Benchling 插件合集（共 13 个）

【接口代码片段集（api-examples）安装教程】—— Benchling

■ 前置条件
   · 有 Benchling 帐号（云端平台，官网 https://www.benchling.com/ ）；开发类示例需 Python 环境。

■ 本扩展是什么
   Benchling 官方提供的 REST API 短代码片段集合，用最小示例说明如何调用接口完成常见操作，帮助开发者快速上手对接平台。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是官方/社区应用示例与 SDK 示例源码。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. 按 README 安装依赖（多为 `pip install -r requirements.txt`）。
   3. 在 Benchling 管理后台创建 API Key / 配置 App，把凭据填入本地环境变量或配置文件（凭据不要外传）。
   4. 运行示例脚本，按日志确认已连通 Benchling API。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「接口代码片段集」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/benchling/api-examples
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【官方应用示例合集（app-examples-python）安装教程】—— Benchling

■ 前置条件
   · 有 Benchling 帐号（云端平台，官网 https://www.benchling.com/ ）；开发类示例需 Python 环境。

■ 本扩展是什么
   Benchling 官方 Python 参考示例合集，包含多种自定义应用与画布应用范例，演示如何用官方 SDK 接入并同步 PubChem 分子等数据到平台。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是官方/社区应用示例与 SDK 示例源码。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. 按 README 安装依赖（多为 `pip install -r requirements.txt`）。
   3. 在 Benchling 管理后台创建 API Key / 配置 App，把凭据填入本地环境变量或配置文件（凭据不要外传）。
   4. 运行示例脚本，按日志确认已连通 Benchling API。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「官方应用示例合集」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/benchling/app-examples-python
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【用户监控面板（Benchling-Admin-Tool）安装教程】—— Benchling

■ 前置条件
   · 有 Benchling 帐号（云端平台，官网 https://www.benchling.com/ ）；开发类示例需 Python 环境。

■ 本扩展是什么
   只读的 Benchling 管理面板，集中查看用户身份、账号状态、最近活动时间与停用情况，帮助管理员监控机构内成员的使用与异常。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是官方/社区应用示例与 SDK 示例源码。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. 按 README 安装依赖（多为 `pip install -r requirements.txt`）。
   3. 在 Benchling 管理后台创建 API Key / 配置 App，把凭据填入本地环境变量或配置文件（凭据不要外传）。
   4. 运行示例脚本，按日志确认已连通 Benchling API。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「用户监控面板」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/jpwalker625/Benchling-Admin-Tool
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【多语言接口工具（benchling-api-utils）安装教程】—— Benchling

■ 前置条件
   · 有 Benchling 帐号（云端平台，官网 https://www.benchling.com/ ）；开发类示例需 Python 环境。

■ 本扩展是什么
   面向 Benchling 接口的实用工具集，提供多种编程语言的调用示例与封装，作为官方仅支持 Python 的 SDK 之外的灵活替代方案。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是官方/社区应用示例与 SDK 示例源码。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. 按 README 安装依赖（多为 `pip install -r requirements.txt`）。
   3. 在 Benchling 管理后台创建 API Key / 配置 App，把凭据填入本地环境变量或配置文件（凭据不要外传）。
   4. 运行示例脚本，按日志确认已连通 Benchling API。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「多语言接口工具」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/celleste-bio/benchling-api-utils
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【笔记本接口演示（benchling-jupyter-sdk-example）安装教程】—— Benchling

■ 前置条件
   · 有 Benchling 帐号（云端平台，官网 https://www.benchling.com/ ）；开发类示例需 Python 环境。

■ 本扩展是什么
   用 Jupyter 笔记本演示 Benchling Python SDK 用法的示例，包含可运行的 Notebook 与 Docker 环境，便于快速体验接口调用与数据操作。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是官方/社区应用示例与 SDK 示例源码。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. 按 README 安装依赖（多为 `pip install -r requirements.txt`）。
   3. 在 Benchling 管理后台创建 API Key / 配置 App，把凭据填入本地环境变量或配置文件（凭据不要外传）。
   4. 运行示例脚本，按日志确认已连通 Benchling API。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「笔记本接口演示」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/mattjtodd/benchling-jupyter-sdk-example
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【测序平台接入验证（benchling-seqera-poc）安装教程】—— Benchling

■ 前置条件
   · 有 Benchling 帐号（云端平台，官网 https://www.benchling.com/ ）；开发类示例需 Python 环境。

■ 本扩展是什么
   通过 Connect 把 Seqera 平台应用接入 Benchling 的概念验证项目，演示连接工作区并列出全部分析流程，用于评估云端流程调度集成方案。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是官方/社区应用示例与 SDK 示例源码。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. 按 README 安装依赖（多为 `pip install -r requirements.txt`）。
   3. 在 Benchling 管理后台创建 API Key / 配置 App，把凭据填入本地环境变量或配置文件（凭据不要外传）。
   4. 运行示例脚本，按日志确认已连通 Benchling API。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「测序平台接入验证」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/robnewman/benchling-seqera-poc
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【化合物同步应用（benchling_pubchem）安装教程】—— Benchling

■ 前置条件
   · 有 Benchling 帐号（云端平台，官网 https://www.benchling.com/ ）；开发类示例需 Python 环境。

■ 本扩展是什么
   基于官方教程扩展的 Benchling 应用，借助 PubChem 接口检索分子并获取 SMILES 结构，把化合物数据同步到 Benchling，并改用 AWS 密钥管理配置。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是官方/社区应用示例与 SDK 示例源码。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. 按 README 安装依赖（多为 `pip install -r requirements.txt`）。
   3. 在 Benchling 管理后台创建 API Key / 配置 App，把凭据填入本地环境变量或配置文件（凭据不要外传）。
   4. 运行示例脚本，按日志确认已连通 Benchling API。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「化合物同步应用」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/Arkea-Bio-Corp/benchling_pubchem
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【数据模型浏览器（data-model-explorer）安装教程】—— Benchling

■ 前置条件
   · 有 Benchling 帐号（云端平台，官网 https://www.benchling.com/ ）；开发类示例需 Python 环境。

■ 本扩展是什么
   用于浏览与可视化 Benchling 机构数据模型的 Streamlit 应用，可查看模式结构、依赖关系与变更影响，帮助理解并管理平台中的数据建模。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是官方/社区应用示例与 SDK 示例源码。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. 按 README 安装依赖（多为 `pip install -r requirements.txt`）。
   3. 在 Benchling 管理后台创建 API Key / 配置 App，把凭据填入本地环境变量或配置文件（凭据不要外传）。
   4. 运行示例脚本，按日志确认已连通 Benchling API。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「数据模型浏览器」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/sahil-2424/data-model-explorer
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【接口集成示例集（integration-examples）安装教程】—— Benchling

■ 前置条件
   · 有 Benchling 帐号（云端平台，官网 https://www.benchling.com/ ）；开发类示例需 Python 环境。

■ 本扩展是什么
   Benchling 官方 API 集成示例（已标注为旧版）的集合，演示如何导入与注册实体、按时间戳导出数据、上传酶标仪结果和附件等常见对接用法。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是官方/社区应用示例与 SDK 示例源码。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. 按 README 安装依赖（多为 `pip install -r requirements.txt`）。
   3. 在 Benchling 管理后台创建 API Key / 配置 App，把凭据填入本地环境变量或配置文件（凭据不要外传）。
   4. 运行示例脚本，按日志确认已连通 Benchling API。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「接口集成示例集」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/benchling/integration-examples
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【数据集脚本示例（R-Datasets-Example）安装教程】—— Benchling

■ 前置条件
   · 有 Benchling 帐号（云端平台，官网 https://www.benchling.com/ ）；开发类示例需 Python 环境。

■ 本扩展是什么
   Benchling 官方开发者文档配套的 R 示例脚本，演示如何用 R 语言把数据集导入和导出 Benchling，用于分析流程中的取数与结果回传。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是官方/社区应用示例与 SDK 示例源码。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. 按 README 安装依赖（多为 `pip install -r requirements.txt`）。
   3. 在 Benchling 管理后台创建 API Key / 配置 App，把凭据填入本地环境变量或配置文件（凭据不要外传）。
   4. 运行示例脚本，按日志确认已连通 Benchling API。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「数据集脚本示例」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/benchling/R-Datasets-Example
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【序列片段批量建库（regexFindandCreateParts）安装教程】—— Benchling

■ 前置条件
   · 有 Benchling 帐号（云端平台，官网 https://www.benchling.com/ ）；开发类示例需 Python 环境。

■ 本扩展是什么
   借助 Benchling 接口与 Python SDK，用正则表达式批量查找被特定序列包围的 DNA 片段，把它们创建为 DNA 元件并注册，再回填到原序列上。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是官方/社区应用示例与 SDK 示例源码。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. 按 README 安装依赖（多为 `pip install -r requirements.txt`）。
   3. 在 Benchling 管理后台创建 API Key / 配置 App，把凭据填入本地环境变量或配置文件（凭据不要外传）。
   4. 运行示例脚本，按日志确认已连通 Benchling API。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「序列片段批量建库」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/acelliott16/regexFindandCreateParts
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【样本核对工具（SampleTrace）安装教程】—— Benchling

■ 前置条件
   · 有 Benchling 帐号（云端平台，官网 https://www.benchling.com/ ）；开发类示例需 Python 环境。

■ 本扩展是什么
   与 Benchling 联动的测序元数据核对工具，读取样本登记信息并解析测序运行文件，逐样本比对后生成单文件 HTML 报告，及时发现样本身份错配。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是官方/社区应用示例与 SDK 示例源码。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. 按 README 安装依赖（多为 `pip install -r requirements.txt`）。
   3. 在 Benchling 管理后台创建 API Key / 配置 App，把凭据填入本地环境变量或配置文件（凭据不要外传）。
   4. 运行示例脚本，按日志确认已连通 Benchling API。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「样本核对工具」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/xX-its-amit-Xx/SampleTrace
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。

【转录实验设计应用（screenase-benchling-app）安装教程】—— Benchling

■ 前置条件
   · 有 Benchling 帐号（云端平台，官网 https://www.benchling.com/ ）；开发类示例需 Python 环境。

■ 本扩展是什么
   把 Screenase 实验设计器封装成 Benchling 应用，内置多个 webhook 处理器与 FastAPI 服务，实现从请求创建到上机排版、提交产量与效应排序的闭环。

■ 文件说明
   · 本目录共 1 个文件：压缩包（.zip）。
   · .zip 是官方/社区应用示例与 SDK 示例源码。

■ 安装步骤
   1. 解压到英文路径目录。
   2. 按 README 安装依赖（多为 `pip install -r requirements.txt`）。
   3. 在 Benchling 管理后台创建 API Key / 配置 App，把凭据填入本地环境变量或配置文件（凭据不要外传）。
   4. 运行示例脚本，按日志确认已连通 Benchling API。

■ 验证是否装好
   · 重启软件后在插件/扩展列表里能看到「转录实验设计应用」，即为成功。
   · 若列表里没有，先看软件的日志（一般在 帮助 → 显示日志）里有没有该插件的报错。

■ 常见问题
   · 提示版本不兼容：本店提供的插件版本与软件版本有对应关系，升级软件后如报错请把软件版本发客服换包。
   · 装完没反应：确认放对了目录、且改名后没有多余的后缀（如 .txt）。
   · 与已有插件冲突：先在插件列表里停用同名插件再试。

■ 来源与版权
   https://github.com/ethanarnold/screenase-benchling-app
   开源/免费发布，仅作学习研究用途；本教程由本店整理，请勿转载。