含 MATLAB/Octave 脚本与模型元数据)。
■ 安装步骤
1. 启动 CERR。
2. 深度学习分割模型:用官方模型安装器 model_installer 一键安装,或运行安装脚本后选择本地包。
3. 其它扩展包:解压后把目录加入 CERR 路径(addToPath),或在 CERROptions 里登记插件目录。
4. 重启 CERR,在分割 / 剂量 / 计划评估等模块里即可看到新增功能。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「心脏亚结构精细分割」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/cerr/CT_HeartSubstruct_SMIT
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CT_HN_SMIT · 头颈部智能分割模型
util | 0.19 MB | 1 个文件
基于 SMIT 自监督视觉 Transformer 的智能分割模型,对头颈部 CT 扫描的多个解剖结构进行自动勾画,适用于放疗计划中器官轮廓的快速生成与批量处理。
包含文件:CT_HN_SMIT-main.zip
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【头颈部智能分割模型(CT_HN_SMIT)安装教程】—— CERR
■ 前置条件
· 已安装 CERR(MATLAB 或 Octave 版,官网 https://cerr.github.io/CERR/ )。
■ 本扩展是什么
基于 SMIT 自监督视觉 Transformer 的智能分割模型,对头颈部 CT 扫描的多个解剖结构进行自动勾画,适用于放疗计划中器官轮廓的快速生成与批量处理。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方扩展 / 深度学习分割模型包(含 MATLAB/Octave 脚本与模型元数据)。
■ 安装步骤
1. 启动 CERR。
2. 深度学习分割模型:用官方模型安装器 model_installer 一键安装,或运行安装脚本后选择本地包。
3. 其它扩展包:解压后把目录加入 CERR 路径(addToPath),或在 CERROptions 里登记插件目录。
4. 重启 CERR,在分割 / 剂量 / 计划评估等模块里即可看到新增功能。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「头颈部智能分割模型」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
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https://github.com/cerr/CT_HN_SMIT
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CT_Lung_SMIT · 肺部智能分割模型
util | 0.19 MB | 1 个文件
基于 SMIT 自监督 Transformer 的深度学习模型,对胸部 CT 扫描进行肺癌相关的解剖结构自动分割,支持放疗计划中的肺部与肿瘤区域勾画。
包含文件:CT_Lung_SMIT-main.zip
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【肺部智能分割模型(CT_Lung_SMIT)安装教程】—— CERR
■ 前置条件
· 已安装 CERR(MATLAB 或 Octave 版,官网 https://cerr.github.io/CERR/ )。
■ 本扩展是什么
基于 SMIT 自监督 Transformer 的深度学习模型,对胸部 CT 扫描进行肺癌相关的解剖结构自动分割,支持放疗计划中的肺部与肿瘤区域勾画。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方扩展 / 深度学习分割模型包(含 MATLAB/Octave 脚本与模型元数据)。
■ 安装步骤
1. 启动 CERR。
2. 深度学习分割模型:用官方模型安装器 model_installer 一键安装,或运行安装脚本后选择本地包。
3. 其它扩展包:解压后把目录加入 CERR 路径(addToPath),或在 CERROptions 里登记插件目录。
4. 重启 CERR,在分割 / 剂量 / 计划评估等模块里即可看到新增功能。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「肺部智能分割模型」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/cerr/CT_Lung_SMIT
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CT_LungOAR_incrMRRN · 肺危及器官分割模型
util | 0.02 MB | 1 个文件
面向肺癌放疗的预训练模型,在头位仰卧位计划 CT 上自动分割危及器官,可勾画左右肺、心脏、食管、脊髓与近端支气管树,采用增量多分辨率残差网络。
包含文件:CT_LungOAR_incrMRRN-main.zip
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【肺危及器官分割模型(CT_LungOAR_incrMRRN)安装教程】—— CERR
■ 前置条件
· 已安装 CERR(MATLAB 或 Octave 版,官网 https://cerr.github.io/CERR/ )。
■ 本扩展是什么
面向肺癌放疗的预训练模型,在头位仰卧位计划 CT 上自动分割危及器官,可勾画左右肺、心脏、食管、脊髓与近端支气管树,采用增量多分辨率残差网络。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方扩展 / 深度学习分割模型包(含 MATLAB/Octave 脚本与模型元数据)。
■ 安装步骤
1. 启动 CERR。
2. 深度学习分割模型:用官方模型安装器 model_installer 一键安装,或运行安装脚本后选择本地包。
3. 其它扩展包:解压后把目录加入 CERR 路径(addToPath),或在 CERROptions 里登记插件目录。
4. 重启 CERR,在分割 / 剂量 / 计划评估等模块里即可看到新增功能。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「肺危及器官分割模型」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/cerr/CT_LungOAR_incrMRRN
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CT_WHOLEBODY_SMITplus · 全身器官分割模型
util | 0.19 MB | 1 个文件
基于 SMIT 自监督 Transformer 的全身 CT 分割模型,可在放疗计划扫描中一次勾画多个全身解剖结构,适合全身器官的快速轮廓生成与剂量学分析。
包含文件:CT_WHOLEBODY_SMITplus-main.zip
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【全身器官分割模型(CT_WHOLEBODY_SMITplus)安装教程】—— CERR
■ 前置条件
· 已安装 CERR(MATLAB 或 Octave 版,官网 https://cerr.github.io/CERR/ )。
■ 本扩展是什么
基于 SMIT 自监督 Transformer 的全身 CT 分割模型,可在放疗计划扫描中一次勾画多个全身解剖结构,适合全身器官的快速轮廓生成与剂量学分析。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方扩展 / 深度学习分割模型包(含 MATLAB/Octave 脚本与模型元数据)。
■ 安装步骤
1. 启动 CERR。
2. 深度学习分割模型:用官方模型安装器 model_installer 一键安装,或运行安装脚本后选择本地包。
3. 其它扩展包:解压后把目录加入 CERR 路径(addToPath),或在 CERROptions 里登记插件目录。
4. 重启 CERR,在分割 / 剂量 / 计划评估等模块里即可看到新增功能。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「全身器官分割模型」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/cerr/CT_WHOLEBODY_SMITplus
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
dl_segmentation · 深度学习分割模型库
util | 0.02 MB | 1 个文件
深度学习分割模型的包装脚本与网络权重集合,为每个模型提供 Jupyter 笔记本以说明环境搭建与调用方式,并提供可从 CERR 运行的 Singularity 容器。
包含文件:dl_segmentation-master.zip
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【深度学习分割模型库(dl_segmentation)安装教程】—— CERR
■ 前置条件
· 已安装 CERR(MATLAB 或 Octave 版,官网 https://cerr.github.io/CERR/ )。
■ 本扩展是什么
深度学习分割模型的包装脚本与网络权重集合,为每个模型提供 Jupyter 笔记本以说明环境搭建与调用方式,并提供可从 CERR 运行的 Singularity 容器。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方扩展 / 深度学习分割模型包(含 MATLAB/Octave 脚本与模型元数据)。
■ 安装步骤
1. 启动 CERR。
2. 深度学习分割模型:用官方模型安装器 model_installer 一键安装,或运行安装脚本后选择本地包。
3. 其它扩展包:解压后把目录加入 CERR 路径(addToPath),或在 CERROptions 里登记插件目录。
4. 重启 CERR,在分割 / 剂量 / 计划评估等模块里即可看到新增功能。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「深度学习分割模型库」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/cerr/dl_segmentation
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
fdg2fmiso_hn_pix2pix · 头颈肿瘤乏氧预测
util | 3.34 MB | 1 个文件
基于 pix2pix 生成对抗网络的模型,可由头颈部患者的 FDG PET 影像预测肿瘤乏氧 FMISO 摄取,用于放疗研究中的乏氧评估,需输入 FDG 影像与肿瘤分割。
包含文件:fdg2fmiso_hn_pix2pix-main.zip
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【头颈肿瘤乏氧预测(fdg2fmiso_hn_pix2pix)安装教程】—— CERR
■ 前置条件
· 已安装 CERR(MATLAB 或 Octave 版,官网 https://cerr.github.io/CERR/ )。
■ 本扩展是什么
基于 pix2pix 生成对抗网络的模型,可由头颈部患者的 FDG PET 影像预测肿瘤乏氧 FMISO 摄取,用于放疗研究中的乏氧评估,需输入 FDG 影像与肿瘤分割。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方扩展 / 深度学习分割模型包(含 MATLAB/Octave 脚本与模型元数据)。
■ 安装步骤
1. 启动 CERR。
2. 深度学习分割模型:用官方模型安装器 model_installer 一键安装,或运行安装脚本后选择本地包。
3. 其它扩展包:解压后把目录加入 CERR 路径(addToPath),或在 CERROptions 里登记插件目录。
4. 重启 CERR,在分割 / 剂量 / 计划评估等模块里即可看到新增功能。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「头颈肿瘤乏氧预测」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/cerr/fdg2fmiso_hn_pix2pix
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
model_installer · 模型安装器
util | 0.01 MB | 1 个文件
CERR 分割模型安装器,用于在本地下载并部署网络权重、推理脚本与 Python 环境,支持交互或命令行选择模型,一键搭建 AI 分割与配准的运行环境。
包含文件:model_installer-main.zip
安装教程(点击展开)
【模型安装器(model_installer)安装教程】—— CERR
■ 前置条件
· 已安装 CERR(MATLAB 或 Octave 版,官网 https://cerr.github.io/CERR/ )。
■ 本扩展是什么
CERR 分割模型安装器,用于在本地下载并部署网络权重、推理脚本与 Python 环境,支持交互或命令行选择模型,一键搭建 AI 分割与配准的运行环境。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方扩展 / 深度学习分割模型包(含 MATLAB/Octave 脚本与模型元数据)。
■ 安装步骤
1. 启动 CERR。
2. 深度学习分割模型:用官方模型安装器 model_installer 一键安装,或运行安装脚本后选择本地包。
3. 其它扩展包:解压后把目录加入 CERR 路径(addToPath),或在 CERROptions 里登记插件目录。
4. 重启 CERR,在分割 / 剂量 / 计划评估等模块里即可看到新增功能。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「模型安装器」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/cerr/model_installer
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
MR_HN_Nodule_SMIT · 头颈MR结节分割
util | 0.2 MB | 1 个文件
基于 SMIT 自监督 Transformer 的头颈部 MR 分割模型,用于自动勾画颈部结节或肿瘤靶区,辅助 MRI 影像上的病灶识别与放疗研究分析。
包含文件:MR_HN_Nodule_SMIT-main.zip
安装教程(点击展开)
【头颈MR结节分割(MR_HN_Nodule_SMIT)安装教程】—— CERR
■ 前置条件
· 已安装 CERR(MATLAB 或 Octave 版,官网 https://cerr.github.io/CERR/ )。
■ 本扩展是什么
基于 SMIT 自监督 Transformer 的头颈部 MR 分割模型,用于自动勾画颈部结节或肿瘤靶区,辅助 MRI 影像上的病灶识别与放疗研究分析。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方扩展 / 深度学习分割模型包(含 MATLAB/Octave 脚本与模型元数据)。
■ 安装步骤
1. 启动 CERR。
2. 深度学习分割模型:用官方模型安装器 model_installer 一键安装,或运行安装脚本后选择本地包。
3. 其它扩展包:解压后把目录加入 CERR 路径(addToPath),或在 CERROptions 里登记插件目录。
4. 重启 CERR,在分割 / 剂量 / 计划评估等模块里即可看到新增功能。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「头颈MR结节分割」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/cerr/MR_HN_Nodule_SMIT
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MR_Prostate_Deeplab · 前列腺靶区与器官分割
util | 0.05 MB | 1 个文件
基于 DeepLab 的预训练模型,针对前列腺癌患者头位仰卧位 T2 加权 MRI,自动分割临床靶区与危及器官,包括膀胱、直肠、尿道球部与大肠等结构。
包含文件:MR_Prostate_Deeplab-main.zip
安装教程(点击展开)
【前列腺靶区与器官分割(MR_Prostate_Deeplab)安装教程】—— CERR
■ 前置条件
· 已安装 CERR(MATLAB 或 Octave 版,官网 https://cerr.github.io/CERR/ )。
■ 本扩展是什么
基于 DeepLab 的预训练模型,针对前列腺癌患者头位仰卧位 T2 加权 MRI,自动分割临床靶区与危及器官,包括膀胱、直肠、尿道球部与大肠等结构。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方扩展 / 深度学习分割模型包(含 MATLAB/Octave 脚本与模型元数据)。
■ 安装步骤
1. 启动 CERR。
2. 深度学习分割模型:用官方模型安装器 model_installer 一键安装,或运行安装脚本后选择本地包。
3. 其它扩展包:解压后把目录加入 CERR 路径(addToPath),或在 CERROptions 里登记插件目录。
4. 重启 CERR,在分割 / 剂量 / 计划评估等模块里即可看到新增功能。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「前列腺靶区与器官分割」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
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MR_Rectum_GTV_SMIT · 直肠肿瘤靶区分割
util | 0.09 MB | 1 个文件
基于 SMIT 自监督 Transformer 的 MR 分割模型,用于直肠癌放疗患者 MRI 影像上肿瘤大体靶区 GTV 的自动勾画,支持靶区范围的快速确定。
包含文件:MR_Rectum_GTV_SMIT-main.zip
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【直肠肿瘤靶区分割(MR_Rectum_GTV_SMIT)安装教程】—— CERR
■ 前置条件
· 已安装 CERR(MATLAB 或 Octave 版,官网 https://cerr.github.io/CERR/ )。
■ 本扩展是什么
基于 SMIT 自监督 Transformer 的 MR 分割模型,用于直肠癌放疗患者 MRI 影像上肿瘤大体靶区 GTV 的自动勾画,支持靶区范围的快速确定。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方扩展 / 深度学习分割模型包(含 MATLAB/Octave 脚本与模型元数据)。
■ 安装步骤
1. 启动 CERR。
2. 深度学习分割模型:用官方模型安装器 model_installer 一键安装,或运行安装脚本后选择本地包。
3. 其它扩展包:解压后把目录加入 CERR 路径(addToPath),或在 CERROptions 里登记插件目录。
4. 重启 CERR,在分割 / 剂量 / 计划评估等模块里即可看到新增功能。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「直肠肿瘤靶区分割」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/cerr/MR_Rectum_GTV_SMIT
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
MRI_Pancreas_Fullshot_AnatomicCtxShape · 胰腺纵向配准分割
util | 21.01 MB | 1 个文件
针对胰腺癌放疗的 MRI 分割与纵向配准模型,在 T2 加权影像上勾画肝脏、大小肠与十二指肠等危及器官,并输出形变向量场用于多时相影像对齐。
包含文件:MRI_Pancreas_Fullshot_AnatomicCtxShape-main.zip
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【胰腺纵向配准分割(MRI_Pancreas_Fullshot_AnatomicCtxShape)安装教程】—— CERR
■ 前置条件
· 已安装 CERR(MATLAB 或 Octave 版,官网 https://cerr.github.io/CERR/ )。
■ 本扩展是什么
针对胰腺癌放疗的 MRI 分割与纵向配准模型,在 T2 加权影像上勾画肝脏、大小肠与十二指肠等危及器官,并输出形变向量场用于多时相影像对齐。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方扩展 / 深度学习分割模型包(含 MATLAB/Octave 脚本与模型元数据)。
■ 安装步骤
1. 启动 CERR。
2. 深度学习分割模型:用官方模型安装器 model_installer 一键安装,或运行安装脚本后选择本地包。
3. 其它扩展包:解压后把目录加入 CERR 路径(addToPath),或在 CERROptions 里登记插件目录。
4. 重启 CERR,在分割 / 剂量 / 计划评估等模块里即可看到新增功能。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「胰腺纵向配准分割」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/cerr/MRI_Pancreas_Fullshot_AnatomicCtxShape
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MSK_MedPhys_Biomed · 医学物理三维打印
util | 1.06 MB | 1 个文件
来自纪念斯隆凯特琳癌症中心医学物理与生物医学部门的开源资源库,汇集放射治疗研究相关的数据处理脚本与三维打印医疗物资(如防护面罩)的设计文件。
包含文件:MSK_MedPhys_Biomed-master.zip
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【医学物理三维打印(MSK_MedPhys_Biomed)安装教程】—— CERR
■ 前置条件
· 已安装 CERR(MATLAB 或 Octave 版,官网 https://cerr.github.io/CERR/ )。
■ 本扩展是什么
来自纪念斯隆凯特琳癌症中心医学物理与生物医学部门的开源资源库,汇集放射治疗研究相关的数据处理脚本与三维打印医疗物资(如防护面罩)的设计文件。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方扩展 / 深度学习分割模型包(含 MATLAB/Octave 脚本与模型元数据)。
■ 安装步骤
1. 启动 CERR。
2. 深度学习分割模型:用官方模型安装器 model_installer 一键安装,或运行安装脚本后选择本地包。
3. 其它扩展包:解压后把目录加入 CERR 路径(addToPath),或在 CERROptions 里登记插件目录。
4. 重启 CERR,在分割 / 剂量 / 计划评估等模块里即可看到新增功能。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「医学物理三维打印」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/cerr/MSK_MedPhys_Biomed
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pyCERR · 医学影像计算Python库
util | 58.07 MB | 1 个文件
CERR 的 Python 实现库,提供统一的 PlanC 数据结构来管理影像与剂量元数据,支持 DICOM 与 NIfTI 导入导出、图像分割、放射组学特征提取及 AI 模型推理。
包含文件:pyCERR-main.zip
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【医学影像计算Python库(pyCERR)安装教程】—— CERR
■ 前置条件
· 已安装 CERR(MATLAB 或 Octave 版,官网 https://cerr.github.io/CERR/ )。
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CERR 的 Python 实现库,提供统一的 PlanC 数据结构来管理影像与剂量元数据,支持 DICOM 与 NIfTI 导入导出、图像分割、放射组学特征提取及 AI 模型推理。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方扩展 / 深度学习分割模型包(含 MATLAB/Octave 脚本与模型元数据)。
■ 安装步骤
1. 启动 CERR。
2. 深度学习分割模型:用官方模型安装器 model_installer 一键安装,或运行安装脚本后选择本地包。
3. 其它扩展包:解压后把目录加入 CERR 路径(addToPath),或在 CERROptions 里登记插件目录。
4. 重启 CERR,在分割 / 剂量 / 计划评估等模块里即可看到新增功能。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「医学影像计算Python库」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
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https://github.com/cerr/pyCERR
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pyCERR-Notebooks · 影像分析示例笔记本
util | 9.94 MB | 1 个文件
pyCERR 的示例笔记本集合,涵盖影像与分割的可视化、DICOM 数据导入、放射组学与剂量体积直方图分析,以及 AI 分割与配准模型的调用示范。
包含文件:pyCERR-Notebooks-main.zip
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【影像分析示例笔记本(pyCERR-Notebooks)安装教程】—— CERR
■ 前置条件
· 已安装 CERR(MATLAB 或 Octave 版,官网 https://cerr.github.io/CERR/ )。
■ 本扩展是什么
pyCERR 的示例笔记本集合,涵盖影像与分割的可视化、DICOM 数据导入、放射组学与剂量体积直方图分析,以及 AI 分割与配准模型的调用示范。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方扩展 / 深度学习分割模型包(含 MATLAB/Octave 脚本与模型元数据)。
■ 安装步骤
1. 启动 CERR。
2. 深度学习分割模型:用官方模型安装器 model_installer 一键安装,或运行安装脚本后选择本地包。
3. 其它扩展包:解压后把目录加入 CERR 路径(addToPath),或在 CERROptions 里登记插件目录。
4. 重启 CERR,在分割 / 剂量 / 计划评估等模块里即可看到新增功能。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「影像分析示例笔记本」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/cerr/pyCERR-Notebooks
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slicerr · 三维切片与CERR桥接
util | 0.34 MB | 1 个文件
3DSlicer 与 CERR 之间的接口,借助 oct2py 桥接在三维切片器中调用 CERR 功能,实现影像导入、分割与可视化,方便在 Slicer 内使用放射治疗研究工具。
包含文件:slicerr-main.zip
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【三维切片与CERR桥接(slicerr)安装教程】—— CERR
■ 前置条件
· 已安装 CERR(MATLAB 或 Octave 版,官网 https://cerr.github.io/CERR/ )。
■ 本扩展是什么
3DSlicer 与 CERR 之间的接口,借助 oct2py 桥接在三维切片器中调用 CERR 功能,实现影像导入、分割与可视化,方便在 Slicer 内使用放射治疗研究工具。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方扩展 / 深度学习分割模型包(含 MATLAB/Octave 脚本与模型元数据)。
■ 安装步骤
1. 启动 CERR。
2. 深度学习分割模型:用官方模型安装器 model_installer 一键安装,或运行安装脚本后选择本地包。
3. 其它扩展包:解压后把目录加入 CERR 路径(addToPath),或在 CERROptions 里登记插件目录。
4. 重启 CERR,在分割 / 剂量 / 计划评估等模块里即可看到新增功能。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「三维切片与CERR桥接」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/cerr/slicerr
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stratis · 影像剂量分析工作流
util | 0.03 MB | 1 个文件
面向影像与放射治疗剂量数据集分析的工作流集合,包含三维切片集成、放射组学与剂量学特征提取、图像配准及深度学习分割等可复用的示例笔记本。
包含文件:stratis-main.zip
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【影像剂量分析工作流(stratis)安装教程】—— CERR
■ 前置条件
· 已安装 CERR(MATLAB 或 Octave 版,官网 https://cerr.github.io/CERR/ )。
■ 本扩展是什么
面向影像与放射治疗剂量数据集分析的工作流集合,包含三维切片集成、放射组学与剂量学特征提取、图像配准及深度学习分割等可复用的示例笔记本。
■ 文件说明
· 本目录共 1 个文件:压缩包(.zip)。
· .zip 是官方扩展 / 深度学习分割模型包(含 MATLAB/Octave 脚本与模型元数据)。
■ 安装步骤
1. 启动 CERR。
2. 深度学习分割模型:用官方模型安装器 model_installer 一键安装,或运行安装脚本后选择本地包。
3. 其它扩展包:解压后把目录加入 CERR 路径(addToPath),或在 CERROptions 里登记插件目录。
4. 重启 CERR,在分割 / 剂量 / 计划评估等模块里即可看到新增功能。
■ 验证是否装好
· 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「影像剂量分析工作流」,即为成功。
· 若列表里没有,先看软件的日志(一般在 帮助 → 显示日志)里有没有该插件的报错。
■ 常见问题
· 提示版本不兼容:本店提供的插件版本与软件版本有对应关系,升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
· 装完没反应:确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀(如 .txt)。
· 与已有插件冲突:先在插件列表里停用同名插件再试。
■ 来源与版权
https://github.com/cerr/stratis
开源/免费发布,仅作学习研究用途;本教程由本店整理,请勿转载。
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